MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017268	CG	3	6	638517	638522	0 %	0 %	50 %	50 %	384422096
13502	NC_017268	CAGA	2	8	638554	638561	50 %	0 %	25 %	25 %	384422096
13503	NC_017268	GAA	2	6	638732	638737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422096
13504	NC_017268	TGC	2	6	638750	638755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422096
13505	NC_017268	GTG	2	6	638784	638789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422096
13506	NC_017268	ATTGG	2	10	638889	638898	20 %	40 %	40 %	0 %	384422096
13507	NC_017268	GCG	2	6	638907	638912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422096
13508	NC_017268	AC	3	6	639065	639070	50 %	0 %	0 %	50 %	384422096
13509	NC_017268	GCA	2	6	639107	639112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422096
13510	NC_017268	A	6	6	639112	639117	100 %	0 %	0 %	0 %	384422096
13511	NC_017268	CAATC	2	10	639184	639193	40 %	20 %	0 %	40 %	384422096
13512	NC_017268	GTG	2	6	639329	639334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422096
13513	NC_017268	GTC	2	6	639419	639424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422096
13514	NC_017268	CG	3	6	639460	639465	0 %	0 %	50 %	50 %	384422096
13515	NC_017268	TTG	2	6	639474	639479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422096
13516	NC_017268	TCCT	2	8	639589	639596	0 %	50 %	0 %	50 %	384422096
13517	NC_017268	CCG	2	6	639648	639653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422096
13518	NC_017268	GC	3	6	639695	639700	0 %	0 %	50 %	50 %	384422096
13519	NC_017268	AAAC	2	8	639750	639757	75 %	0 %	0 %	25 %	384422096
13520	NC_017268	CTG	2	6	639781	639786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422096
13521	NC_017268	GGT	2	6	639878	639883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422096
13522	NC_017268	CGT	2	6	640002	640007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422096
13523	NC_017268	GC	3	6	640029	640034	0 %	0 %	50 %	50 %	384422096
13524	NC_017268	ACG	2	6	640044	640049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422096
13525	NC_017268	GTC	2	6	640145	640150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422096
13526	NC_017268	TGA	2	6	640156	640161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422096
13527	NC_017268	A	6	6	640278	640283	100 %	0 %	0 %	0 %	384422096
13528	NC_017268	GGC	2	6	640306	640311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422096
13529	NC_017268	GCC	2	6	640345	640350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422096
13530	NC_017268	GCAC	2	8	640360	640367	25 %	0 %	25 %	50 %	384422096
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13532	NC_017268	CGA	2	6	640432	640437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422096
13533	NC_017268	TCAG	2	8	640467	640474	25 %	25 %	25 %	25 %	384422096
13534	NC_017268	ATG	2	6	640475	640480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422096
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13536	NC_017268	CT	3	6	640559	640564	0 %	50 %	0 %	50 %	384422096
13537	NC_017268	CAC	2	6	640572	640577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422096
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13539	NC_017268	TG	3	6	640602	640607	0 %	50 %	50 %	0 %	384422096
13540	NC_017268	GCACAC	2	12	640609	640620	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384422096
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13542	NC_017268	GTG	2	6	640685	640690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422096
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13544	NC_017268	GCA	2	6	640801	640806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422096
13545	NC_017268	TG	3	6	640891	640896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_017268	GTCT	2	8	640985	640992	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13547	NC_017268	GC	3	6	641046	641051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13548	NC_017268	TCC	2	6	641118	641123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13549	NC_017268	AGC	2	6	641208	641213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13550	NC_017268	TCT	2	6	641283	641288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13551	NC_017268	TG	3	6	641291	641296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_017268	GCG	2	6	641330	641335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13553	NC_017268	A	8	8	641345	641352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_017268	GTT	2	6	641390	641395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_017268	CCA	2	6	641398	641403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13556	NC_017268	AAG	2	6	641408	641413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_017268	CCT	2	6	641425	641430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13558	NC_017268	A	9	9	641453	641461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_017268	T	6	6	641480	641485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13561	NC_017268	A	6	6	641503	641508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_017268	GC	3	6	641592	641597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13563	NC_017268	GCC	2	6	641600	641605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13564	NC_017268	CTT	2	6	641645	641650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13565	NC_017268	CG	3	6	641790	641795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13566	NC_017268	CCT	2	6	641800	641805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13567	NC_017268	GCA	2	6	641997	642002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422097
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13572	NC_017268	T	6	6	642247	642252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13573	NC_017268	ATC	2	6	642268	642273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422098
13574	NC_017268	ATA	2	6	642280	642285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422098
13575	NC_017268	TGC	2	6	642295	642300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422098
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13582	NC_017268	TTTC	2	8	642543	642550	0 %	75 %	0 %	25 %	384422098
13583	NC_017268	TGA	2	6	642591	642596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422098
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13590	NC_017268	AAAG	2	8	642860	642867	75 %	0 %	25 %	0 %	384422098
13591	NC_017268	CTCG	2	8	642868	642875	0 %	25 %	25 %	50 %	384422098
13592	NC_017268	AAG	3	9	642903	642911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422098
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13595	NC_017268	CCG	2	6	643069	643074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422098
13596	NC_017268	A	6	6	643090	643095	100 %	0 %	0 %	0 %	384422098
13597	NC_017268	CT	3	6	643306	643311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13598	NC_017268	AG	3	6	643315	643320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_017268	TACA	2	8	643351	643358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13600	NC_017268	CTG	2	6	643367	643372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13601	NC_017268	GA	3	6	643414	643419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_017268	GCC	2	6	643423	643428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13603	NC_017268	GTC	2	6	643455	643460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13604	NC_017268	GC	3	6	643529	643534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13605	NC_017268	ACC	2	6	643547	643552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13606	NC_017268	CA	3	6	643570	643575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13607	NC_017268	CGCAC	2	10	643586	643595	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13608	NC_017268	GC	3	6	643687	643692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13609	NC_017268	GCG	2	6	643722	643727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13610	NC_017268	GCC	2	6	643816	643821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13611	NC_017268	A	6	6	643822	643827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_017268	CAC	2	6	643840	643845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13613	NC_017268	T	8	8	643860	643867	0 %	100 %	0 %	0 %	384422099
13614	NC_017268	TGC	2	6	643930	643935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422099
13615	NC_017268	CG	3	6	643952	643957	0 %	0 %	50 %	50 %	384422099
13616	NC_017268	TCG	2	6	643989	643994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13619	NC_017268	GC	3	6	644097	644102	0 %	0 %	50 %	50 %	384422100
13620	NC_017268	CAT	2	6	644256	644261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422100
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13624	NC_017268	T	6	6	644382	644387	0 %	100 %	0 %	0 %	384422100
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13981	NC_017268	GA	3	6	659870	659875	50 %	0 %	50 %	0 %	384422113
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13994	NC_017268	GCT	2	6	660424	660429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422113
13995	NC_017268	TCC	2	6	660442	660447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13996	NC_017268	GCACG	2	10	660491	660500	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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13998	NC_017268	CAC	2	6	660528	660533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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