MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_017268	CGGGG	2	10	497997	498006	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10503	NC_017268	CG	3	6	498015	498020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10504	NC_017268	CT	3	6	498053	498058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10506	NC_017268	TTC	2	6	498125	498130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_017268	TCC	2	6	498180	498185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10508	NC_017268	GCA	2	6	498196	498201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_017268	CCAG	2	8	498214	498221	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10510	NC_017268	CTC	3	9	498245	498253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10511	NC_017268	GC	3	6	498288	498293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10512	NC_017268	ACC	2	6	498294	498299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10513	NC_017268	C	6	6	498298	498303	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10514	NC_017268	AAG	2	6	498335	498340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_017268	ATT	2	6	498383	498388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421987
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10519	NC_017268	TCC	2	6	498451	498456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421987
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10521	NC_017268	CCT	2	6	498500	498505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421987
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10545	NC_017268	CCT	2	6	498788	498793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421987
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10554	NC_017268	TCC	2	6	498901	498906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421987
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10560	NC_017268	TGC	2	6	499269	499274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421987
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10562	NC_017268	CTG	2	6	499326	499331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421987
10563	NC_017268	CTG	2	6	499335	499340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421987
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10565	NC_017268	AGGA	2	8	499396	499403	50 %	0 %	50 %	0 %	384421987
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10571	NC_017268	A	6	6	499639	499644	100 %	0 %	0 %	0 %	384421988
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10581	NC_017268	GAAA	2	8	500174	500181	75 %	0 %	25 %	0 %	384421988
10582	NC_017268	GCG	2	6	500190	500195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421988
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10588	NC_017268	A	7	7	500392	500398	100 %	0 %	0 %	0 %	384421988
10589	NC_017268	GTT	2	6	500691	500696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421988
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10591	NC_017268	GC	3	6	500735	500740	0 %	0 %	50 %	50 %	384421988
10592	NC_017268	GTG	3	9	500781	500789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421988
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10596	NC_017268	GTT	2	6	500989	500994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421989
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10598	NC_017268	GAAC	2	8	501090	501097	50 %	0 %	25 %	25 %	384421989
10599	NC_017268	AGCA	2	8	501105	501112	50 %	0 %	25 %	25 %	384421989
10600	NC_017268	TG	3	6	501116	501121	0 %	50 %	50 %	0 %	384421989
10601	NC_017268	CTTT	2	8	501170	501177	0 %	75 %	0 %	25 %	384421989
10602	NC_017268	GCA	2	6	501236	501241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421989
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10604	NC_017268	CGA	2	6	501259	501264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421989
10605	NC_017268	GTG	2	6	501275	501280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421989
10606	NC_017268	GCA	2	6	501370	501375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421989
10607	NC_017268	GT	3	6	501434	501439	0 %	50 %	50 %	0 %	384421989
10608	NC_017268	CGG	2	6	501448	501453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421989
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10611	NC_017268	GT	3	6	501773	501778	0 %	50 %	50 %	0 %	384421989
10612	NC_017268	TGCAG	2	10	501798	501807	20 %	20 %	40 %	20 %	384421989
10613	NC_017268	CGT	2	6	501809	501814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421989
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10620	NC_017268	T	6	6	502114	502119	0 %	100 %	0 %	0 %	384421989
10621	NC_017268	TCC	2	6	502158	502163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421989
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