MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017272	CCTCAC	2	12	173242	173253	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_017272	TGG	2	6	173283	173288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_017272	CAC	2	6	173296	173301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4504	NC_017272	TCC	3	9	173334	173342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_017272	GGCCT	2	10	173381	173390	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4506	NC_017272	CGG	2	6	173392	173397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_017272	CTC	3	9	173408	173416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_017272	TCC	2	6	173453	173458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430390
4509	NC_017272	G	7	7	173511	173517	0 %	0 %	100 %	0 %	384430390
4510	NC_017272	G	7	7	173527	173533	0 %	0 %	100 %	0 %	384430390
4511	NC_017272	AGG	2	6	173534	173539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430390
4512	NC_017272	GAG	2	6	173581	173586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430390
4513	NC_017272	TGC	2	6	173630	173635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430390
4514	NC_017272	AGG	2	6	173711	173716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430390
4515	NC_017272	CCA	2	6	173805	173810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430390
4516	NC_017272	GTA	2	6	173875	173880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430390
4517	NC_017272	CAC	2	6	173911	173916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430390
4518	NC_017272	GAG	2	6	173953	173958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430390
4519	NC_017272	AGG	3	9	174056	174064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430390
4520	NC_017272	CTCCA	2	10	174142	174151	20 %	20 %	0 %	60 %	384430390
4521	NC_017272	CGG	2	6	174153	174158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430390
4522	NC_017272	TGT	2	6	174210	174215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384430390
4523	NC_017272	CTT	2	6	174246	174251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430390
4524	NC_017272	AGT	2	6	174297	174302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430390
4525	NC_017272	CCG	2	6	174312	174317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430390
4526	NC_017272	GTG	2	6	174359	174364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430390
4527	NC_017272	TCC	2	6	174398	174403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430390
4528	NC_017272	CTC	2	6	174421	174426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430390
4529	NC_017272	GGC	2	6	174465	174470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430390
4530	NC_017272	GGA	2	6	174471	174476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430390
4531	NC_017272	CTC	2	6	174487	174492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430390
4532	NC_017272	GCG	2	6	174499	174504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430390
4533	NC_017272	CG	3	6	174531	174536	0 %	0 %	50 %	50 %	384430390
4534	NC_017272	CT	3	6	174619	174624	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_017272	TGG	2	6	174724	174729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430391
4536	NC_017272	GGA	2	6	174749	174754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430391
4537	NC_017272	GGC	2	6	174773	174778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430391
4538	NC_017272	GTG	3	9	174816	174824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430391
4539	NC_017272	CGG	2	6	174835	174840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430391
4540	NC_017272	AGG	2	6	174850	174855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430391
4541	NC_017272	CCT	2	6	174887	174892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430391
4542	NC_017272	GTG	2	6	174906	174911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430391
4543	NC_017272	GAA	2	6	175022	175027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430391
4544	NC_017272	CTC	2	6	175029	175034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430391
4545	NC_017272	AGG	2	6	175054	175059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430391
4546	NC_017272	TGG	2	6	175066	175071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430391
4547	NC_017272	GAG	2	6	175131	175136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430391
4548	NC_017272	GGCCC	2	10	175148	175157	0 %	0 %	40 %	60 %	384430391
4549	NC_017272	GAG	2	6	175158	175163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430391
4550	NC_017272	AGGCCA	2	12	175210	175221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430391
4551	NC_017272	GC	3	6	175223	175228	0 %	0 %	50 %	50 %	384430391
4552	NC_017272	CGC	3	9	175238	175246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430391
4553	NC_017272	CCA	2	6	175253	175258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430391
4554	NC_017272	CCT	2	6	175259	175264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430391
4555	NC_017272	TGG	2	6	175267	175272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430391
4556	NC_017272	GCG	2	6	175304	175309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430391
4557	NC_017272	CTTCC	2	10	175311	175320	0 %	40 %	0 %	60 %	384430391
4558	NC_017272	TCC	3	9	175318	175326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430391
4559	NC_017272	GAG	2	6	175341	175346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430391
4560	NC_017272	CCG	2	6	175372	175377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430391
4561	NC_017272	CACAC	2	10	175426	175435	40 %	0 %	0 %	60 %	384430391
4562	NC_017272	GTG	2	6	175584	175589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430391
4563	NC_017272	GGCCCG	2	12	175595	175606	0 %	0 %	50 %	50 %	384430391
4564	NC_017272	TCC	2	6	175633	175638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430391
4565	NC_017272	TGG	2	6	175639	175644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430391
4566	NC_017272	CCCCTG	2	12	175655	175666	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384430391
4567	NC_017272	TGCACC	2	12	175695	175706	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384430391
4568	NC_017272	CGC	2	6	175709	175714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430391
4569	NC_017272	CCT	2	6	175748	175753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430391
4570	NC_017272	TGG	3	9	175768	175776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430391
4571	NC_017272	GAG	2	6	175797	175802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430391
4572	NC_017272	CGCC	2	8	175877	175884	0 %	0 %	25 %	75 %	384430391
4573	NC_017272	CTC	2	6	175902	175907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430391
4574	NC_017272	GGGC	2	8	175911	175918	0 %	0 %	75 %	25 %	384430391
4575	NC_017272	CGCC	2	8	175931	175938	0 %	0 %	25 %	75 %	384430391
4576	NC_017272	CTC	2	6	175959	175964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430391
4577	NC_017272	AGG	2	6	175966	175971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430391
4578	NC_017272	TCC	2	6	176014	176019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430391
4579	NC_017272	CCT	2	6	176042	176047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430391
4580	NC_017272	GAG	2	6	176052	176057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430391
4581	NC_017272	AGGCG	2	10	176110	176119	20 %	0 %	60 %	20 %	384430391
4582	NC_017272	CTCCAC	2	12	176126	176137	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384430392
4583	NC_017272	GTGGA	2	10	176142	176151	20 %	20 %	60 %	0 %	384430392
4584	NC_017272	CCCA	2	8	176162	176169	25 %	0 %	0 %	75 %	384430392
4585	NC_017272	GAGGT	2	10	176187	176196	20 %	20 %	60 %	0 %	384430392
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4587	NC_017272	ACC	2	6	176250	176255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430392
4588	NC_017272	TCC	2	6	176299	176304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430392
4589	NC_017272	TCCCG	2	10	176332	176341	0 %	20 %	20 %	60 %	384430392
4590	NC_017272	GAG	2	6	176375	176380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430392
4591	NC_017272	CCA	2	6	176404	176409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430392
4592	NC_017272	GGT	2	6	176429	176434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430392
4593	NC_017272	G	7	7	176454	176460	0 %	0 %	100 %	0 %	384430392
4594	NC_017272	GAG	2	6	176462	176467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430392
4595	NC_017272	GGA	2	6	176500	176505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430392
4596	NC_017272	CGGG	2	8	176509	176516	0 %	0 %	75 %	25 %	384430392
4597	NC_017272	G	6	6	176514	176519	0 %	0 %	100 %	0 %	384430392
4598	NC_017272	GGA	2	6	176548	176553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430392
4599	NC_017272	CGAGG	2	10	176633	176642	20 %	0 %	60 %	20 %	384430392
4600	NC_017272	CCT	2	6	176656	176661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430392
4601	NC_017272	CGG	2	6	176662	176667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430392
4602	NC_017272	GGGCC	2	10	176732	176741	0 %	0 %	60 %	40 %	384430392
4603	NC_017272	GTA	2	6	176780	176785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430392
4604	NC_017272	AGA	2	6	176821	176826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430392
4605	NC_017272	GAG	2	6	176837	176842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430392
4606	NC_017272	GCGG	2	8	176855	176862	0 %	0 %	75 %	25 %	384430392
4607	NC_017272	TCA	2	6	176869	176874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430392
4608	NC_017272	TCC	2	6	176901	176906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430392
4609	NC_017272	CCA	3	9	176944	176952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430392
4610	NC_017272	G	6	6	176987	176992	0 %	0 %	100 %	0 %	384430392
4611	NC_017272	GGT	2	6	177076	177081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430392
4612	NC_017272	AGG	2	6	177090	177095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430392
4613	NC_017272	GCC	2	6	177097	177102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430392
4614	NC_017272	C	6	6	177101	177106	0 %	0 %	0 %	100 %	384430392
4615	NC_017272	GAG	2	6	177182	177187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430392
4616	NC_017272	GAG	2	6	177194	177199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430392
4617	NC_017272	GGA	2	6	177301	177306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430392
4618	NC_017272	CTC	2	6	177377	177382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430392
4619	NC_017272	CCG	2	6	177391	177396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430392
4620	NC_017272	GCG	2	6	177465	177470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430392
4621	NC_017272	GAGGT	2	10	177513	177522	20 %	20 %	60 %	0 %	384430392
4622	NC_017272	ACC	2	6	177543	177548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430392
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4624	NC_017272	CCT	2	6	177568	177573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430392
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4996	NC_017272	AGG	2	6	191586	191591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430406
4997	NC_017272	CCT	2	6	191596	191601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430406
4998	NC_017272	CCG	2	6	191602	191607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430406
4999	NC_017272	TGG	2	6	191619	191624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430406
5000	NC_017272	CGC	2	6	191644	191649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430406

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