MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017268	GC	3	6	614629	614634	0 %	0 %	50 %	50 %	384422075
13002	NC_017268	T	6	6	614636	614641	0 %	100 %	0 %	0 %	384422075
13003	NC_017268	CG	3	6	614649	614654	0 %	0 %	50 %	50 %	384422075
13004	NC_017268	CA	4	8	614676	614683	50 %	0 %	0 %	50 %	384422075
13005	NC_017268	CAT	2	6	614696	614701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422075
13006	NC_017268	TCAT	2	8	614716	614723	25 %	50 %	0 %	25 %	384422075
13007	NC_017268	TTG	2	6	614757	614762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422075
13008	NC_017268	TAA	2	6	614806	614811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422075
13009	NC_017268	AGA	2	6	614829	614834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422075
13010	NC_017268	CTT	2	6	614846	614851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422075
13011	NC_017268	CCG	2	6	614893	614898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422075
13012	NC_017268	CA	3	6	614924	614929	50 %	0 %	0 %	50 %	384422075
13013	NC_017268	GTT	2	6	614974	614979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422075
13014	NC_017268	TTTC	2	8	614980	614987	0 %	75 %	0 %	25 %	384422075
13015	NC_017268	ACGGCC	2	12	615025	615036	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384422075
13016	NC_017268	GCA	2	6	615073	615078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422075
13017	NC_017268	A	6	6	615157	615162	100 %	0 %	0 %	0 %	384422075
13018	NC_017268	A	6	6	615335	615340	100 %	0 %	0 %	0 %	384422075
13019	NC_017268	TTA	2	6	615370	615375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422075
13020	NC_017268	TGT	2	6	615417	615422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422075
13021	NC_017268	CAT	2	6	615423	615428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422075
13022	NC_017268	TAA	2	6	615449	615454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422076
13023	NC_017268	AAAGAA	2	12	615496	615507	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384422076
13024	NC_017268	CGC	2	6	615508	615513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422076
13025	NC_017268	AGCA	2	8	615549	615556	50 %	0 %	25 %	25 %	384422076
13026	NC_017268	CG	4	8	615559	615566	0 %	0 %	50 %	50 %	384422076
13027	NC_017268	AC	3	6	615593	615598	50 %	0 %	0 %	50 %	384422076
13028	NC_017268	CA	3	6	615603	615608	50 %	0 %	0 %	50 %	384422076
13029	NC_017268	ACT	2	6	615802	615807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422076
13030	NC_017268	T	6	6	615840	615845	0 %	100 %	0 %	0 %	384422076
13031	NC_017268	A	8	8	615946	615953	100 %	0 %	0 %	0 %	384422076
13032	NC_017268	CA	3	6	615957	615962	50 %	0 %	0 %	50 %	384422076
13033	NC_017268	AAATAC	2	12	616001	616012	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384422076
13034	NC_017268	ACTG	2	8	616064	616071	25 %	25 %	25 %	25 %	384422076
13035	NC_017268	TGA	2	6	616185	616190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422076
13036	NC_017268	GGAA	2	8	616222	616229	50 %	0 %	50 %	0 %	384422076
13037	NC_017268	AGAA	2	8	616258	616265	75 %	0 %	25 %	0 %	384422076
13038	NC_017268	ACC	2	6	616310	616315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422076
13039	NC_017268	GC	3	6	616358	616363	0 %	0 %	50 %	50 %	384422076
13040	NC_017268	A	7	7	616384	616390	100 %	0 %	0 %	0 %	384422076
13041	NC_017268	A	7	7	616429	616435	100 %	0 %	0 %	0 %	384422076
13042	NC_017268	CT	3	6	616465	616470	0 %	50 %	0 %	50 %	384422076
13043	NC_017268	AT	3	6	616551	616556	50 %	50 %	0 %	0 %	384422076
13044	NC_017268	TG	3	6	616582	616587	0 %	50 %	50 %	0 %	384422076
13045	NC_017268	GCAC	2	8	616613	616620	25 %	0 %	25 %	50 %	384422076
13046	NC_017268	AAAAG	2	10	616656	616665	80 %	0 %	20 %	0 %	384422076
13047	NC_017268	CAA	2	6	616672	616677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422076
13048	NC_017268	AGC	2	6	616826	616831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422076
13049	NC_017268	A	8	8	616879	616886	100 %	0 %	0 %	0 %	384422076
13050	NC_017268	AGC	2	6	616897	616902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422076
13051	NC_017268	GA	3	6	616912	616917	50 %	0 %	50 %	0 %	384422076
13052	NC_017268	A	7	7	616917	616923	100 %	0 %	0 %	0 %	384422076
13053	NC_017268	CAG	2	6	616969	616974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422077
13054	NC_017268	AGG	2	6	617015	617020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422077
13055	NC_017268	AG	3	6	617046	617051	50 %	0 %	50 %	0 %	384422077
13056	NC_017268	CCA	2	6	617080	617085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422077
13057	NC_017268	ATC	2	6	617111	617116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422077
13058	NC_017268	CAG	2	6	617123	617128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422077
13059	NC_017268	CAA	2	6	617212	617217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422077
13060	NC_017268	GC	4	8	617248	617255	0 %	0 %	50 %	50 %	384422077
13061	NC_017268	TCCTTT	2	12	617292	617303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422077
13062	NC_017268	CAG	2	6	617398	617403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422077
13063	NC_017268	CTCC	2	8	617413	617420	0 %	25 %	0 %	75 %	384422077
13064	NC_017268	AAT	2	6	617485	617490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422077
13065	NC_017268	AGC	2	6	617535	617540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422077
13066	NC_017268	GCC	2	6	617601	617606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13067	NC_017268	CT	3	6	617622	617627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13068	NC_017268	CCA	2	6	617647	617652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13069	NC_017268	CTG	2	6	617684	617689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422078
13070	NC_017268	ATT	2	6	617798	617803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422078
13071	NC_017268	C	6	6	617814	617819	0 %	0 %	0 %	100 %	384422078
13072	NC_017268	CCG	2	6	617836	617841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422078
13073	NC_017268	TCA	2	6	617863	617868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422078
13074	NC_017268	TAC	2	6	617906	617911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422078
13075	NC_017268	CAA	2	6	617998	618003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422078
13076	NC_017268	CTG	2	6	618043	618048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422078
13077	NC_017268	CTG	2	6	618056	618061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422078
13078	NC_017268	GCA	2	6	618141	618146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422078
13079	NC_017268	ACC	2	6	618182	618187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422078
13080	NC_017268	CAC	2	6	618239	618244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422078
13081	NC_017268	CTC	2	6	618296	618301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13082	NC_017268	GC	3	6	618442	618447	0 %	0 %	50 %	50 %	384422079
13083	NC_017268	TACA	2	8	618477	618484	50 %	25 %	0 %	25 %	384422079
13084	NC_017268	CGC	3	9	618642	618650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422079
13085	NC_017268	TCC	2	6	618655	618660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422079
13086	NC_017268	TCCC	2	8	618663	618670	0 %	25 %	0 %	75 %	384422079
13087	NC_017268	TCCT	2	8	618672	618679	0 %	50 %	0 %	50 %	384422079
13088	NC_017268	CA	4	8	618682	618689	50 %	0 %	0 %	50 %	384422079
13089	NC_017268	ACC	2	6	618715	618720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422079
13090	NC_017268	AGCC	2	8	618752	618759	25 %	0 %	25 %	50 %	384422079
13091	NC_017268	CGC	2	6	618810	618815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422079
13092	NC_017268	CTC	2	6	618816	618821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422079
13093	NC_017268	A	7	7	618824	618830	100 %	0 %	0 %	0 %	384422079
13094	NC_017268	GGA	2	6	618832	618837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422079
13095	NC_017268	TCC	2	6	618873	618878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422079
13096	NC_017268	ACCC	2	8	618936	618943	25 %	0 %	0 %	75 %	384422079
13097	NC_017268	GC	3	6	619038	619043	0 %	0 %	50 %	50 %	384422079
13098	NC_017268	GGT	2	6	619137	619142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422079
13099	NC_017268	GC	3	6	619157	619162	0 %	0 %	50 %	50 %	384422079
13100	NC_017268	AAT	2	6	619171	619176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422079
13101	NC_017268	A	6	6	619177	619182	100 %	0 %	0 %	0 %	384422079
13102	NC_017268	CG	4	8	619186	619193	0 %	0 %	50 %	50 %	384422079
13103	NC_017268	TGC	2	6	619200	619205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422079
13104	NC_017268	GCA	2	6	619216	619221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422079
13105	NC_017268	TGC	2	6	619263	619268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422079
13106	NC_017268	TTC	2	6	619302	619307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422079
13107	NC_017268	GCA	2	6	619333	619338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422079
13108	NC_017268	TCA	2	6	619363	619368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422079
13109	NC_017268	GCT	2	6	619388	619393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422079
13110	NC_017268	GCTC	2	8	619459	619466	0 %	25 %	25 %	50 %	384422079
13111	NC_017268	CTC	2	6	619545	619550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422079
13112	NC_017268	CTG	2	6	619571	619576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422079
13113	NC_017268	CTG	2	6	619624	619629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422079
13114	NC_017268	AGA	2	6	619662	619667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422079
13115	NC_017268	AC	3	6	619707	619712	50 %	0 %	0 %	50 %	384422079
13116	NC_017268	GCG	2	6	619715	619720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422079
13117	NC_017268	CCA	2	6	619736	619741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422079
13118	NC_017268	GCA	2	6	619744	619749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422079
13119	NC_017268	CAA	2	6	619767	619772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422079
13120	NC_017268	CAC	2	6	619773	619778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422079
13121	NC_017268	CTGC	2	8	619786	619793	0 %	25 %	25 %	50 %	384422079
13122	NC_017268	GC	3	6	619857	619862	0 %	0 %	50 %	50 %	384422079
13123	NC_017268	AC	3	6	619863	619868	50 %	0 %	0 %	50 %	384422079
13124	NC_017268	A	7	7	619875	619881	100 %	0 %	0 %	0 %	384422079
13125	NC_017268	ATGCA	2	10	619926	619935	40 %	20 %	20 %	20 %	384422079
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13132	NC_017268	ACA	2	6	620069	620074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422079
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13234	NC_017268	C	6	6	625054	625059	0 %	0 %	0 %	100 %	384422085
13235	NC_017268	GC	4	8	625100	625107	0 %	0 %	50 %	50 %	384422085
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13237	NC_017268	CT	3	6	625307	625312	0 %	50 %	0 %	50 %	384422085
13238	NC_017268	ACACC	2	10	625395	625404	40 %	0 %	0 %	60 %	384422085
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13242	NC_017268	GC	3	6	625717	625722	0 %	0 %	50 %	50 %	384422085
13243	NC_017268	CTC	2	6	625724	625729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422085
13244	NC_017268	GC	4	8	625792	625799	0 %	0 %	50 %	50 %	384422085
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13492	NC_017268	CTT	2	6	637951	637956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422095
13493	NC_017268	GCAG	2	8	637959	637966	25 %	0 %	50 %	25 %	384422095
13494	NC_017268	TGCA	2	8	638012	638019	25 %	25 %	25 %	25 %	384422095
13495	NC_017268	GCG	2	6	638034	638039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422095
13496	NC_017268	AAG	2	6	638102	638107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422095
13497	NC_017268	A	6	6	638249	638254	100 %	0 %	0 %	0 %	384422096
13498	NC_017268	TG	3	6	638288	638293	0 %	50 %	50 %	0 %	384422096
13499	NC_017268	GCG	2	6	638320	638325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422096
13500	NC_017268	GGT	2	6	638432	638437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422096

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