MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017268	CAG	2	6	545350	545355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422019
11502	NC_017268	A	6	6	545366	545371	100 %	0 %	0 %	0 %	384422019
11503	NC_017268	GAA	2	6	545469	545474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422019
11504	NC_017268	TGGTG	2	10	545533	545542	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_017268	ACTTT	2	10	545565	545574	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11506	NC_017268	GTTT	2	8	545580	545587	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_017268	G	6	6	545683	545688	0 %	0 %	100 %	0 %	384422020
11508	NC_017268	TG	3	6	545766	545771	0 %	50 %	50 %	0 %	384422020
11509	NC_017268	CG	4	8	545793	545800	0 %	0 %	50 %	50 %	384422020
11510	NC_017268	GACA	2	8	545886	545893	50 %	0 %	25 %	25 %	384422020
11511	NC_017268	GAT	2	6	545916	545921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422020
11512	NC_017268	GTT	2	6	545961	545966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422020
11513	NC_017268	TCAG	2	8	546087	546094	25 %	25 %	25 %	25 %	384422020
11514	NC_017268	GC	3	6	546209	546214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11515	NC_017268	TGC	2	6	546247	546252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_017268	TG	3	6	546259	546264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_017268	GCA	2	6	546300	546305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_017268	A	6	6	546356	546361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_017268	CCA	2	6	546438	546443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422021
11520	NC_017268	CTTC	2	8	546462	546469	0 %	50 %	0 %	50 %	384422021
11521	NC_017268	CG	3	6	546555	546560	0 %	0 %	50 %	50 %	384422021
11522	NC_017268	CCG	2	6	546572	546577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422021
11523	NC_017268	CTG	2	6	546604	546609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422021
11524	NC_017268	CA	3	6	546636	546641	50 %	0 %	0 %	50 %	384422021
11525	NC_017268	TAA	2	6	546711	546716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422021
11526	NC_017268	CG	3	6	546895	546900	0 %	0 %	50 %	50 %	384422021
11527	NC_017268	CA	3	6	547023	547028	50 %	0 %	0 %	50 %	384422021
11528	NC_017268	GCT	2	6	547116	547121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422021
11529	NC_017268	ACT	2	6	547124	547129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422021
11530	NC_017268	CGT	2	6	547212	547217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422021
11531	NC_017268	TCA	2	6	547259	547264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422021
11532	NC_017268	ACC	2	6	547292	547297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422021
11533	NC_017268	CA	3	6	547422	547427	50 %	0 %	0 %	50 %	384422021
11534	NC_017268	TCT	2	6	547469	547474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422021
11535	NC_017268	GGA	2	6	547631	547636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422021
11536	NC_017268	TC	3	6	547674	547679	0 %	50 %	0 %	50 %	384422021
11537	NC_017268	AC	3	6	547698	547703	50 %	0 %	0 %	50 %	384422021
11538	NC_017268	ACC	2	6	547871	547876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422021
11539	NC_017268	GCA	2	6	547895	547900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422021
11540	NC_017268	GC	3	6	547904	547909	0 %	0 %	50 %	50 %	384422021
11541	NC_017268	AC	3	6	547996	548001	50 %	0 %	0 %	50 %	384422021
11542	NC_017268	TGT	2	6	548046	548051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422021
11543	NC_017268	TGC	2	6	548066	548071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422021
11544	NC_017268	CG	4	8	548086	548093	0 %	0 %	50 %	50 %	384422021
11545	NC_017268	GC	3	6	548186	548191	0 %	0 %	50 %	50 %	384422021
11546	NC_017268	TAG	2	6	548193	548198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422021
11547	NC_017268	GTG	2	6	548250	548255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422022
11548	NC_017268	T	6	6	548293	548298	0 %	100 %	0 %	0 %	384422022
11549	NC_017268	GTG	2	6	548359	548364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422022
11550	NC_017268	A	6	6	548405	548410	100 %	0 %	0 %	0 %	384422022
11551	NC_017268	GCT	2	6	548427	548432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422022
11552	NC_017268	TAC	2	6	548434	548439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422022
11553	NC_017268	AGGA	2	8	548524	548531	50 %	0 %	50 %	0 %	384422022
11554	NC_017268	GC	3	6	548538	548543	0 %	0 %	50 %	50 %	384422022
11555	NC_017268	TCTG	2	8	548553	548560	0 %	50 %	25 %	25 %	384422022
11556	NC_017268	GTG	2	6	548627	548632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422022
11557	NC_017268	GCTC	2	8	548660	548667	0 %	25 %	25 %	50 %	384422022
11558	NC_017268	ACC	2	6	548669	548674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422022
11559	NC_017268	CGC	2	6	548867	548872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422023
11560	NC_017268	GCAG	2	8	548889	548896	25 %	0 %	50 %	25 %	384422023
11561	NC_017268	GGT	2	6	548916	548921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422023
11562	NC_017268	GT	3	6	548924	548929	0 %	50 %	50 %	0 %	384422023
11563	NC_017268	CCT	2	6	548978	548983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422023
11564	NC_017268	CGTG	2	8	548996	549003	0 %	25 %	50 %	25 %	384422023
11565	NC_017268	TTC	2	6	549021	549026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422023
11566	NC_017268	GTT	2	6	549033	549038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422023
11567	NC_017268	GC	3	6	549170	549175	0 %	0 %	50 %	50 %	384422023
11568	NC_017268	ACG	2	6	549223	549228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422023
11569	NC_017268	ATTC	2	8	549258	549265	25 %	50 %	0 %	25 %	384422023
11570	NC_017268	TGC	2	6	549338	549343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422023
11571	NC_017268	GCT	2	6	549444	549449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422023
11572	NC_017268	TGA	2	6	549470	549475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422023
11573	NC_017268	CGCT	2	8	549488	549495	0 %	25 %	25 %	50 %	384422023
11574	NC_017268	GGA	2	6	549554	549559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422023
11575	NC_017268	AGC	2	6	549565	549570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422023
11576	NC_017268	GAA	2	6	549621	549626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422023
11577	NC_017268	TG	3	6	549667	549672	0 %	50 %	50 %	0 %	384422023
11578	NC_017268	AAG	2	6	549714	549719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422023
11579	NC_017268	GCA	2	6	549783	549788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422023
11580	NC_017268	GACG	2	8	549825	549832	25 %	0 %	50 %	25 %	384422023
11581	NC_017268	GC	3	6	549884	549889	0 %	0 %	50 %	50 %	384422023
11582	NC_017268	GGC	2	6	549898	549903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422023
11583	NC_017268	TGT	2	6	549920	549925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422023
11584	NC_017268	AGC	2	6	549934	549939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422023
11585	NC_017268	GC	3	6	549968	549973	0 %	0 %	50 %	50 %	384422023
11586	NC_017268	GCG	2	6	550062	550067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422023
11587	NC_017268	GC	3	6	550133	550138	0 %	0 %	50 %	50 %	384422024
11588	NC_017268	A	7	7	550148	550154	100 %	0 %	0 %	0 %	384422024
11589	NC_017268	CTA	2	6	550162	550167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422024
11590	NC_017268	TTG	3	9	550190	550198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422024
11591	NC_017268	CGT	2	6	550228	550233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422024
11592	NC_017268	TTG	2	6	550262	550267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422024
11593	NC_017268	TCA	2	6	550326	550331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422024
11594	NC_017268	TTG	2	6	550385	550390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422024
11595	NC_017268	TG	3	6	550424	550429	0 %	50 %	50 %	0 %	384422024
11596	NC_017268	GCC	2	6	550435	550440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422024
11597	NC_017268	GT	3	6	550501	550506	0 %	50 %	50 %	0 %	384422024
11598	NC_017268	TGCG	2	8	550565	550572	0 %	25 %	50 %	25 %	384422024
11599	NC_017268	CT	3	6	550687	550692	0 %	50 %	0 %	50 %	384422024
11600	NC_017268	CGT	2	6	550699	550704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422024
11601	NC_017268	TTG	2	6	550721	550726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422024
11602	NC_017268	GAG	2	6	550749	550754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422024
11603	NC_017268	A	8	8	550869	550876	100 %	0 %	0 %	0 %	384422024
11604	NC_017268	GGTA	2	8	550899	550906	25 %	25 %	50 %	0 %	384422024
11605	NC_017268	AGT	2	6	550954	550959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422024
11606	NC_017268	GT	3	6	551032	551037	0 %	50 %	50 %	0 %	384422024
11607	NC_017268	T	6	6	551088	551093	0 %	100 %	0 %	0 %	384422024
11608	NC_017268	ACC	2	6	551131	551136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422024
11609	NC_017268	TAA	2	6	551139	551144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422024
11610	NC_017268	GGA	2	6	551229	551234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422024
11611	NC_017268	TAT	2	6	551295	551300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422024
11612	NC_017268	CATA	2	8	551331	551338	50 %	25 %	0 %	25 %	384422024
11613	NC_017268	C	6	6	551390	551395	0 %	0 %	0 %	100 %	384422024
11614	NC_017268	CTT	2	6	551436	551441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422024
11615	NC_017268	TGC	2	6	551444	551449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422024
11616	NC_017268	A	6	6	551546	551551	100 %	0 %	0 %	0 %	384422024
11617	NC_017268	GGA	2	6	551566	551571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422024
11618	NC_017268	ATGG	2	8	551646	551653	25 %	25 %	50 %	0 %	384422025
11619	NC_017268	CTG	2	6	551701	551706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422025
11620	NC_017268	GAA	2	6	551747	551752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422025
11621	NC_017268	ATGTT	2	10	551758	551767	20 %	60 %	20 %	0 %	384422025
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11986	NC_017268	GA	3	6	569174	569179	50 %	0 %	50 %	0 %	384422036
11987	NC_017268	GAAT	2	8	569202	569209	50 %	25 %	25 %	0 %	384422036
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11990	NC_017268	GC	3	6	569432	569437	0 %	0 %	50 %	50 %	384422038
11991	NC_017268	TTG	2	6	569456	569461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422038
11992	NC_017268	TTC	2	6	569507	569512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422038
11993	NC_017268	GGT	2	6	569533	569538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422038
11994	NC_017268	CT	3	6	569575	569580	0 %	50 %	0 %	50 %	384422038
11995	NC_017268	CA	3	6	569656	569661	50 %	0 %	0 %	50 %	384422038
11996	NC_017268	CTC	2	6	569728	569733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422038
11997	NC_017268	CAT	3	9	569745	569753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422038
11998	NC_017268	ATTTT	2	10	569789	569798	20 %	80 %	0 %	0 %	384422038
11999	NC_017268	TCA	2	6	569906	569911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422038
12000	NC_017268	TCC	2	6	569952	569957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422038

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