MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_017268	ATC	2	6	733972	733977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422169
15503	NC_017268	ATC	2	6	733994	733999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422169
15504	NC_017268	CGC	2	6	734047	734052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422169
15505	NC_017268	TAA	2	6	734076	734081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422169
15506	NC_017268	CGCA	2	8	734110	734117	25 %	0 %	25 %	50 %	384422169
15507	NC_017268	CTT	2	6	734130	734135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422169
15508	NC_017268	CAAAA	2	10	734145	734154	80 %	0 %	0 %	20 %	384422169
15509	NC_017268	CAA	2	6	734259	734264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422169
15510	NC_017268	CCCCG	2	10	734282	734291	0 %	0 %	20 %	80 %	384422169
15511	NC_017268	TAA	2	6	734325	734330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422169
15512	NC_017268	CAA	2	6	734355	734360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422169
15513	NC_017268	ATCC	2	8	734362	734369	25 %	25 %	0 %	50 %	384422169
15514	NC_017268	TTC	2	6	734410	734415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422169
15515	NC_017268	ACT	2	6	734420	734425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422169
15516	NC_017268	AGC	2	6	734513	734518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422169
15517	NC_017268	T	6	6	734610	734615	0 %	100 %	0 %	0 %	384422169
15518	NC_017268	AGA	2	6	734617	734622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422169
15519	NC_017268	TTC	3	9	734675	734683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422169
15520	NC_017268	CAG	2	6	734695	734700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422169
15521	NC_017268	CGT	2	6	734742	734747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422169
15522	NC_017268	ACC	2	6	734753	734758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422169
15523	NC_017268	TCAA	2	8	734786	734793	50 %	25 %	0 %	25 %	384422169
15524	NC_017268	TCT	2	6	734808	734813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422169
15525	NC_017268	TCA	2	6	734816	734821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422169
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15527	NC_017268	TTC	2	6	734890	734895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422169
15528	NC_017268	CAAGA	2	10	734943	734952	60 %	0 %	20 %	20 %	384422169
15529	NC_017268	GTA	2	6	735013	735018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422169
15530	NC_017268	GGA	2	6	735040	735045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422169
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15532	NC_017268	CAG	2	6	735192	735197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422169
15533	NC_017268	AAGCGC	2	12	735247	735258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422169
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15535	NC_017268	TCCA	2	8	735310	735317	25 %	25 %	0 %	50 %	384422169
15536	NC_017268	AAT	2	6	735324	735329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422169
15537	NC_017268	GC	3	6	735361	735366	0 %	0 %	50 %	50 %	384422169
15538	NC_017268	A	6	6	735376	735381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15539	NC_017268	ACAGC	2	10	735409	735418	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15540	NC_017268	TTG	2	6	735428	735433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_017268	TA	3	6	735440	735445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_017268	AGGG	2	8	735532	735539	25 %	0 %	75 %	0 %	384422170
15543	NC_017268	GTC	2	6	735562	735567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422170
15544	NC_017268	GCA	2	6	735590	735595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422170
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15546	NC_017268	GCG	2	6	735641	735646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422170
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15548	NC_017268	A	7	7	735805	735811	100 %	0 %	0 %	0 %	384422170
15549	NC_017268	GC	3	6	735851	735856	0 %	0 %	50 %	50 %	384422170
15550	NC_017268	CG	3	6	735917	735922	0 %	0 %	50 %	50 %	384422170
15551	NC_017268	CG	4	8	736037	736044	0 %	0 %	50 %	50 %	384422170
15552	NC_017268	CCA	2	6	736056	736061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422170
15553	NC_017268	CTGCA	2	10	736120	736129	20 %	20 %	20 %	40 %	384422170
15554	NC_017268	CTGC	2	8	736145	736152	0 %	25 %	25 %	50 %	384422170
15555	NC_017268	CAA	2	6	736203	736208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422170
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15557	NC_017268	CGC	2	6	736273	736278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422170
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15559	NC_017268	GCA	2	6	736356	736361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422170
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15563	NC_017268	ACG	2	6	736585	736590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422170
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15565	NC_017268	GC	3	6	736633	736638	0 %	0 %	50 %	50 %	384422170
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15573	NC_017268	A	7	7	737046	737052	100 %	0 %	0 %	0 %	384422171
15574	NC_017268	A	6	6	737095	737100	100 %	0 %	0 %	0 %	384422171
15575	NC_017268	AC	3	6	737102	737107	50 %	0 %	0 %	50 %	384422171
15576	NC_017268	A	7	7	737152	737158	100 %	0 %	0 %	0 %	384422171
15577	NC_017268	GC	3	6	737249	737254	0 %	0 %	50 %	50 %	384422171
15578	NC_017268	A	6	6	737318	737323	100 %	0 %	0 %	0 %	384422171
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15582	NC_017268	AGC	2	6	737571	737576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422171
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15602	NC_017268	GCA	2	6	738462	738467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422172
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15604	NC_017268	T	6	6	738624	738629	0 %	100 %	0 %	0 %	384422172
15605	NC_017268	ACGC	2	8	738815	738822	25 %	0 %	25 %	50 %	384422172
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15608	NC_017268	CG	3	6	738884	738889	0 %	0 %	50 %	50 %	384422172
15609	NC_017268	AC	3	6	738902	738907	50 %	0 %	0 %	50 %	384422172
15610	NC_017268	TGC	2	6	738983	738988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422172
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15613	NC_017268	T	6	6	739053	739058	0 %	100 %	0 %	0 %	384422172
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15618	NC_017268	C	6	6	739189	739194	0 %	0 %	0 %	100 %	384422172
15619	NC_017268	CGCC	2	8	739239	739246	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15620	NC_017268	CCT	2	6	739307	739312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422173
15621	NC_017268	CACT	2	8	739530	739537	25 %	25 %	0 %	50 %	384422173
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15994	NC_017268	CCG	2	6	757823	757828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422189
15995	NC_017268	GTA	2	6	757888	757893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422189
15996	NC_017268	CA	3	6	757904	757909	50 %	0 %	0 %	50 %	384422189
15997	NC_017268	TCA	2	6	757940	757945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422189
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15999	NC_017268	ATC	2	6	757995	758000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422189
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