MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_017268	GCC	2	6	569995	570000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422038
12002	NC_017268	CTTT	2	8	570141	570148	0 %	75 %	0 %	25 %	384422038
12003	NC_017268	AGA	2	6	570174	570179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422038
12004	NC_017268	CG	3	6	570199	570204	0 %	0 %	50 %	50 %	384422038
12005	NC_017268	GTC	2	6	570223	570228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422038
12006	NC_017268	CATC	2	8	570251	570258	25 %	25 %	0 %	50 %	384422038
12007	NC_017268	GCG	2	6	570378	570383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422038
12008	NC_017268	GCAG	2	8	570391	570398	25 %	0 %	50 %	25 %	384422038
12009	NC_017268	CG	3	6	570431	570436	0 %	0 %	50 %	50 %	384422038
12010	NC_017268	AGC	2	6	570446	570451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422038
12011	NC_017268	GAA	2	6	570469	570474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422038
12012	NC_017268	TCC	2	6	570558	570563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422038
12013	NC_017268	TAT	2	6	570576	570581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422038
12014	NC_017268	AGA	2	6	570588	570593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422038
12015	NC_017268	AGA	2	6	570618	570623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422038
12016	NC_017268	ATG	2	6	570652	570657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422038
12017	NC_017268	GAT	2	6	570690	570695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422038
12018	NC_017268	GCG	2	6	570708	570713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422038
12019	NC_017268	GCG	2	6	570748	570753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422038
12020	NC_017268	TCTG	2	8	570756	570763	0 %	50 %	25 %	25 %	384422038
12021	NC_017268	GAA	2	6	570796	570801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422038
12022	NC_017268	A	6	6	570800	570805	100 %	0 %	0 %	0 %	384422038
12023	NC_017268	A	6	6	570807	570812	100 %	0 %	0 %	0 %	384422038
12024	NC_017268	T	6	6	570855	570860	0 %	100 %	0 %	0 %	384422038
12025	NC_017268	CG	3	6	570871	570876	0 %	0 %	50 %	50 %	384422038
12026	NC_017268	AACA	2	8	570892	570899	75 %	0 %	0 %	25 %	384422038
12027	NC_017268	AGC	2	6	570962	570967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422038
12028	NC_017268	CGGG	2	8	571007	571014	0 %	0 %	75 %	25 %	384422038
12029	NC_017268	GAA	2	6	571021	571026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422038
12030	NC_017268	GTGC	2	8	571065	571072	0 %	25 %	50 %	25 %	384422038
12031	NC_017268	TCGC	2	8	571092	571099	0 %	25 %	25 %	50 %	384422038
12032	NC_017268	TG	3	6	571135	571140	0 %	50 %	50 %	0 %	384422038
12033	NC_017268	GTAT	2	8	571193	571200	25 %	50 %	25 %	0 %	384422038
12034	NC_017268	A	7	7	571225	571231	100 %	0 %	0 %	0 %	384422038
12035	NC_017268	GCACG	2	10	571284	571293	20 %	0 %	40 %	40 %	384422038
12036	NC_017268	CG	3	6	571301	571306	0 %	0 %	50 %	50 %	384422038
12037	NC_017268	GAA	2	6	571317	571322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422038
12038	NC_017268	AGA	2	6	571351	571356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422038
12039	NC_017268	AAC	2	6	571398	571403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12040	NC_017268	AGC	2	6	571404	571409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12041	NC_017268	GGT	2	6	571440	571445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422039
12042	NC_017268	GC	3	6	571458	571463	0 %	0 %	50 %	50 %	384422039
12043	NC_017268	CTC	2	6	571503	571508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422039
12044	NC_017268	TGCT	2	8	571558	571565	0 %	50 %	25 %	25 %	384422039
12045	NC_017268	TCC	2	6	571672	571677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422039
12046	NC_017268	GCA	2	6	571711	571716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422039
12047	NC_017268	CCT	2	6	571784	571789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422039
12048	NC_017268	GCA	2	6	571828	571833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422039
12049	NC_017268	ATC	2	6	571836	571841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422039
12050	NC_017268	AAG	2	6	571854	571859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422039
12051	NC_017268	AGA	2	6	571915	571920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422039
12052	NC_017268	AG	3	6	571934	571939	50 %	0 %	50 %	0 %	384422039
12053	NC_017268	CAAG	2	8	571976	571983	50 %	0 %	25 %	25 %	384422039
12054	NC_017268	TGG	2	6	572039	572044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422039
12055	NC_017268	AC	3	6	572092	572097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12056	NC_017268	CCT	2	6	572184	572189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422040
12057	NC_017268	TCAC	2	8	572210	572217	25 %	25 %	0 %	50 %	384422040
12058	NC_017268	CGATA	2	10	572262	572271	40 %	20 %	20 %	20 %	384422040
12059	NC_017268	CTGA	2	8	572323	572330	25 %	25 %	25 %	25 %	384422040
12060	NC_017268	GGTCA	2	10	572641	572650	20 %	20 %	40 %	20 %	384422040
12061	NC_017268	TCG	2	6	572669	572674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422040
12062	NC_017268	GGA	2	6	572713	572718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422040
12063	NC_017268	CTGC	2	8	572729	572736	0 %	25 %	25 %	50 %	384422040
12064	NC_017268	GC	3	6	572735	572740	0 %	0 %	50 %	50 %	384422040
12065	NC_017268	GTG	2	6	572810	572815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422040
12066	NC_017268	AGT	2	6	572838	572843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422040
12067	NC_017268	GTG	2	6	572922	572927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422040
12068	NC_017268	ATA	2	6	572930	572935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422040
12069	NC_017268	CAC	2	6	572974	572979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422040
12070	NC_017268	TTC	2	6	572998	573003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422040
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12072	NC_017268	A	6	6	573016	573021	100 %	0 %	0 %	0 %	384422040
12073	NC_017268	ATACCC	2	12	573041	573052	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384422040
12074	NC_017268	GCT	2	6	573113	573118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422040
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12076	NC_017268	TGAA	2	8	573212	573219	50 %	25 %	25 %	0 %	384422040
12077	NC_017268	CG	4	8	573234	573241	0 %	0 %	50 %	50 %	384422040
12078	NC_017268	GATAG	2	10	573250	573259	40 %	20 %	40 %	0 %	384422040
12079	NC_017268	AG	3	6	573283	573288	50 %	0 %	50 %	0 %	384422040
12080	NC_017268	AGGC	2	8	573389	573396	25 %	0 %	50 %	25 %	384422040
12081	NC_017268	ACA	2	6	573442	573447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422040
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12084	NC_017268	C	7	7	573611	573617	0 %	0 %	0 %	100 %	384422041
12085	NC_017268	TG	3	6	573619	573624	0 %	50 %	50 %	0 %	384422041
12086	NC_017268	CG	3	6	573625	573630	0 %	0 %	50 %	50 %	384422041
12087	NC_017268	GCA	2	6	573631	573636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422041
12088	NC_017268	CA	4	8	573635	573642	50 %	0 %	0 %	50 %	384422041
12089	NC_017268	CGTA	2	8	573710	573717	25 %	25 %	25 %	25 %	384422041
12090	NC_017268	TACG	2	8	573725	573732	25 %	25 %	25 %	25 %	384422041
12091	NC_017268	GCA	3	9	573785	573793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422041
12092	NC_017268	CTG	2	6	573885	573890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422041
12093	NC_017268	CA	3	6	573914	573919	50 %	0 %	0 %	50 %	384422041
12094	NC_017268	TCT	2	6	573937	573942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422041
12095	NC_017268	GCG	2	6	574018	574023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422041
12096	NC_017268	GC	3	6	574036	574041	0 %	0 %	50 %	50 %	384422041
12097	NC_017268	TACT	2	8	574048	574055	25 %	50 %	0 %	25 %	384422041
12098	NC_017268	CCA	2	6	574056	574061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422041
12099	NC_017268	ACTT	2	8	574065	574072	25 %	50 %	0 %	25 %	384422041
12100	NC_017268	CG	3	6	574123	574128	0 %	0 %	50 %	50 %	384422041
12101	NC_017268	TG	3	6	574176	574181	0 %	50 %	50 %	0 %	384422041
12102	NC_017268	ATG	2	6	574231	574236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422041
12103	NC_017268	CG	3	6	574250	574255	0 %	0 %	50 %	50 %	384422041
12104	NC_017268	CA	3	6	574257	574262	50 %	0 %	0 %	50 %	384422041
12105	NC_017268	GC	3	6	574279	574284	0 %	0 %	50 %	50 %	384422041
12106	NC_017268	CTC	2	6	574329	574334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422041
12107	NC_017268	TTC	2	6	574344	574349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422041
12108	NC_017268	ATG	2	6	574405	574410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422041
12109	NC_017268	GTA	2	6	574434	574439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422041
12110	NC_017268	AG	3	6	574531	574536	50 %	0 %	50 %	0 %	384422041
12111	NC_017268	AG	3	6	574572	574577	50 %	0 %	50 %	0 %	384422041
12112	NC_017268	ATA	2	6	574624	574629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422041
12113	NC_017268	CAC	2	6	574639	574644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422041
12114	NC_017268	TGC	2	6	574657	574662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422041
12115	NC_017268	GCC	2	6	574699	574704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422041
12116	NC_017268	TCC	2	6	574707	574712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422041
12117	NC_017268	GAA	2	6	574725	574730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422041
12118	NC_017268	CA	3	6	574766	574771	50 %	0 %	0 %	50 %	384422041
12119	NC_017268	T	6	6	574779	574784	0 %	100 %	0 %	0 %	384422041
12120	NC_017268	ACG	2	6	574800	574805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422041
12121	NC_017268	TTC	2	6	574860	574865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422041
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12123	NC_017268	AAG	2	6	575095	575100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422041
12124	NC_017268	TCT	2	6	575107	575112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422041
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12128	NC_017268	CGTCC	2	10	575513	575522	0 %	20 %	20 %	60 %	384422042
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12216	NC_017268	A	6	6	579394	579399	100 %	0 %	0 %	0 %	384422045
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12223	NC_017268	AGCACC	2	12	579819	579830	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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12225	NC_017268	GCTT	2	8	579871	579878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12226	NC_017268	CTG	2	6	579879	579884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12228	NC_017268	GTC	2	6	579906	579911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12229	NC_017268	CAA	2	6	579924	579929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12230	NC_017268	GAAA	2	8	579935	579942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12231	NC_017268	A	6	6	579951	579956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12232	NC_017268	CCA	2	6	580042	580047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12233	NC_017268	ACC	2	6	580087	580092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422046
12234	NC_017268	ACC	3	9	580102	580110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422046
12235	NC_017268	A	7	7	580238	580244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12236	NC_017268	CAC	2	6	580269	580274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12237	NC_017268	TAC	2	6	580286	580291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12238	NC_017268	GC	3	6	580304	580309	0 %	0 %	50 %	50 %	384422047
12239	NC_017268	CG	3	6	580389	580394	0 %	0 %	50 %	50 %	384422047
12240	NC_017268	CCG	2	6	580413	580418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422047
12241	NC_017268	ACT	2	6	580467	580472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422047
12242	NC_017268	CA	3	6	580539	580544	50 %	0 %	0 %	50 %	384422047
12243	NC_017268	CA	3	6	580582	580587	50 %	0 %	0 %	50 %	384422047
12244	NC_017268	GC	3	6	580602	580607	0 %	0 %	50 %	50 %	384422047
12245	NC_017268	TGAT	2	8	580716	580723	25 %	50 %	25 %	0 %	384422047
12246	NC_017268	C	6	6	580831	580836	0 %	0 %	0 %	100 %	384422047
12247	NC_017268	ACT	2	6	580844	580849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422047
12248	NC_017268	GC	3	6	580858	580863	0 %	0 %	50 %	50 %	384422047
12249	NC_017268	AAG	2	6	580865	580870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422047
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12251	NC_017268	ACC	2	6	580946	580951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422047
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12256	NC_017268	CAC	2	6	581183	581188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12356	NC_017268	ACTC	2	8	586164	586171	25 %	25 %	0 %	50 %	384422054
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12363	NC_017268	CA	3	6	586552	586557	50 %	0 %	0 %	50 %	384422054
12364	NC_017268	GCA	2	6	586740	586745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422054
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12367	NC_017268	GCT	2	6	586947	586952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422055
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12370	NC_017268	ACAG	2	8	586997	587004	50 %	0 %	25 %	25 %	384422055
12371	NC_017268	CCA	3	9	587148	587156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422055
12372	NC_017268	GCA	2	6	587186	587191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422055
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