MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_017268	CTG	2	6	829870	829875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422259
17502	NC_017268	TG	3	6	829874	829879	0 %	50 %	50 %	0 %	384422259
17503	NC_017268	CG	3	6	829893	829898	0 %	0 %	50 %	50 %	384422259
17504	NC_017268	ATC	2	6	829982	829987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422259
17505	NC_017268	AGC	2	6	830078	830083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422259
17506	NC_017268	CAA	2	6	830098	830103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422259
17507	NC_017268	CTG	2	6	830104	830109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422259
17508	NC_017268	AAT	2	6	830179	830184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422259
17509	NC_017268	AAT	2	6	830257	830262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422259
17510	NC_017268	CTT	2	6	830271	830276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422259
17511	NC_017268	T	7	7	830292	830298	0 %	100 %	0 %	0 %	384422259
17512	NC_017268	CAC	2	6	830395	830400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422259
17513	NC_017268	GC	3	6	830437	830442	0 %	0 %	50 %	50 %	384422259
17514	NC_017268	CT	3	6	830506	830511	0 %	50 %	0 %	50 %	384422259
17515	NC_017268	AGC	2	6	830602	830607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422259
17516	NC_017268	GGT	2	6	830623	830628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422259
17517	NC_017268	CCAT	2	8	830639	830646	25 %	25 %	0 %	50 %	384422259
17518	NC_017268	GGC	2	6	830706	830711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422259
17519	NC_017268	AAT	2	6	830743	830748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422259
17520	NC_017268	A	6	6	830845	830850	100 %	0 %	0 %	0 %	384422259
17521	NC_017268	GCAA	2	8	830882	830889	50 %	0 %	25 %	25 %	384422259
17522	NC_017268	GACC	2	8	830910	830917	25 %	0 %	25 %	50 %	384422259
17523	NC_017268	C	6	6	830941	830946	0 %	0 %	0 %	100 %	384422259
17524	NC_017268	ACT	2	6	830984	830989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422259
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17526	NC_017268	GTG	2	6	831041	831046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422259
17527	NC_017268	CTT	2	6	831054	831059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422259
17528	NC_017268	CCG	2	6	831063	831068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422259
17529	NC_017268	GC	3	6	831073	831078	0 %	0 %	50 %	50 %	384422259
17530	NC_017268	A	6	6	831154	831159	100 %	0 %	0 %	0 %	384422259
17531	NC_017268	AGC	2	6	831167	831172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422259
17532	NC_017268	CG	3	6	831213	831218	0 %	0 %	50 %	50 %	384422259
17533	NC_017268	ACC	2	6	831233	831238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422259
17534	NC_017268	TAGG	2	8	831293	831300	25 %	25 %	50 %	0 %	384422259
17535	NC_017268	AG	3	6	831313	831318	50 %	0 %	50 %	0 %	384422259
17536	NC_017268	GC	3	6	831349	831354	0 %	0 %	50 %	50 %	384422259
17537	NC_017268	ACA	2	6	831386	831391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422259
17538	NC_017268	GAT	2	6	831442	831447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422259
17539	NC_017268	AGCA	2	8	831484	831491	50 %	0 %	25 %	25 %	384422259
17540	NC_017268	CGAG	2	8	831513	831520	25 %	0 %	50 %	25 %	384422259
17541	NC_017268	GAC	2	6	831560	831565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422259
17542	NC_017268	G	6	6	831585	831590	0 %	0 %	100 %	0 %	384422259
17543	NC_017268	A	6	6	831598	831603	100 %	0 %	0 %	0 %	384422259
17544	NC_017268	GAA	2	6	831617	831622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422259
17545	NC_017268	GC	3	6	831677	831682	0 %	0 %	50 %	50 %	384422260
17546	NC_017268	AAG	2	6	831709	831714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422260
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17548	NC_017268	TGC	2	6	831787	831792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422260
17549	NC_017268	A	7	7	831793	831799	100 %	0 %	0 %	0 %	384422260
17550	NC_017268	CG	4	8	831804	831811	0 %	0 %	50 %	50 %	384422260
17551	NC_017268	GC	3	6	831830	831835	0 %	0 %	50 %	50 %	384422260
17552	NC_017268	ACCT	2	8	831861	831868	25 %	25 %	0 %	50 %	384422261
17553	NC_017268	CGC	2	6	831906	831911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422261
17554	NC_017268	GC	3	6	831994	831999	0 %	0 %	50 %	50 %	384422261
17555	NC_017268	GCAC	2	8	832027	832034	25 %	0 %	25 %	50 %	384422261
17556	NC_017268	CGA	2	6	832089	832094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422261
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17559	NC_017268	CTCC	2	8	832168	832175	0 %	25 %	0 %	75 %	384422261
17560	NC_017268	GCCC	2	8	832181	832188	0 %	0 %	25 %	75 %	384422261
17561	NC_017268	TTC	3	9	832203	832211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422261
17562	NC_017268	GCT	2	6	832293	832298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422261
17563	NC_017268	GC	4	8	832308	832315	0 %	0 %	50 %	50 %	384422261
17564	NC_017268	CT	3	6	832442	832447	0 %	50 %	0 %	50 %	384422261
17565	NC_017268	GCA	2	6	832461	832466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422261
17566	NC_017268	GC	3	6	832470	832475	0 %	0 %	50 %	50 %	384422261
17567	NC_017268	TCAT	2	8	832499	832506	25 %	50 %	0 %	25 %	384422261
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17570	NC_017268	GATT	2	8	832560	832567	25 %	50 %	25 %	0 %	384422261
17571	NC_017268	CTCA	2	8	832665	832672	25 %	25 %	0 %	50 %	384422261
17572	NC_017268	GCG	2	6	832682	832687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422261
17573	NC_017268	TCT	2	6	832705	832710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422261
17574	NC_017268	AGG	2	6	832720	832725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422261
17575	NC_017268	GC	3	6	832783	832788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17576	NC_017268	GGCG	2	8	832819	832826	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17577	NC_017268	CTG	2	6	832869	832874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17578	NC_017268	GC	3	6	832916	832921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17579	NC_017268	GAA	2	6	832933	832938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17580	NC_017268	GC	3	6	832988	832993	0 %	0 %	50 %	50 %	384422262
17581	NC_017268	CCAT	2	8	833057	833064	25 %	25 %	0 %	50 %	384422262
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17585	NC_017268	CCAGTC	2	12	833286	833297	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384422262
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17588	NC_017268	CGTG	2	8	833529	833536	0 %	25 %	50 %	25 %	384422262
17589	NC_017268	GCG	2	6	833599	833604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422262
17590	NC_017268	T	6	6	833714	833719	0 %	100 %	0 %	0 %	384422262
17591	NC_017268	TAC	2	6	833773	833778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422262
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17593	NC_017268	A	6	6	833947	833952	100 %	0 %	0 %	0 %	384422262
17594	NC_017268	CG	4	8	833974	833981	0 %	0 %	50 %	50 %	384422262
17595	NC_017268	TGTT	2	8	834140	834147	0 %	75 %	25 %	0 %	384422262
17596	NC_017268	ATC	2	6	834283	834288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422262
17597	NC_017268	GC	4	8	834400	834407	0 %	0 %	50 %	50 %	384422262
17598	NC_017268	CGG	2	6	834438	834443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422262
17599	NC_017268	ATCAA	2	10	834512	834521	60 %	20 %	0 %	20 %	384422262
17600	NC_017268	GAG	2	6	834524	834529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422262
17601	NC_017268	AAAG	2	8	834582	834589	75 %	0 %	25 %	0 %	384422262
17602	NC_017268	CTC	2	6	834660	834665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422262
17603	NC_017268	GGC	2	6	834681	834686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422262
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17605	NC_017268	TTAA	2	8	834799	834806	50 %	50 %	0 %	0 %	384422262
17606	NC_017268	GCG	2	6	834810	834815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422262
17607	NC_017268	TTC	2	6	834912	834917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422262
17608	NC_017268	CA	3	6	834918	834923	50 %	0 %	0 %	50 %	384422262
17609	NC_017268	GGC	2	6	835049	835054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17610	NC_017268	CTC	2	6	835130	835135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17611	NC_017268	GAG	2	6	835145	835150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17612	NC_017268	CAT	2	6	835170	835175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422263
17613	NC_017268	AGG	2	6	835253	835258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422263
17614	NC_017268	AAG	2	6	835267	835272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422263
17615	NC_017268	AGC	2	6	835280	835285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422263
17616	NC_017268	GC	3	6	835343	835348	0 %	0 %	50 %	50 %	384422263
17617	NC_017268	ACG	2	6	835556	835561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422263
17618	NC_017268	GAA	2	6	835582	835587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422263
17619	NC_017268	GAA	2	6	835593	835598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422263
17620	NC_017268	GC	3	6	835625	835630	0 %	0 %	50 %	50 %	384422263
17621	NC_017268	TAC	2	6	835700	835705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422263
17622	NC_017268	TGC	2	6	835728	835733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422263
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