MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_017268	GC	4	8	805389	805396	0 %	0 %	50 %	50 %	384422234
17003	NC_017268	CA	3	6	805399	805404	50 %	0 %	0 %	50 %	384422234
17004	NC_017268	AGC	2	6	805424	805429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422234
17005	NC_017268	CCT	2	6	805449	805454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422235
17006	NC_017268	TCA	2	6	805523	805528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422235
17007	NC_017268	CCA	2	6	805575	805580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422235
17008	NC_017268	CGA	2	6	805611	805616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422235
17009	NC_017268	CGT	2	6	805665	805670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422235
17010	NC_017268	CGT	2	6	805696	805701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422235
17011	NC_017268	GC	3	6	805702	805707	0 %	0 %	50 %	50 %	384422235
17012	NC_017268	AC	3	6	805749	805754	50 %	0 %	0 %	50 %	384422235
17013	NC_017268	T	6	6	805937	805942	0 %	100 %	0 %	0 %	384422235
17014	NC_017268	TGAA	2	8	805999	806006	50 %	25 %	25 %	0 %	384422235
17015	NC_017268	A	6	6	806008	806013	100 %	0 %	0 %	0 %	384422235
17016	NC_017268	CAA	2	6	806038	806043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422235
17017	NC_017268	TG	3	6	806182	806187	0 %	50 %	50 %	0 %	384422235
17018	NC_017268	AG	3	6	806224	806229	50 %	0 %	50 %	0 %	384422235
17019	NC_017268	CTC	2	6	806320	806325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422235
17020	NC_017268	CGCT	2	8	806333	806340	0 %	25 %	25 %	50 %	384422235
17021	NC_017268	CG	3	6	806419	806424	0 %	0 %	50 %	50 %	384422235
17022	NC_017268	ATA	2	6	806437	806442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422235
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17026	NC_017268	A	8	8	806584	806591	100 %	0 %	0 %	0 %	384422235
17027	NC_017268	GAG	2	6	806593	806598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422235
17028	NC_017268	A	7	7	806600	806606	100 %	0 %	0 %	0 %	384422235
17029	NC_017268	TCG	2	6	806656	806661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17030	NC_017268	AC	4	8	806675	806682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17031	NC_017268	CA	3	6	806796	806801	50 %	0 %	0 %	50 %	384422236
17032	NC_017268	CACT	2	8	806809	806816	25 %	25 %	0 %	50 %	384422236
17033	NC_017268	GCA	2	6	806823	806828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422236
17034	NC_017268	TAACGT	2	12	806837	806848	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384422236
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17038	NC_017268	AC	4	8	807010	807017	50 %	0 %	0 %	50 %	384422236
17039	NC_017268	GC	3	6	807024	807029	0 %	0 %	50 %	50 %	384422236
17040	NC_017268	CGCA	2	8	807082	807089	25 %	0 %	25 %	50 %	384422236
17041	NC_017268	GCA	3	9	807087	807095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422236
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17046	NC_017268	GAAA	3	12	807344	807355	75 %	0 %	25 %	0 %	384422236
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17051	NC_017268	ATA	2	6	807430	807435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422237
17052	NC_017268	CCG	2	6	807533	807538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422237
17053	NC_017268	GGGAA	2	10	807547	807556	40 %	0 %	60 %	0 %	384422237
17054	NC_017268	C	6	6	807591	807596	0 %	0 %	0 %	100 %	384422237
17055	NC_017268	GC	3	6	807615	807620	0 %	0 %	50 %	50 %	384422237
17056	NC_017268	GT	3	6	807639	807644	0 %	50 %	50 %	0 %	384422237
17057	NC_017268	GC	3	6	807681	807686	0 %	0 %	50 %	50 %	384422237
17058	NC_017268	TGC	2	6	807751	807756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422237
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17061	NC_017268	ATC	2	6	808064	808069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422238
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17063	NC_017268	CA	3	6	808131	808136	50 %	0 %	0 %	50 %	384422238
17064	NC_017268	AACGC	2	10	808141	808150	40 %	0 %	20 %	40 %	384422238
17065	NC_017268	AG	3	6	808166	808171	50 %	0 %	50 %	0 %	384422238
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17069	NC_017268	GCAAA	2	10	808361	808370	60 %	0 %	20 %	20 %	384422238
17070	NC_017268	GTAT	2	8	808373	808380	25 %	50 %	25 %	0 %	384422238
17071	NC_017268	GCA	2	6	808537	808542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422238
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17073	NC_017268	CG	3	6	808593	808598	0 %	0 %	50 %	50 %	384422238
17074	NC_017268	A	7	7	808604	808610	100 %	0 %	0 %	0 %	384422238
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17089	NC_017268	AGG	2	6	809235	809240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17096	NC_017268	CT	3	6	809512	809517	0 %	50 %	0 %	50 %	384422239
17097	NC_017268	TAC	2	6	809527	809532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422239
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17099	NC_017268	CA	3	6	809563	809568	50 %	0 %	0 %	50 %	384422240
17100	NC_017268	CGCA	2	8	809580	809587	25 %	0 %	25 %	50 %	384422240
17101	NC_017268	ACGT	2	8	809620	809627	25 %	25 %	25 %	25 %	384422240
17102	NC_017268	AG	3	6	809662	809667	50 %	0 %	50 %	0 %	384422240
17103	NC_017268	C	7	7	809687	809693	0 %	0 %	0 %	100 %	384422240
17104	NC_017268	GA	3	6	809703	809708	50 %	0 %	50 %	0 %	384422240
17105	NC_017268	CCG	2	6	809719	809724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422240
17106	NC_017268	CA	4	8	809791	809798	50 %	0 %	0 %	50 %	384422240
17107	NC_017268	GCA	2	6	809823	809828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422240
17108	NC_017268	GGT	2	6	809959	809964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422241
17109	NC_017268	CTT	2	6	809969	809974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422241
17110	NC_017268	CAC	2	6	810023	810028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422241
17111	NC_017268	CG	3	6	810029	810034	0 %	0 %	50 %	50 %	384422241
17112	NC_017268	CCA	2	6	810084	810089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422241
17113	NC_017268	ATC	2	6	810090	810095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422241
17114	NC_017268	CCCG	2	8	810119	810126	0 %	0 %	25 %	75 %	384422241
17115	NC_017268	TAT	2	6	810142	810147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422241
17116	NC_017268	TAC	3	9	810157	810165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422241
17117	NC_017268	A	6	6	810224	810229	100 %	0 %	0 %	0 %	384422241
17118	NC_017268	ACGCAG	2	12	810251	810262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17119	NC_017268	ACGA	2	8	810309	810316	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17120	NC_017268	GC	3	6	810328	810333	0 %	0 %	50 %	50 %	384422242
17121	NC_017268	CCTT	2	8	810382	810389	0 %	50 %	0 %	50 %	384422242
17122	NC_017268	CA	3	6	810521	810526	50 %	0 %	0 %	50 %	384422242
17123	NC_017268	CG	3	6	810593	810598	0 %	0 %	50 %	50 %	384422242
17124	NC_017268	GC	3	6	810738	810743	0 %	0 %	50 %	50 %	384422242
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17227	NC_017268	T	6	6	816304	816309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17229	NC_017268	TGCA	2	8	816422	816429	25 %	25 %	25 %	25 %	384422245
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17242	NC_017268	TA	3	6	817127	817132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17243	NC_017268	TCC	2	6	817161	817166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422246
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17496	NC_017268	TCG	2	6	829736	829741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422259
17497	NC_017268	T	6	6	829795	829800	0 %	100 %	0 %	0 %	384422259
17498	NC_017268	ACC	2	6	829817	829822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422259
17499	NC_017268	CG	3	6	829845	829850	0 %	0 %	50 %	50 %	384422259
17500	NC_017268	TCA	2	6	829859	829864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422259

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