MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017272	CTC	2	6	210074	210079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430422
5502	NC_017272	CCT	2	6	210160	210165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430422
5503	NC_017272	CTT	2	6	210230	210235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430422
5504	NC_017272	ATC	2	6	210264	210269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430422
5505	NC_017272	AGG	2	6	210331	210336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_017272	GCGT	2	8	210353	210360	0 %	25 %	50 %	25 %	384430423
5507	NC_017272	GAG	2	6	210433	210438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430423
5508	NC_017272	GGT	2	6	210537	210542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430423
5509	NC_017272	GAG	2	6	210559	210564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430423
5510	NC_017272	CGG	2	6	210586	210591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430423
5511	NC_017272	CGC	2	6	210618	210623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430423
5512	NC_017272	CCT	3	9	210663	210671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430423
5513	NC_017272	G	6	6	210699	210704	0 %	0 %	100 %	0 %	384430423
5514	NC_017272	GTG	2	6	210709	210714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430423
5515	NC_017272	GCC	2	6	210727	210732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430423
5516	NC_017272	CCT	2	6	210735	210740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430423
5517	NC_017272	GGC	2	6	210747	210752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430423
5518	NC_017272	CGGG	2	8	210778	210785	0 %	0 %	75 %	25 %	384430423
5519	NC_017272	CTC	2	6	210799	210804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430423
5520	NC_017272	CCT	2	6	210816	210821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430423
5521	NC_017272	GGA	2	6	210831	210836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430423
5522	NC_017272	TGG	2	6	210866	210871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430423
5523	NC_017272	CCT	2	6	210924	210929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430423
5524	NC_017272	GGGC	2	8	210950	210957	0 %	0 %	75 %	25 %	384430423
5525	NC_017272	TGG	2	6	210968	210973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430423
5526	NC_017272	CGG	2	6	210978	210983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430423
5527	NC_017272	GC	3	6	211087	211092	0 %	0 %	50 %	50 %	384430424
5528	NC_017272	GGC	2	6	211111	211116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430424
5529	NC_017272	TGGCCC	2	12	211128	211139	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384430424
5530	NC_017272	GGC	2	6	211144	211149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430424
5531	NC_017272	G	6	6	211150	211155	0 %	0 %	100 %	0 %	384430424
5532	NC_017272	GGA	2	6	211162	211167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430424
5533	NC_017272	GGGCCT	2	12	211173	211184	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384430424
5534	NC_017272	ACCT	2	8	211208	211215	25 %	25 %	0 %	50 %	384430424
5535	NC_017272	GACCTG	2	12	211226	211237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384430424
5536	NC_017272	G	6	6	211245	211250	0 %	0 %	100 %	0 %	384430424
5537	NC_017272	GCC	2	6	211260	211265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430424
5538	NC_017272	CGC	2	6	211279	211284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430424
5539	NC_017272	GGCT	2	8	211301	211308	0 %	25 %	50 %	25 %	384430424
5540	NC_017272	GCT	2	6	211339	211344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430424
5541	NC_017272	TGGG	2	8	211379	211386	0 %	25 %	75 %	0 %	384430424
5542	NC_017272	CTC	3	9	211388	211396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430424
5543	NC_017272	CTA	2	6	211474	211479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430424
5544	NC_017272	CCT	2	6	211498	211503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430424
5545	NC_017272	GGCG	2	8	211628	211635	0 %	0 %	75 %	25 %	384430425
5546	NC_017272	CCTGGC	2	12	211643	211654	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384430425
5547	NC_017272	TCC	2	6	211684	211689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430425
5548	NC_017272	CGA	2	6	211723	211728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430425
5549	NC_017272	GGA	2	6	211811	211816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430425
5550	NC_017272	TCA	2	6	211837	211842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430425
5551	NC_017272	GGT	2	6	211868	211873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430425
5552	NC_017272	C	6	6	211906	211911	0 %	0 %	0 %	100 %	384430425
5553	NC_017272	GGC	2	6	211946	211951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430425
5554	NC_017272	GTG	2	6	211986	211991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430425
5555	NC_017272	GGT	2	6	212006	212011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430425
5556	NC_017272	CGGG	3	12	212024	212035	0 %	0 %	75 %	25 %	384430425
5557	NC_017272	CTC	3	9	212058	212066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430425
5558	NC_017272	CGG	2	6	212095	212100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430426
5559	NC_017272	AGG	2	6	212125	212130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430426
5560	NC_017272	GAG	2	6	212142	212147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430426
5561	NC_017272	C	6	6	212156	212161	0 %	0 %	0 %	100 %	384430426
5562	NC_017272	CCA	2	6	212165	212170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430426
5563	NC_017272	GGC	2	6	212193	212198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430426
5564	NC_017272	GAG	3	9	212211	212219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430426
5565	NC_017272	GGGGT	2	10	212269	212278	0 %	20 %	80 %	0 %	384430426
5566	NC_017272	CCGG	2	8	212313	212320	0 %	0 %	50 %	50 %	384430426
5567	NC_017272	GGT	2	6	212355	212360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430426
5568	NC_017272	GAG	2	6	212409	212414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430426
5569	NC_017272	CCT	2	6	212423	212428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430426
5570	NC_017272	GA	3	6	212470	212475	50 %	0 %	50 %	0 %	384430426
5571	NC_017272	AAG	2	6	212493	212498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_017272	CAC	2	6	212559	212564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5573	NC_017272	CCA	2	6	212592	212597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5574	NC_017272	GC	3	6	212609	212614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5575	NC_017272	GAG	2	6	212707	212712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_017272	GGT	2	6	212714	212719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_017272	AGT	2	6	212767	212772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_017272	CCT	2	6	212782	212787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5579	NC_017272	AGG	2	6	212809	212814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_017272	GGC	2	6	212820	212825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_017272	GGT	2	6	212942	212947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430427
5582	NC_017272	TGG	2	6	212950	212955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430427
5583	NC_017272	CAT	2	6	212999	213004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430427
5584	NC_017272	CAC	2	6	213020	213025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430427
5585	NC_017272	GAG	2	6	213039	213044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430427
5586	NC_017272	GAA	2	6	213134	213139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430427
5587	NC_017272	G	6	6	213227	213232	0 %	0 %	100 %	0 %	384430427
5588	NC_017272	CAG	2	6	213324	213329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430427
5589	NC_017272	CCG	2	6	213356	213361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430427
5590	NC_017272	CCG	2	6	213383	213388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430427
5591	NC_017272	GAG	3	9	213399	213407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430427
5592	NC_017272	AGA	2	6	213409	213414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430427
5593	NC_017272	GGT	2	6	213455	213460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430427
5594	NC_017272	GTG	2	6	213471	213476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430427
5595	NC_017272	ACC	2	6	213562	213567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430427
5596	NC_017272	GGT	2	6	213725	213730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430427
5597	NC_017272	GGT	2	6	213836	213841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430427
5598	NC_017272	AGG	2	6	213844	213849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430427
5599	NC_017272	GAG	2	6	213888	213893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430427
5600	NC_017272	CGC	2	6	213894	213899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430427
5601	NC_017272	GCA	2	6	213938	213943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430427
5602	NC_017272	CCCG	2	8	213959	213966	0 %	0 %	25 %	75 %	384430427
5603	NC_017272	AAG	2	6	214101	214106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430427
5604	NC_017272	AGC	2	6	214150	214155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430427
5605	NC_017272	TCTCCC	2	12	214159	214170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430427
5606	NC_017272	CCT	2	6	214178	214183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430427
5607	NC_017272	C	7	7	214188	214194	0 %	0 %	0 %	100 %	384430427
5608	NC_017272	AGG	3	9	214201	214209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430427
5609	NC_017272	GC	3	6	214220	214225	0 %	0 %	50 %	50 %	384430427
5610	NC_017272	GC	3	6	214241	214246	0 %	0 %	50 %	50 %	384430427
5611	NC_017272	CCG	2	6	214247	214252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430427
5612	NC_017272	CCG	2	6	214265	214270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430427
5613	NC_017272	GGAG	2	8	214279	214286	25 %	0 %	75 %	0 %	384430427
5614	NC_017272	ACG	2	6	214321	214326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430427
5615	NC_017272	CAC	3	9	214340	214348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430427
5616	NC_017272	GGGCC	2	10	214443	214452	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5617	NC_017272	GC	3	6	214525	214530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5618	NC_017272	G	6	6	214548	214553	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_017272	AGGG	2	8	214581	214588	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_017272	T	6	6	214591	214596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_017272	GAG	3	9	214597	214605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_017272	GAG	2	6	214659	214664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430428
5623	NC_017272	G	6	6	214694	214699	0 %	0 %	100 %	0 %	384430428
5624	NC_017272	GAA	2	6	214766	214771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430428
5625	NC_017272	CCG	2	6	214802	214807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430428
5626	NC_017272	TCC	2	6	214825	214830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430428
5627	NC_017272	CGG	2	6	214861	214866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430428
5628	NC_017272	CGC	2	6	214871	214876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430428
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5643	NC_017272	GAG	2	6	215739	215744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430428
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5707	NC_017272	A	6	6	217972	217977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5725	NC_017272	GA	3	6	218688	218693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5726	NC_017272	CGG	2	6	218881	218886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430431
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5730	NC_017272	GGT	2	6	219074	219079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430431
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5732	NC_017272	CCT	2	6	219236	219241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430431
5733	NC_017272	CTC	2	6	219242	219247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430431
5734	NC_017272	CGG	2	6	219270	219275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430431
5735	NC_017272	G	6	6	219405	219410	0 %	0 %	100 %	0 %	384430431
5736	NC_017272	TCT	2	6	219467	219472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430431
5737	NC_017272	TC	3	6	219476	219481	0 %	50 %	0 %	50 %	384430431
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5741	NC_017272	GCAG	2	8	219608	219615	25 %	0 %	50 %	25 %	384430431
5742	NC_017272	TCC	2	6	219622	219627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430431
5743	NC_017272	TCC	3	9	219664	219672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430431
5744	NC_017272	GGC	2	6	219695	219700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430431
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5746	NC_017272	GAG	2	6	219823	219828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430432
5747	NC_017272	GAG	2	6	219952	219957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430432
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5993	NC_017272	CTC	2	6	229625	229630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430442
5994	NC_017272	GGCG	2	8	229696	229703	0 %	0 %	75 %	25 %	384430442
5995	NC_017272	CCT	2	6	229705	229710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430442
5996	NC_017272	GCGG	2	8	229721	229728	0 %	0 %	75 %	25 %	384430442
5997	NC_017272	AGGG	2	8	229746	229753	25 %	0 %	75 %	0 %	384430442
5998	NC_017272	AGG	2	6	229972	229977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430443
5999	NC_017272	TGG	2	6	230026	230031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430443
6000	NC_017272	TCC	2	6	230101	230106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430443

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