MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_017268	TGC	2	6	430585	430590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421928
9003	NC_017268	GT	3	6	430701	430706	0 %	50 %	50 %	0 %	384421929
9004	NC_017268	AGCGT	2	10	430740	430749	20 %	20 %	40 %	20 %	384421929
9005	NC_017268	A	7	7	430934	430940	100 %	0 %	0 %	0 %	384421930
9006	NC_017268	AC	3	6	430966	430971	50 %	0 %	0 %	50 %	384421930
9007	NC_017268	A	7	7	430991	430997	100 %	0 %	0 %	0 %	384421930
9008	NC_017268	CGA	2	6	431005	431010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421930
9009	NC_017268	TG	3	6	431071	431076	0 %	50 %	50 %	0 %	384421930
9010	NC_017268	GC	3	6	431138	431143	0 %	0 %	50 %	50 %	384421931
9011	NC_017268	GTG	2	6	431168	431173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421931
9012	NC_017268	GAT	2	6	431243	431248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421931
9013	NC_017268	AGG	2	6	431303	431308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421931
9014	NC_017268	CGTG	2	8	431333	431340	0 %	25 %	50 %	25 %	384421931
9015	NC_017268	ATT	2	6	431412	431417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421931
9016	NC_017268	GCGT	2	8	431420	431427	0 %	25 %	50 %	25 %	384421931
9017	NC_017268	CAC	2	6	431461	431466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421931
9018	NC_017268	TGTC	2	8	431494	431501	0 %	50 %	25 %	25 %	384421931
9019	NC_017268	TGCG	2	8	431518	431525	0 %	25 %	50 %	25 %	384421931
9020	NC_017268	GTG	2	6	431541	431546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421931
9021	NC_017268	GTG	2	6	431550	431555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421931
9022	NC_017268	GT	4	8	431672	431679	0 %	50 %	50 %	0 %	384421931
9023	NC_017268	TGCG	2	8	431686	431693	0 %	25 %	50 %	25 %	384421931
9024	NC_017268	GC	3	6	431766	431771	0 %	0 %	50 %	50 %	384421931
9025	NC_017268	TGCTCG	2	12	431806	431817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421931
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9029	NC_017268	GCA	2	6	432017	432022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421931
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9031	NC_017268	GTGC	2	8	432079	432086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9032	NC_017268	TG	4	8	432089	432096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_017268	TG	3	6	432099	432104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_017268	AG	3	6	432118	432123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_017268	TGC	2	6	432141	432146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_017268	GC	3	6	432265	432270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9037	NC_017268	TGCG	2	8	432275	432282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9038	NC_017268	GTGCG	2	10	432287	432296	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9039	NC_017268	CGT	2	6	432307	432312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_017268	T	9	9	432346	432354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_017268	CGCGC	2	10	432372	432381	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9042	NC_017268	AGA	2	6	432396	432401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_017268	GGC	2	6	432503	432508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9044	NC_017268	TCC	2	6	432540	432545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9045	NC_017268	G	6	6	432566	432571	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_017268	GC	3	6	432573	432578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9047	NC_017268	GAG	2	6	432604	432609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_017268	GAA	2	6	432676	432681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_017268	GC	3	6	432719	432724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9050	NC_017268	GCA	2	6	432727	432732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_017268	TG	3	6	432748	432753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_017268	AGA	2	6	433090	433095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421932
9053	NC_017268	A	7	7	433161	433167	100 %	0 %	0 %	0 %	384421932
9054	NC_017268	GAA	2	6	433193	433198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421932
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9058	NC_017268	GCA	2	6	433388	433393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421932
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9060	NC_017268	GAA	2	6	433629	433634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421932
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9063	NC_017268	GCA	3	9	433718	433726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421932
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9065	NC_017268	TAC	2	6	433883	433888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421932
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9069	NC_017268	GATG	2	8	434054	434061	25 %	25 %	50 %	0 %	384421932
9070	NC_017268	AG	3	6	434082	434087	50 %	0 %	50 %	0 %	384421932
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9093	NC_017268	GACAG	2	10	435071	435080	40 %	0 %	40 %	20 %	384421932
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9099	NC_017268	GAG	2	6	435456	435461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421932
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9107	NC_017268	TTG	2	6	435825	435830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421932
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9109	NC_017268	CAAA	2	8	436030	436037	75 %	0 %	0 %	25 %	384421932
9110	NC_017268	GCC	2	6	436055	436060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421932
9111	NC_017268	GAC	2	6	436110	436115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421932
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9113	NC_017268	GC	3	6	436204	436209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9114	NC_017268	CG	4	8	436211	436218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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9116	NC_017268	T	6	6	436253	436258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_017268	GC	3	6	436273	436278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9118	NC_017268	GT	3	6	436281	436286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_017268	GC	3	6	436290	436295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9120	NC_017268	CGCT	2	8	436366	436373	0 %	25 %	25 %	50 %	384421933
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9125	NC_017268	CGG	2	6	436490	436495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421933
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