MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22502	NC_017268	CGT	2	6	1066637	1066642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422473
22503	NC_017268	TA	3	6	1066659	1066664	50 %	50 %	0 %	0 %	384422473
22504	NC_017268	ACC	2	6	1066694	1066699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422473
22505	NC_017268	GTAT	2	8	1066700	1066707	25 %	50 %	25 %	0 %	384422473
22506	NC_017268	GCG	2	6	1066739	1066744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422473
22507	NC_017268	AGA	2	6	1066802	1066807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422473
22508	NC_017268	TCT	2	6	1066813	1066818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422473
22509	NC_017268	TGT	2	6	1066826	1066831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422473
22510	NC_017268	GGTGCG	2	12	1066858	1066869	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384422473
22511	NC_017268	TG	3	6	1066883	1066888	0 %	50 %	50 %	0 %	384422473
22512	NC_017268	TCGG	2	8	1066889	1066896	0 %	25 %	50 %	25 %	384422473
22513	NC_017268	CTG	2	6	1066906	1066911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422473
22514	NC_017268	T	7	7	1066943	1066949	0 %	100 %	0 %	0 %	384422473
22515	NC_017268	CTC	2	6	1067009	1067014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422473
22516	NC_017268	TTTG	2	8	1067034	1067041	0 %	75 %	25 %	0 %	384422473
22517	NC_017268	TC	3	6	1067060	1067065	0 %	50 %	0 %	50 %	384422473
22518	NC_017268	AT	3	6	1067118	1067123	50 %	50 %	0 %	0 %	384422473
22519	NC_017268	TCG	2	6	1067202	1067207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22520	NC_017268	CG	3	6	1067232	1067237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22521	NC_017268	CAG	2	6	1067339	1067344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422474
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22523	NC_017268	GC	3	6	1067455	1067460	0 %	0 %	50 %	50 %	384422474
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22526	NC_017268	CG	3	6	1067699	1067704	0 %	0 %	50 %	50 %	384422474
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22532	NC_017268	CTTT	2	8	1068035	1068042	0 %	75 %	0 %	25 %	384422475
22533	NC_017268	GC	3	6	1068119	1068124	0 %	0 %	50 %	50 %	384422475
22534	NC_017268	CTTC	2	8	1068210	1068217	0 %	50 %	0 %	50 %	384422475
22535	NC_017268	TAG	2	6	1068250	1068255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422475
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22539	NC_017268	GTC	2	6	1068397	1068402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422475
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22542	NC_017268	GTA	2	6	1068490	1068495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422475
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22546	NC_017268	TGC	2	6	1068748	1068753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422475
22547	NC_017268	TTG	2	6	1068766	1068771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422475
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22551	NC_017268	AG	3	6	1069005	1069010	50 %	0 %	50 %	0 %	384422475
22552	NC_017268	GAT	2	6	1069047	1069052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422475
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22555	NC_017268	AGAT	2	8	1069178	1069185	50 %	25 %	25 %	0 %	384422475
22556	NC_017268	CTT	2	6	1069210	1069215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422475
22557	NC_017268	TCT	2	6	1069568	1069573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422475
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22559	NC_017268	TCT	2	6	1069619	1069624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422475
22560	NC_017268	GTAC	2	8	1069666	1069673	25 %	25 %	25 %	25 %	384422475
22561	NC_017268	CAA	2	6	1069677	1069682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422475
22562	NC_017268	AG	3	6	1069761	1069766	50 %	0 %	50 %	0 %	384422475
22563	NC_017268	AGC	2	6	1069784	1069789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422475
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22567	NC_017268	CG	4	8	1069872	1069879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22568	NC_017268	GCA	2	6	1069898	1069903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22591	NC_017268	T	6	6	1071076	1071081	0 %	100 %	0 %	0 %	384422476
22592	NC_017268	G	6	6	1071110	1071115	0 %	0 %	100 %	0 %	384422476
22593	NC_017268	T	6	6	1071126	1071131	0 %	100 %	0 %	0 %	384422476
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22601	NC_017268	GC	3	6	1071589	1071594	0 %	0 %	50 %	50 %	384422476
22602	NC_017268	CGC	3	9	1071592	1071600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422476
22603	NC_017268	CGG	2	6	1071602	1071607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422476
22604	NC_017268	CGC	2	6	1071695	1071700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422476
22605	NC_017268	CTCG	2	8	1071788	1071795	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22606	NC_017268	TACC	2	8	1071807	1071814	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22607	NC_017268	G	8	8	1071816	1071823	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22608	NC_017268	TGA	2	6	1071896	1071901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422477
22609	NC_017268	TCG	2	6	1072070	1072075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422477
22610	NC_017268	CGT	2	6	1072115	1072120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422477
22611	NC_017268	CT	3	6	1072132	1072137	0 %	50 %	0 %	50 %	384422477
22612	NC_017268	GTC	2	6	1072198	1072203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422477
22613	NC_017268	GTG	2	6	1072211	1072216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422477
22614	NC_017268	TGC	2	6	1072221	1072226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422477
22615	NC_017268	AGG	2	6	1072296	1072301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422477
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