MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

< Previous12...36373839404142434445464748Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_017268	ACA	2	6	902093	902098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422324
19003	NC_017268	GACAC	2	10	902109	902118	40 %	0 %	20 %	40 %	384422324
19004	NC_017268	ACT	2	6	902185	902190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422325
19005	NC_017268	CAC	2	6	902213	902218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422325
19006	NC_017268	T	6	6	902222	902227	0 %	100 %	0 %	0 %	384422325
19007	NC_017268	CG	3	6	902231	902236	0 %	0 %	50 %	50 %	384422325
19008	NC_017268	CCGTC	2	10	902245	902254	0 %	20 %	20 %	60 %	384422325
19009	NC_017268	CTC	2	6	902320	902325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422325
19010	NC_017268	GTA	2	6	902358	902363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422325
19011	NC_017268	ACAA	2	8	902379	902386	75 %	0 %	0 %	25 %	384422325
19012	NC_017268	CCG	2	6	902463	902468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422325
19013	NC_017268	CG	4	8	902474	902481	0 %	0 %	50 %	50 %	384422325
19014	NC_017268	AATT	2	8	902560	902567	50 %	50 %	0 %	0 %	384422325
19015	NC_017268	CGC	2	6	902628	902633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422325
19016	NC_017268	AAG	2	6	902700	902705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422325
19017	NC_017268	T	6	6	902731	902736	0 %	100 %	0 %	0 %	384422325
19018	NC_017268	CAA	2	6	902818	902823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422325
19019	NC_017268	ATC	2	6	902837	902842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422325
19020	NC_017268	GCC	2	6	902843	902848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422325
19021	NC_017268	A	6	6	902886	902891	100 %	0 %	0 %	0 %	384422325
19022	NC_017268	GAAAG	2	10	902926	902935	60 %	0 %	40 %	0 %	384422325
19023	NC_017268	CCAA	2	8	903037	903044	50 %	0 %	0 %	50 %	384422325
19024	NC_017268	ATT	2	6	903050	903055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422325
19025	NC_017268	GAAA	2	8	903084	903091	75 %	0 %	25 %	0 %	384422325
19026	NC_017268	CG	3	6	903189	903194	0 %	0 %	50 %	50 %	384422325
19027	NC_017268	CA	3	6	903235	903240	50 %	0 %	0 %	50 %	384422325
19028	NC_017268	ACT	2	6	903284	903289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422325
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19032	NC_017268	TGC	2	6	903667	903672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422326
19033	NC_017268	CCA	2	6	903723	903728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422326
19034	NC_017268	GTT	2	6	903787	903792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422326
19035	NC_017268	T	6	6	903851	903856	0 %	100 %	0 %	0 %	384422326
19036	NC_017268	GCG	2	6	904062	904067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422326
19037	NC_017268	CG	3	6	904083	904088	0 %	0 %	50 %	50 %	384422326
19038	NC_017268	CCT	2	6	904100	904105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422326
19039	NC_017268	GC	3	6	904109	904114	0 %	0 %	50 %	50 %	384422326
19040	NC_017268	CGC	2	6	904117	904122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422326
19041	NC_017268	ACTG	2	8	904127	904134	25 %	25 %	25 %	25 %	384422326
19042	NC_017268	CATA	2	8	904173	904180	50 %	25 %	0 %	25 %	384422326
19043	NC_017268	CTG	2	6	904183	904188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422326
19044	NC_017268	CA	3	6	904459	904464	50 %	0 %	0 %	50 %	384422326
19045	NC_017268	CCTG	2	8	904520	904527	0 %	25 %	25 %	50 %	384422326
19046	NC_017268	GCA	2	6	904533	904538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422326
19047	NC_017268	GCG	2	6	904683	904688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422326
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19049	NC_017268	AATCC	2	10	904732	904741	40 %	20 %	0 %	40 %	384422326
19050	NC_017268	TCA	2	6	904824	904829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422326
19051	NC_017268	GCA	2	6	904872	904877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422326
19052	NC_017268	ATC	2	6	904904	904909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422326
19053	NC_017268	CAC	2	6	904990	904995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422326
19054	NC_017268	GAC	2	6	905023	905028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422326
19055	NC_017268	CG	3	6	905049	905054	0 %	0 %	50 %	50 %	384422326
19056	NC_017268	GCG	2	6	905070	905075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422326
19057	NC_017268	TCT	2	6	905090	905095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422326
19058	NC_017268	GAT	2	6	905142	905147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422326
19059	NC_017268	GCG	2	6	905169	905174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422326
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19062	NC_017268	CCAA	2	8	905330	905337	50 %	0 %	0 %	50 %	384422326
19063	NC_017268	CACG	2	8	905394	905401	25 %	0 %	25 %	50 %	384422326
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19081	NC_017268	GAG	2	6	906228	906233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422326
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19089	NC_017268	CTG	3	9	906528	906536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422327
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19093	NC_017268	GTA	2	6	906635	906640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422327
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19102	NC_017268	GCAC	2	8	907114	907121	25 %	0 %	25 %	50 %	384422327
19103	NC_017268	A	6	6	907144	907149	100 %	0 %	0 %	0 %	384422327
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19106	NC_017268	GCG	2	6	907261	907266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422327
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19109	NC_017268	TCC	2	6	907393	907398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422328
19110	NC_017268	ACC	2	6	907419	907424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19111	NC_017268	AGA	2	6	907454	907459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19112	NC_017268	TGC	2	6	907471	907476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422329
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19116	NC_017268	TGCG	2	8	907675	907682	0 %	25 %	50 %	25 %	384422329
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19122	NC_017268	GAA	2	6	908061	908066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422329
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19364	NC_017268	TTACC	2	10	920874	920883	20 %	40 %	0 %	40 %	384422341
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19368	NC_017268	GACC	2	8	921030	921037	25 %	0 %	25 %	50 %	384422342
19369	NC_017268	TGC	2	6	921044	921049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422342
19370	NC_017268	CA	3	6	921070	921075	50 %	0 %	0 %	50 %	384422342
19371	NC_017268	CCT	2	6	921247	921252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422342
19372	NC_017268	CGG	2	6	921344	921349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422342
19373	NC_017268	CTA	2	6	921370	921375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422342
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19375	NC_017268	CTG	2	6	921434	921439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422342
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19377	NC_017268	TCC	2	6	921518	921523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422342
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19379	NC_017268	ATGTC	2	10	921589	921598	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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19381	NC_017268	TCA	2	6	921738	921743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422343
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19445	NC_017268	GCTC	2	8	924728	924735	0 %	25 %	25 %	50 %	384422344
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19476	NC_017268	TCTT	2	8	926243	926250	0 %	75 %	0 %	25 %	384422346
19477	NC_017268	ATC	2	6	926268	926273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422346
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19481	NC_017268	GGTT	2	8	926420	926427	0 %	50 %	50 %	0 %	384422346
19482	NC_017268	TGC	2	6	926600	926605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422346
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19485	NC_017268	ATCA	2	8	926817	926824	50 %	25 %	0 %	25 %	384422346
19486	NC_017268	GCA	2	6	926845	926850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422346
19487	NC_017268	TGC	2	6	926887	926892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422346
19488	NC_017268	ATTAT	2	10	926908	926917	40 %	60 %	0 %	0 %	384422346
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19490	NC_017268	GA	3	6	927026	927031	50 %	0 %	50 %	0 %	384422346
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