MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017268	AGA	2	6	660723	660728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422114
14002	NC_017268	CTC	2	6	660743	660748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422114
14003	NC_017268	AG	3	6	660753	660758	50 %	0 %	50 %	0 %	384422114
14004	NC_017268	ACG	2	6	660778	660783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422114
14005	NC_017268	GCG	2	6	660817	660822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422114
14006	NC_017268	GCT	2	6	660865	660870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422114
14007	NC_017268	GTGC	2	8	660913	660920	0 %	25 %	50 %	25 %	384422114
14008	NC_017268	C	6	6	660955	660960	0 %	0 %	0 %	100 %	384422114
14009	NC_017268	TCC	2	6	661148	661153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422114
14010	NC_017268	CGCT	2	8	661163	661170	0 %	25 %	25 %	50 %	384422114
14011	NC_017268	TAC	2	6	661188	661193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422114
14012	NC_017268	TCCCC	2	10	661226	661235	0 %	20 %	0 %	80 %	384422114
14013	NC_017268	GC	3	6	661260	661265	0 %	0 %	50 %	50 %	384422114
14014	NC_017268	CTG	2	6	661295	661300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422114
14015	NC_017268	AGA	2	6	661316	661321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422114
14016	NC_017268	TGCG	2	8	661343	661350	0 %	25 %	50 %	25 %	384422114
14017	NC_017268	GC	5	10	661362	661371	0 %	0 %	50 %	50 %	384422114
14018	NC_017268	CA	3	6	661462	661467	50 %	0 %	0 %	50 %	384422114
14019	NC_017268	ACT	2	6	661519	661524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422114
14020	NC_017268	GC	3	6	661543	661548	0 %	0 %	50 %	50 %	384422114
14021	NC_017268	GGCA	2	8	661569	661576	25 %	0 %	50 %	25 %	384422114
14022	NC_017268	GAC	2	6	661600	661605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422114
14023	NC_017268	T	6	6	661606	661611	0 %	100 %	0 %	0 %	384422114
14024	NC_017268	GC	3	6	661621	661626	0 %	0 %	50 %	50 %	384422114
14025	NC_017268	GCC	2	6	661727	661732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422114
14026	NC_017268	TGG	2	6	661751	661756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422114
14027	NC_017268	ACTG	2	8	661783	661790	25 %	25 %	25 %	25 %	384422114
14028	NC_017268	GCA	2	6	661831	661836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422114
14029	NC_017268	GC	3	6	661847	661852	0 %	0 %	50 %	50 %	384422114
14030	NC_017268	CCTT	2	8	661862	661869	0 %	50 %	0 %	50 %	384422114
14031	NC_017268	GC	3	6	661875	661880	0 %	0 %	50 %	50 %	384422114
14032	NC_017268	GCA	2	6	661884	661889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422114
14033	NC_017268	GC	3	6	661898	661903	0 %	0 %	50 %	50 %	384422114
14034	NC_017268	AC	3	6	661910	661915	50 %	0 %	0 %	50 %	384422114
14035	NC_017268	CG	3	6	661923	661928	0 %	0 %	50 %	50 %	384422114
14036	NC_017268	GC	3	6	661936	661941	0 %	0 %	50 %	50 %	384422114
14037	NC_017268	CG	3	6	661996	662001	0 %	0 %	50 %	50 %	384422114
14038	NC_017268	ACT	2	6	662037	662042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422114
14039	NC_017268	T	6	6	662112	662117	0 %	100 %	0 %	0 %	384422114
14040	NC_017268	AGA	2	6	662121	662126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422114
14041	NC_017268	TGC	2	6	662405	662410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422114
14042	NC_017268	CGC	2	6	662462	662467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422114
14043	NC_017268	CGG	2	6	662557	662562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422115
14044	NC_017268	ACGC	2	8	662565	662572	25 %	0 %	25 %	50 %	384422115
14045	NC_017268	CGG	2	6	662585	662590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422115
14046	NC_017268	CTC	2	6	662598	662603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422115
14047	NC_017268	CAG	2	6	662627	662632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422115
14048	NC_017268	GTCAG	2	10	662641	662650	20 %	20 %	40 %	20 %	384422115
14049	NC_017268	CTC	2	6	662665	662670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14050	NC_017268	GTC	2	6	662676	662681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422116
14051	NC_017268	GCA	2	6	662683	662688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422116
14052	NC_017268	TG	3	6	662693	662698	0 %	50 %	50 %	0 %	384422116
14053	NC_017268	CGC	2	6	662729	662734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422116
14054	NC_017268	CCG	2	6	662797	662802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422116
14055	NC_017268	GCC	2	6	662811	662816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422116
14056	NC_017268	CGA	2	6	662835	662840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422116
14057	NC_017268	AGA	2	6	662895	662900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422116
14058	NC_017268	GC	3	6	662917	662922	0 %	0 %	50 %	50 %	384422116
14059	NC_017268	CA	3	6	662955	662960	50 %	0 %	0 %	50 %	384422116
14060	NC_017268	TG	3	6	662963	662968	0 %	50 %	50 %	0 %	384422116
14061	NC_017268	GTT	2	6	662979	662984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422116
14062	NC_017268	GC	3	6	663006	663011	0 %	0 %	50 %	50 %	384422116
14063	NC_017268	AGA	2	6	663114	663119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422116
14064	NC_017268	AGG	2	6	663242	663247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422116
14065	NC_017268	CGG	2	6	663276	663281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422116
14066	NC_017268	CTTT	2	8	663339	663346	0 %	75 %	0 %	25 %	384422116
14067	NC_017268	CTGCTC	2	12	663383	663394	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384422116
14068	NC_017268	GCG	2	6	663406	663411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422116
14069	NC_017268	GACGC	2	10	663448	663457	20 %	0 %	40 %	40 %	384422116
14070	NC_017268	CAGC	2	8	663503	663510	25 %	0 %	25 %	50 %	384422116
14071	NC_017268	GC	4	8	663593	663600	0 %	0 %	50 %	50 %	384422116
14072	NC_017268	CTC	2	6	663611	663616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422116
14073	NC_017268	GGT	2	6	663630	663635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422116
14074	NC_017268	A	6	6	663713	663718	100 %	0 %	0 %	0 %	384422116
14075	NC_017268	AGTT	2	8	663888	663895	25 %	50 %	25 %	0 %	384422116
14076	NC_017268	CTTG	2	8	663903	663910	0 %	50 %	25 %	25 %	384422116
14077	NC_017268	CAA	2	6	663934	663939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422116
14078	NC_017268	GCG	2	6	663998	664003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422116
14079	NC_017268	CA	4	8	664065	664072	50 %	0 %	0 %	50 %	384422116
14080	NC_017268	CGG	3	9	664077	664085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422116
14081	NC_017268	AC	3	6	664123	664128	50 %	0 %	0 %	50 %	384422116
14082	NC_017268	TAC	2	6	664213	664218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422116
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14084	NC_017268	GT	3	6	664232	664237	0 %	50 %	50 %	0 %	384422116
14085	NC_017268	GC	3	6	664288	664293	0 %	0 %	50 %	50 %	384422116
14086	NC_017268	CAC	2	6	664350	664355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422116
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14088	NC_017268	TTA	2	6	664505	664510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422116
14089	NC_017268	ACAT	2	8	664660	664667	50 %	25 %	0 %	25 %	384422117
14090	NC_017268	CTC	2	6	664726	664731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422117
14091	NC_017268	ATTT	2	8	664903	664910	25 %	75 %	0 %	0 %	384422117
14092	NC_017268	ACG	2	6	664928	664933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422117
14093	NC_017268	GC	3	6	664947	664952	0 %	0 %	50 %	50 %	384422117
14094	NC_017268	CGG	2	6	664954	664959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422117
14095	NC_017268	TC	3	6	664968	664973	0 %	50 %	0 %	50 %	384422117
14096	NC_017268	GAG	2	6	665011	665016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422117
14097	NC_017268	CG	3	6	665023	665028	0 %	0 %	50 %	50 %	384422117
14098	NC_017268	TGCG	2	8	665084	665091	0 %	25 %	50 %	25 %	384422117
14099	NC_017268	CG	3	6	665129	665134	0 %	0 %	50 %	50 %	384422117
14100	NC_017268	GA	3	6	665159	665164	50 %	0 %	50 %	0 %	384422117
14101	NC_017268	A	8	8	665164	665171	100 %	0 %	0 %	0 %	384422117
14102	NC_017268	ATC	2	6	665311	665316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422117
14103	NC_017268	GTG	2	6	665356	665361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422117
14104	NC_017268	TCG	2	6	665369	665374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422117
14105	NC_017268	AGG	2	6	665469	665474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422117
14106	NC_017268	AAGT	2	8	665500	665507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_017268	GC	3	6	665523	665528	0 %	0 %	50 %	50 %	384422118
14108	NC_017268	CAG	2	6	665540	665545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422118
14109	NC_017268	ACGT	2	8	665622	665629	25 %	25 %	25 %	25 %	384422118
14110	NC_017268	ACCTAC	2	12	665673	665684	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384422118
14111	NC_017268	AGA	2	6	665917	665922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422118
14112	NC_017268	GGT	2	6	665996	666001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422118
14113	NC_017268	AAC	2	6	666028	666033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422118
14114	NC_017268	GTG	2	6	666039	666044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422118
14115	NC_017268	CG	3	6	666090	666095	0 %	0 %	50 %	50 %	384422118
14116	NC_017268	TGC	2	6	666134	666139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422118
14117	NC_017268	TCGT	2	8	666168	666175	0 %	50 %	25 %	25 %	384422118
14118	NC_017268	AATC	2	8	666237	666244	50 %	25 %	0 %	25 %	384422118
14119	NC_017268	TCA	2	6	666265	666270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422118
14120	NC_017268	GC	3	6	666313	666318	0 %	0 %	50 %	50 %	384422118
14121	NC_017268	TAC	2	6	666324	666329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422118
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14489	NC_017268	TA	3	6	683100	683105	50 %	50 %	0 %	0 %	384422130
14490	NC_017268	T	6	6	683137	683142	0 %	100 %	0 %	0 %	384422130
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14493	NC_017268	CTC	2	6	683266	683271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422130
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14495	NC_017268	CA	3	6	683311	683316	50 %	0 %	0 %	50 %	384422130
14496	NC_017268	TGA	2	6	683353	683358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422130
14497	NC_017268	CT	3	6	683373	683378	0 %	50 %	0 %	50 %	384422130
14498	NC_017268	GT	3	6	683509	683514	0 %	50 %	50 %	0 %	384422131
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