MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_017268	CTC	2	6	758144	758149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422189
16003	NC_017268	TTA	2	6	758158	758163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422189
16004	NC_017268	CCT	2	6	758210	758215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422189
16005	NC_017268	TCT	2	6	758218	758223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422189
16006	NC_017268	AAG	2	6	758250	758255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422189
16007	NC_017268	TGT	2	6	758314	758319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422189
16008	NC_017268	T	7	7	758329	758335	0 %	100 %	0 %	0 %	384422189
16009	NC_017268	A	6	6	758339	758344	100 %	0 %	0 %	0 %	384422189
16010	NC_017268	CAA	2	6	758363	758368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422189
16011	NC_017268	TTC	2	6	758400	758405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422189
16012	NC_017268	AAT	2	6	758473	758478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422189
16013	NC_017268	TCC	2	6	758582	758587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422189
16014	NC_017268	GC	3	6	758635	758640	0 %	0 %	50 %	50 %	384422190
16015	NC_017268	TAAA	2	8	758650	758657	75 %	25 %	0 %	0 %	384422190
16016	NC_017268	ATTTA	2	10	758732	758741	40 %	60 %	0 %	0 %	384422190
16017	NC_017268	TC	5	10	758852	758861	0 %	50 %	0 %	50 %	384422190
16018	NC_017268	T	10	10	758881	758890	0 %	100 %	0 %	0 %	384422190
16019	NC_017268	A	6	6	758917	758922	100 %	0 %	0 %	0 %	384422190
16020	NC_017268	AC	3	6	758971	758976	50 %	0 %	0 %	50 %	384422190
16021	NC_017268	AT	3	6	759061	759066	50 %	50 %	0 %	0 %	384422190
16022	NC_017268	TAC	2	6	759074	759079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422190
16023	NC_017268	TC	3	6	759080	759085	0 %	50 %	0 %	50 %	384422190
16024	NC_017268	CGG	3	9	759118	759126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422190
16025	NC_017268	A	6	6	759255	759260	100 %	0 %	0 %	0 %	384422191
16026	NC_017268	GCC	2	6	759295	759300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422191
16027	NC_017268	CA	4	8	759320	759327	50 %	0 %	0 %	50 %	384422191
16028	NC_017268	GCT	2	6	759344	759349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422191
16029	NC_017268	TAA	2	6	759350	759355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422191
16030	NC_017268	AC	3	6	759367	759372	50 %	0 %	0 %	50 %	384422191
16031	NC_017268	CTT	2	6	759428	759433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422191
16032	NC_017268	CTG	2	6	759527	759532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422191
16033	NC_017268	TGC	2	6	759547	759552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422191
16034	NC_017268	T	6	6	759556	759561	0 %	100 %	0 %	0 %	384422191
16035	NC_017268	CAC	2	6	759571	759576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422191
16036	NC_017268	CCA	2	6	759647	759652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422191
16037	NC_017268	ATCTAG	2	12	759684	759695	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384422191
16038	NC_017268	GAG	2	6	759705	759710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422191
16039	NC_017268	AGA	2	6	759730	759735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422191
16040	NC_017268	TGA	2	6	759863	759868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422191
16041	NC_017268	CAG	2	6	759873	759878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422191
16042	NC_017268	CATC	2	8	759938	759945	25 %	25 %	0 %	50 %	384422191
16043	NC_017268	GGC	2	6	759966	759971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16044	NC_017268	CCT	2	6	760034	760039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422192
16045	NC_017268	ACT	2	6	760047	760052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422192
16046	NC_017268	CGC	2	6	760081	760086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422192
16047	NC_017268	CTC	2	6	760104	760109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422192
16048	NC_017268	AG	5	10	760123	760132	50 %	0 %	50 %	0 %	384422192
16049	NC_017268	CTG	2	6	760227	760232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422192
16050	NC_017268	TCT	2	6	760273	760278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422192
16051	NC_017268	T	8	8	760299	760306	0 %	100 %	0 %	0 %	384422192
16052	NC_017268	G	6	6	760398	760403	0 %	0 %	100 %	0 %	384422192
16053	NC_017268	CCTTA	2	10	760431	760440	20 %	40 %	0 %	40 %	384422192
16054	NC_017268	TCA	2	6	760456	760461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422192
16055	NC_017268	GGA	2	6	760503	760508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422192
16056	NC_017268	GCC	2	6	760527	760532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422192
16057	NC_017268	GTA	2	6	760534	760539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422192
16058	NC_017268	TAA	2	6	760586	760591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422192
16059	NC_017268	TGA	2	6	760616	760621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422192
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16061	NC_017268	CCA	2	6	760733	760738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422192
16062	NC_017268	ATA	2	6	760741	760746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422192
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16065	NC_017268	AAT	2	6	760977	760982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422192
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16067	NC_017268	CCG	2	6	760999	761004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422192
16068	NC_017268	GC	3	6	761124	761129	0 %	0 %	50 %	50 %	384422192
16069	NC_017268	TTC	2	6	761151	761156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422192
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16072	NC_017268	CA	3	6	761257	761262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16073	NC_017268	GCT	2	6	761315	761320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16074	NC_017268	CGG	2	6	761347	761352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16075	NC_017268	ACA	2	6	761368	761373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16076	NC_017268	TTC	2	6	761384	761389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16077	NC_017268	CA	3	6	761604	761609	50 %	0 %	0 %	50 %	384422193
16078	NC_017268	CA	3	6	761627	761632	50 %	0 %	0 %	50 %	384422193
16079	NC_017268	C	6	6	761705	761710	0 %	0 %	0 %	100 %	384422193
16080	NC_017268	CG	6	12	761721	761732	0 %	0 %	50 %	50 %	384422193
16081	NC_017268	TACC	2	8	761755	761762	25 %	25 %	0 %	50 %	384422193
16082	NC_017268	C	6	6	761810	761815	0 %	0 %	0 %	100 %	384422193
16083	NC_017268	CCTG	2	8	761899	761906	0 %	25 %	25 %	50 %	384422193
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16085	NC_017268	CGCTG	2	10	761981	761990	0 %	20 %	40 %	40 %	384422193
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16089	NC_017268	CG	3	6	762319	762324	0 %	0 %	50 %	50 %	384422193
16090	NC_017268	GCA	2	6	762343	762348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422193
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16094	NC_017268	GTG	2	6	762515	762520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422193
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16102	NC_017268	CCA	2	6	762877	762882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16103	NC_017268	TCT	2	6	762896	762901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16104	NC_017268	GAC	2	6	762921	762926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16105	NC_017268	ACC	2	6	762933	762938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16106	NC_017268	GCAAA	2	10	762950	762959	60 %	0 %	20 %	20 %	384422194
16107	NC_017268	GC	3	6	762988	762993	0 %	0 %	50 %	50 %	384422194
16108	NC_017268	GCAC	2	8	763067	763074	25 %	0 %	25 %	50 %	384422194
16109	NC_017268	TTC	2	6	763079	763084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422194
16110	NC_017268	GCCCCT	2	12	763090	763101	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384422194
16111	NC_017268	CAC	2	6	763240	763245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422194
16112	NC_017268	CA	3	6	763284	763289	50 %	0 %	0 %	50 %	384422194
16113	NC_017268	C	6	6	763303	763308	0 %	0 %	0 %	100 %	384422194
16114	NC_017268	CGG	2	6	763411	763416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422194
16115	NC_017268	CGC	2	6	763447	763452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422194
16116	NC_017268	TACCA	2	10	763453	763462	40 %	20 %	0 %	40 %	384422194
16117	NC_017268	CTA	2	6	763471	763476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422194
16118	NC_017268	AAG	2	6	763524	763529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422194
16119	NC_017268	TCC	2	6	763630	763635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16120	NC_017268	CA	3	6	763644	763649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16121	NC_017268	TGCA	2	8	763652	763659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16123	NC_017268	GCA	2	6	763763	763768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422195
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16495	NC_017268	TAT	2	6	782623	782628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422212
16496	NC_017268	TGCG	2	8	782634	782641	0 %	25 %	50 %	25 %	384422212
16497	NC_017268	CTA	2	6	782713	782718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422212
16498	NC_017268	ACT	2	6	782762	782767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422213
16499	NC_017268	CT	3	6	782794	782799	0 %	50 %	0 %	50 %	384422213
16500	NC_017268	TAC	2	6	782808	782813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422213

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