MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_017272	C	6	6	288094	288099	0 %	0 %	0 %	100 %	384430504
7502	NC_017272	TCG	2	6	288101	288106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430504
7503	NC_017272	TGACCT	2	12	288171	288182	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384430504
7504	NC_017272	CTC	2	6	288223	288228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430504
7505	NC_017272	CTC	2	6	288348	288353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430504
7506	NC_017272	GTG	3	9	288362	288370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430504
7507	NC_017272	TGT	2	6	288441	288446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384430504
7508	NC_017272	GCGGAG	2	12	288471	288482	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384430504
7509	NC_017272	CCTGGC	2	12	288513	288524	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384430504
7510	NC_017272	AGG	2	6	288551	288556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430504
7511	NC_017272	GGCC	2	8	288564	288571	0 %	0 %	50 %	50 %	384430504
7512	NC_017272	CCA	2	6	288673	288678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430504
7513	NC_017272	TGG	2	6	288804	288809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430504
7514	NC_017272	GGGTC	2	10	288834	288843	0 %	20 %	60 %	20 %	384430504
7515	NC_017272	CGT	2	6	288852	288857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430504
7516	NC_017272	CCA	2	6	288873	288878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430504
7517	NC_017272	CCA	2	6	288924	288929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430504
7518	NC_017272	TGA	2	6	288993	288998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_017272	ACC	2	6	289222	289227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430505
7520	NC_017272	CTG	2	6	289251	289256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430505
7521	NC_017272	CCG	2	6	289313	289318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430505
7522	NC_017272	GGC	2	6	289327	289332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430505
7523	NC_017272	CCT	2	6	289384	289389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430505
7524	NC_017272	CGC	2	6	289444	289449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430506
7525	NC_017272	TGGTCC	2	12	289452	289463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430506
7526	NC_017272	CTT	2	6	289504	289509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430506
7527	NC_017272	CCT	2	6	289516	289521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430506
7528	NC_017272	G	6	6	289580	289585	0 %	0 %	100 %	0 %	384430506
7529	NC_017272	GGA	2	6	289624	289629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430506
7530	NC_017272	CGCC	2	8	289636	289643	0 %	0 %	25 %	75 %	384430506
7531	NC_017272	C	6	6	289647	289652	0 %	0 %	0 %	100 %	384430506
7532	NC_017272	GAG	2	6	289673	289678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430506
7533	NC_017272	AGG	2	6	289719	289724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430506
7534	NC_017272	CCT	2	6	289772	289777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430506
7535	NC_017272	CTT	2	6	289813	289818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430506
7536	NC_017272	GGTT	2	8	289857	289864	0 %	50 %	50 %	0 %	384430506
7537	NC_017272	CCT	2	6	289873	289878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430506
7538	NC_017272	GAGG	2	8	289924	289931	25 %	0 %	75 %	0 %	384430506
7539	NC_017272	CCCG	2	8	289979	289986	0 %	0 %	25 %	75 %	384430506
7540	NC_017272	ACC	2	6	290028	290033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430506
7541	NC_017272	GGA	3	9	290047	290055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430506
7542	NC_017272	GCG	2	6	290097	290102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430506
7543	NC_017272	CCT	2	6	290115	290120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430506
7544	NC_017272	GCTT	2	8	290166	290173	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7545	NC_017272	CGC	2	6	290209	290214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7546	NC_017272	AGG	2	6	290244	290249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430507
7547	NC_017272	CCCG	2	8	290272	290279	0 %	0 %	25 %	75 %	384430507
7548	NC_017272	TGG	2	6	290281	290286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430507
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7552	NC_017272	GCC	2	6	290419	290424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430507
7553	NC_017272	GCC	3	9	290451	290459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430507
7554	NC_017272	CGT	2	6	290533	290538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430507
7555	NC_017272	GAG	2	6	290555	290560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430507
7556	NC_017272	GGC	2	6	290599	290604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430507
7557	NC_017272	C	6	6	290623	290628	0 %	0 %	0 %	100 %	384430507
7558	NC_017272	AGA	2	6	290638	290643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430507
7559	NC_017272	C	6	6	290647	290652	0 %	0 %	0 %	100 %	384430507
7560	NC_017272	CAC	2	6	290666	290671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430507
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7563	NC_017272	C	6	6	290798	290803	0 %	0 %	0 %	100 %	384430507
7564	NC_017272	TCC	2	6	290805	290810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430507
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7570	NC_017272	GTA	2	6	290999	291004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430507
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7574	NC_017272	C	7	7	291172	291178	0 %	0 %	0 %	100 %	384430508
7575	NC_017272	GAG	2	6	291205	291210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430508
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7582	NC_017272	GGC	2	6	291443	291448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430508
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7584	NC_017272	GGC	2	6	291508	291513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430508
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7588	NC_017272	GCCCG	2	10	291663	291672	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7589	NC_017272	CG	3	6	291679	291684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7590	NC_017272	CTC	2	6	291775	291780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430509
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7596	NC_017272	C	6	6	291973	291978	0 %	0 %	0 %	100 %	384430509
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7599	NC_017272	GGC	2	6	292209	292214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430509
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7604	NC_017272	CGTGG	2	10	292420	292429	0 %	20 %	60 %	20 %	384430509
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7607	NC_017272	CCA	2	6	292536	292541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430509
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7618	NC_017272	CAC	2	6	293140	293145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430509
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7993	NC_017272	CCT	2	6	306129	306134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7994	NC_017272	CGGGGG	2	12	306209	306220	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	384430519
7995	NC_017272	G	7	7	306222	306228	0 %	0 %	100 %	0 %	384430519
7996	NC_017272	CGC	2	6	306229	306234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430519
7997	NC_017272	CCCCT	2	10	306269	306278	0 %	20 %	0 %	80 %	384430519
7998	NC_017272	GGGCC	2	10	306317	306326	0 %	0 %	60 %	40 %	384430519
7999	NC_017272	TCC	2	6	306327	306332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430519
8000	NC_017272	C	7	7	306331	306337	0 %	0 %	0 %	100 %	384430519

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