MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017268	TCG	2	6	148331	148336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_017268	C	9	9	148355	148363	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3003	NC_017268	GTTC	2	8	148393	148400	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3004	NC_017268	CG	3	6	148402	148407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_017268	GCA	2	6	148412	148417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_017268	CG	3	6	148418	148423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_017268	CGGCTG	2	12	148603	148614	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_017268	TTC	2	6	148874	148879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_017268	CTTGC	2	10	148909	148918	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3010	NC_017268	TTC	2	6	149043	149048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_017268	GCG	2	6	149057	149062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_017268	GC	3	6	149109	149114	0 %	0 %	50 %	50 %	384421679
3013	NC_017268	TCTT	2	8	149208	149215	0 %	75 %	0 %	25 %	384421679
3014	NC_017268	TGC	2	6	149242	149247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_017268	GGT	2	6	149291	149296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017268	GCG	2	6	149451	149456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421680
3017	NC_017268	AGC	2	6	149502	149507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421680
3018	NC_017268	TG	3	6	149534	149539	0 %	50 %	50 %	0 %	384421680
3019	NC_017268	GC	3	6	149547	149552	0 %	0 %	50 %	50 %	384421680
3020	NC_017268	CTG	3	9	149562	149570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421680
3021	NC_017268	AGGC	2	8	149608	149615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3022	NC_017268	TCC	2	6	149640	149645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_017268	CCA	2	6	149665	149670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_017268	GTC	2	6	149697	149702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_017268	GTG	2	6	149716	149721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017268	GCA	3	9	149767	149775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_017268	GTTT	2	8	149896	149903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017268	TAC	2	6	150005	150010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_017268	TGT	2	6	150066	150071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017268	GT	3	6	150121	150126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017268	G	9	9	150153	150161	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017268	ACT	2	6	150246	150251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_017268	CGGA	2	8	150444	150451	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_017268	GTT	2	6	150538	150543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_017268	GGCTGG	4	24	150544	150567	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3036	NC_017268	GTAC	2	8	150589	150596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_017268	GCT	2	6	150662	150667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_017268	TCC	2	6	150696	150701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_017268	T	6	6	150769	150774	0 %	100 %	0 %	0 %	384421681
3040	NC_017268	GC	3	6	150790	150795	0 %	0 %	50 %	50 %	384421681
3041	NC_017268	GAC	2	6	150844	150849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421681
3042	NC_017268	GCA	2	6	150860	150865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421681
3043	NC_017268	GCTT	2	8	150866	150873	0 %	50 %	25 %	25 %	384421681
3044	NC_017268	CCG	2	6	150881	150886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421681
3045	NC_017268	CTG	2	6	150906	150911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421681
3046	NC_017268	GTTTG	2	10	150922	150931	0 %	60 %	40 %	0 %	384421681
3047	NC_017268	G	6	6	150950	150955	0 %	0 %	100 %	0 %	384421681
3048	NC_017268	TCC	2	6	150980	150985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421681
3049	NC_017268	CCA	2	6	151005	151010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421681
3050	NC_017268	T	7	7	151011	151017	0 %	100 %	0 %	0 %	384421681
3051	NC_017268	GCGG	2	8	151114	151121	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3052	NC_017268	GTC	2	6	151218	151223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_017268	CGGCTC	2	12	151241	151252	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_017268	T	6	6	151274	151279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017268	GC	3	6	151295	151300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_017268	GCA	3	9	151344	151352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_017268	T	6	6	151355	151360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017268	CCG	2	6	151368	151373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_017268	GAC	2	6	151400	151405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_017268	CCA	2	6	151456	151461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_017268	TCTT	2	8	151547	151554	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3062	NC_017268	GTT	2	6	151749	151754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017268	CTGCGG	4	24	151757	151780	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_017268	CG	3	6	151833	151838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_017268	AGC	2	6	151876	151881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_017268	AGC	2	6	151885	151890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_017268	CCG	2	6	151916	151921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_017268	CTG	2	6	151938	151943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_017268	TG	3	6	152008	152013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017268	CCT	2	6	152014	152019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_017268	CCA	2	6	152038	152043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_017268	CA	3	6	152099	152104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_017268	GCGG	2	8	152229	152236	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3074	NC_017268	CGGCTC	2	12	152262	152273	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_017268	AGCA	2	8	152404	152411	50 %	0 %	25 %	25 %	384421682
3076	NC_017268	TTCA	2	8	152491	152498	25 %	50 %	0 %	25 %	384421682
3077	NC_017268	TAA	2	6	152517	152522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421682
3078	NC_017268	TG	4	8	152554	152561	0 %	50 %	50 %	0 %	384421682
3079	NC_017268	CAC	2	6	152603	152608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421682
3080	NC_017268	GGTG	2	8	152748	152755	0 %	25 %	75 %	0 %	384421682
3081	NC_017268	AGT	2	6	152805	152810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421682
3082	NC_017268	AGA	2	6	152878	152883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421682
3083	NC_017268	GC	3	6	152939	152944	0 %	0 %	50 %	50 %	384421682
3084	NC_017268	GC	3	6	153054	153059	0 %	0 %	50 %	50 %	384421682
3085	NC_017268	AGC	2	6	153112	153117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421682
3086	NC_017268	TGG	2	6	153160	153165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421682
3087	NC_017268	CAT	2	6	153166	153171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421682
3088	NC_017268	CT	4	8	153240	153247	0 %	50 %	0 %	50 %	384421682
3089	NC_017268	CCT	2	6	153341	153346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421682
3090	NC_017268	TGTTT	2	10	153364	153373	0 %	80 %	20 %	0 %	384421682
3091	NC_017268	AGC	2	6	153446	153451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421682
3092	NC_017268	GTG	2	6	153512	153517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421682
3093	NC_017268	AGGA	2	8	153545	153552	50 %	0 %	50 %	0 %	384421682
3094	NC_017268	CCGGAG	2	12	153620	153631	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384421682
3095	NC_017268	CA	3	6	153709	153714	50 %	0 %	0 %	50 %	384421682
3096	NC_017268	GGAA	2	8	153768	153775	50 %	0 %	50 %	0 %	384421682
3097	NC_017268	AGA	2	6	153814	153819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421682
3098	NC_017268	CAGCTG	2	12	153844	153855	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384421682
3099	NC_017268	CGG	2	6	153884	153889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421682
3100	NC_017268	TTC	2	6	153983	153988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421682
3101	NC_017268	GAGT	2	8	154035	154042	25 %	25 %	50 %	0 %	384421682
3102	NC_017268	AGC	2	6	154060	154065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421682
3103	NC_017268	CCTG	2	8	154101	154108	0 %	25 %	25 %	50 %	384421682
3104	NC_017268	CACT	2	8	154111	154118	25 %	25 %	0 %	50 %	384421682
3105	NC_017268	CTC	2	6	154123	154128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_017268	C	9	9	154143	154151	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3107	NC_017268	TAAAAA	2	12	154175	154186	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017268	CG	3	6	154317	154322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_017268	GCG	2	6	154375	154380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421683
3110	NC_017268	TCGT	2	8	154411	154418	0 %	50 %	25 %	25 %	384421683
3111	NC_017268	GGTCT	2	10	154439	154448	0 %	40 %	40 %	20 %	384421683
3112	NC_017268	T	7	7	154496	154502	0 %	100 %	0 %	0 %	384421683
3113	NC_017268	TAC	2	6	154541	154546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421683
3114	NC_017268	CTTC	2	8	154616	154623	0 %	50 %	0 %	50 %	384421683
3115	NC_017268	TC	3	6	154679	154684	0 %	50 %	0 %	50 %	384421683
3116	NC_017268	TCG	2	6	154717	154722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421683
3117	NC_017268	GAA	2	6	154734	154739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421683
3118	NC_017268	TG	3	6	154778	154783	0 %	50 %	50 %	0 %	384421683
3119	NC_017268	GCT	2	6	154801	154806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421683
3120	NC_017268	T	6	6	154854	154859	0 %	100 %	0 %	0 %	384421683
3121	NC_017268	CGT	2	6	154904	154909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421683
3122	NC_017268	CGG	2	6	154926	154931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421683
3123	NC_017268	TTC	2	6	154938	154943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421683
3124	NC_017268	AC	4	8	154981	154988	50 %	0 %	0 %	50 %	384421683
3125	NC_017268	TGG	2	6	154994	154999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421683
3126	NC_017268	GCAG	2	8	155024	155031	25 %	0 %	50 %	25 %	384421683
3127	NC_017268	CCA	2	6	155062	155067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421683
3128	NC_017268	ACT	2	6	155076	155081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421683
3129	NC_017268	ATC	2	6	155097	155102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421683
3130	NC_017268	ATG	2	6	155123	155128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421683
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3239	NC_017268	GGTG	2	8	159739	159746	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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3245	NC_017268	GAT	2	6	160014	160019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421686
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3250	NC_017268	CTTT	2	8	160220	160227	0 %	75 %	0 %	25 %	384421686
3251	NC_017268	AGC	3	9	160275	160283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421686
3252	NC_017268	A	6	6	160364	160369	100 %	0 %	0 %	0 %	384421686
3253	NC_017268	AGGA	2	8	160378	160385	50 %	0 %	50 %	0 %	384421686
3254	NC_017268	CTT	2	6	160410	160415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421686
3255	NC_017268	AC	3	6	160431	160436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3257	NC_017268	GTA	2	6	160582	160587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421687
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