MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_017268	TAA	2	6	1019903	1019908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422424
21502	NC_017268	GC	3	6	1019968	1019973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21503	NC_017268	AGC	2	6	1020006	1020011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422425
21504	NC_017268	CAAC	2	8	1020076	1020083	50 %	0 %	0 %	50 %	384422425
21505	NC_017268	CTAC	2	8	1020103	1020110	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21506	NC_017268	GCC	2	6	1020158	1020163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422426
21507	NC_017268	CGTG	2	8	1020180	1020187	0 %	25 %	50 %	25 %	384422426
21508	NC_017268	TG	4	8	1020186	1020193	0 %	50 %	50 %	0 %	384422426
21509	NC_017268	TGCG	2	8	1020225	1020232	0 %	25 %	50 %	25 %	384422426
21510	NC_017268	GATT	2	8	1020263	1020270	25 %	50 %	25 %	0 %	384422426
21511	NC_017268	AC	3	6	1020289	1020294	50 %	0 %	0 %	50 %	384422426
21512	NC_017268	TAC	2	6	1020329	1020334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422426
21513	NC_017268	CGT	2	6	1020526	1020531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422426
21514	NC_017268	ACA	2	6	1020548	1020553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422426
21515	NC_017268	AAG	2	6	1020579	1020584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422426
21516	NC_017268	ACC	2	6	1020613	1020618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422426
21517	NC_017268	CAA	2	6	1020660	1020665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422426
21518	NC_017268	CCA	2	6	1020786	1020791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422427
21519	NC_017268	GCAC	2	8	1020849	1020856	25 %	0 %	25 %	50 %	384422427
21520	NC_017268	CATAG	2	10	1020884	1020893	40 %	20 %	20 %	20 %	384422427
21521	NC_017268	GGA	2	6	1020896	1020901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422427
21522	NC_017268	A	6	6	1020901	1020906	100 %	0 %	0 %	0 %	384422427
21523	NC_017268	CG	3	6	1020984	1020989	0 %	0 %	50 %	50 %	384422427
21524	NC_017268	TGC	2	6	1021016	1021021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422427
21525	NC_017268	TCT	2	6	1021083	1021088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422427
21526	NC_017268	CCTG	2	8	1021119	1021126	0 %	25 %	25 %	50 %	384422427
21527	NC_017268	ACC	2	6	1021208	1021213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422427
21528	NC_017268	CCA	2	6	1021324	1021329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422427
21529	NC_017268	CG	4	8	1021332	1021339	0 %	0 %	50 %	50 %	384422427
21530	NC_017268	T	6	6	1021401	1021406	0 %	100 %	0 %	0 %	384422427
21531	NC_017268	CTG	2	6	1021427	1021432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422427
21532	NC_017268	AGGA	2	8	1021435	1021442	50 %	0 %	50 %	0 %	384422427
21533	NC_017268	GA	3	6	1021441	1021446	50 %	0 %	50 %	0 %	384422427
21534	NC_017268	GA	3	6	1021499	1021504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21535	NC_017268	AC	3	6	1021511	1021516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21536	NC_017268	CG	3	6	1021527	1021532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21537	NC_017268	TTCA	2	8	1021572	1021579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21538	NC_017268	CTC	2	6	1021604	1021609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21539	NC_017268	GC	3	6	1021628	1021633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21540	NC_017268	ACGG	2	8	1021646	1021653	25 %	0 %	50 %	25 %	384422428
21541	NC_017268	CTTCT	2	10	1021692	1021701	0 %	60 %	0 %	40 %	384422428
21542	NC_017268	GC	3	6	1021702	1021707	0 %	0 %	50 %	50 %	384422428
21543	NC_017268	AGC	2	6	1021711	1021716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422428
21544	NC_017268	GCTC	2	8	1021723	1021730	0 %	25 %	25 %	50 %	384422428
21545	NC_017268	CTT	2	6	1021763	1021768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422428
21546	NC_017268	T	6	6	1021825	1021830	0 %	100 %	0 %	0 %	384422428
21547	NC_017268	CAT	2	6	1021970	1021975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422428
21548	NC_017268	CT	3	6	1021986	1021991	0 %	50 %	0 %	50 %	384422428
21549	NC_017268	CGC	2	6	1022103	1022108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422428
21550	NC_017268	ACC	2	6	1022154	1022159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422428
21551	NC_017268	ACC	2	6	1022232	1022237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422428
21552	NC_017268	GGT	2	6	1022297	1022302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422428
21553	NC_017268	GA	3	6	1022307	1022312	50 %	0 %	50 %	0 %	384422428
21554	NC_017268	GCT	2	6	1022381	1022386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422428
21555	NC_017268	CTG	2	6	1022409	1022414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422428
21556	NC_017268	A	6	6	1022420	1022425	100 %	0 %	0 %	0 %	384422428
21557	NC_017268	GCC	2	6	1022443	1022448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422428
21558	NC_017268	CTG	2	6	1022534	1022539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422428
21559	NC_017268	CGT	2	6	1022589	1022594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422428
21560	NC_017268	AT	3	6	1022622	1022627	50 %	50 %	0 %	0 %	384422428
21561	NC_017268	GAA	2	6	1022629	1022634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422428
21562	NC_017268	CAA	2	6	1022669	1022674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422428
21563	NC_017268	TCA	2	6	1022681	1022686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422428
21564	NC_017268	GGCA	2	8	1022717	1022724	25 %	0 %	50 %	25 %	384422428
21565	NC_017268	CTT	2	6	1022784	1022789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422428
21566	NC_017268	AAG	2	6	1022815	1022820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422428
21567	NC_017268	T	6	6	1022899	1022904	0 %	100 %	0 %	0 %	384422428
21568	NC_017268	TGC	2	6	1022914	1022919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422428
21569	NC_017268	AC	3	6	1023078	1023083	50 %	0 %	0 %	50 %	384422428
21570	NC_017268	GAC	2	6	1023290	1023295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422428
21571	NC_017268	CCA	2	6	1023329	1023334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422428
21572	NC_017268	AGCG	2	8	1023345	1023352	25 %	0 %	50 %	25 %	384422428
21573	NC_017268	GTG	2	6	1023364	1023369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422428
21574	NC_017268	A	6	6	1023475	1023480	100 %	0 %	0 %	0 %	384422428
21575	NC_017268	CAC	2	6	1023492	1023497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422428
21576	NC_017268	CCT	2	6	1023563	1023568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422428
21577	NC_017268	TCT	2	6	1023752	1023757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422428
21578	NC_017268	ACC	2	6	1023789	1023794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422428
21579	NC_017268	CTT	2	6	1023798	1023803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422428
21580	NC_017268	TTA	2	6	1023832	1023837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422428
21581	NC_017268	AAT	2	6	1023852	1023857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422428
21582	NC_017268	AC	3	6	1023921	1023926	50 %	0 %	0 %	50 %	384422428
21583	NC_017268	ATC	2	6	1023933	1023938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422428
21584	NC_017268	GCT	2	6	1023966	1023971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422428
21585	NC_017268	CAT	2	6	1023980	1023985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422428
21586	NC_017268	ACCG	2	8	1023993	1024000	25 %	0 %	25 %	50 %	384422428
21587	NC_017268	TCT	2	6	1024013	1024018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422428
21588	NC_017268	ACC	2	6	1024089	1024094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422428
21589	NC_017268	CTT	2	6	1024125	1024130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422428
21590	NC_017268	AG	3	6	1024172	1024177	50 %	0 %	50 %	0 %	384422428
21591	NC_017268	TCGA	2	8	1024206	1024213	25 %	25 %	25 %	25 %	384422428
21592	NC_017268	TCC	2	6	1024308	1024313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422428
21593	NC_017268	GTA	2	6	1024401	1024406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422428
21594	NC_017268	CTGTG	2	10	1024533	1024542	0 %	40 %	40 %	20 %	384422428
21595	NC_017268	AGTC	2	8	1024566	1024573	25 %	25 %	25 %	25 %	384422428
21596	NC_017268	TCG	3	9	1024600	1024608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422428
21597	NC_017268	CTT	2	6	1024637	1024642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422428
21598	NC_017268	A	7	7	1024680	1024686	100 %	0 %	0 %	0 %	384422428
21599	NC_017268	CG	3	6	1024700	1024705	0 %	0 %	50 %	50 %	384422428
21600	NC_017268	GCA	2	6	1024717	1024722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422428
21601	NC_017268	CCT	2	6	1024748	1024753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422428
21602	NC_017268	GGC	2	6	1024790	1024795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422428
21603	NC_017268	TGA	2	6	1024810	1024815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422428
21604	NC_017268	GCA	2	6	1024855	1024860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422428
21605	NC_017268	AGC	2	6	1024918	1024923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422428
21606	NC_017268	AGA	2	6	1024947	1024952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422428
21607	NC_017268	CGT	2	6	1024962	1024967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422428
21608	NC_017268	GCCT	2	8	1024995	1025002	0 %	25 %	25 %	50 %	384422428
21609	NC_017268	GGAG	2	8	1025094	1025101	25 %	0 %	75 %	0 %	384422428
21610	NC_017268	CCAT	2	8	1025164	1025171	25 %	25 %	0 %	50 %	384422428
21611	NC_017268	TTC	2	6	1025182	1025187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422428
21612	NC_017268	CT	4	8	1025205	1025212	0 %	50 %	0 %	50 %	384422429
21613	NC_017268	TAG	2	6	1025285	1025290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422429
21614	NC_017268	T	7	7	1025335	1025341	0 %	100 %	0 %	0 %	384422429
21615	NC_017268	A	6	6	1025343	1025348	100 %	0 %	0 %	0 %	384422429
21616	NC_017268	A	7	7	1025373	1025379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21617	NC_017268	CGA	2	6	1025445	1025450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422430
21618	NC_017268	CCG	2	6	1025473	1025478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422430
21619	NC_017268	CG	4	8	1025600	1025607	0 %	0 %	50 %	50 %	384422430
21620	NC_017268	A	6	6	1025713	1025718	100 %	0 %	0 %	0 %	384422430
21621	NC_017268	CG	4	8	1025829	1025836	0 %	0 %	50 %	50 %	384422430
21622	NC_017268	CA	3	6	1025919	1025924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21623	NC_017268	CCT	2	6	1025953	1025958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21979	NC_017268	GCA	2	6	1042630	1042635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422448
21980	NC_017268	TGC	2	6	1042639	1042644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422448
21981	NC_017268	GGAA	2	8	1042710	1042717	50 %	0 %	50 %	0 %	384422448
21982	NC_017268	CTG	2	6	1042786	1042791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422449
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21997	NC_017268	TCT	2	6	1043607	1043612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21998	NC_017268	ACT	2	6	1043638	1043643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422450
21999	NC_017268	GCAC	2	8	1043646	1043653	25 %	0 %	25 %	50 %	384422450
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