MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_017268	CGT	2	6	407166	407171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421904
8502	NC_017268	ACC	2	6	407172	407177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421904
8503	NC_017268	AAT	2	6	407234	407239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421904
8504	NC_017268	GATG	2	8	407372	407379	25 %	25 %	50 %	0 %	384421904
8505	NC_017268	T	6	6	407395	407400	0 %	100 %	0 %	0 %	384421904
8506	NC_017268	CA	3	6	407401	407406	50 %	0 %	0 %	50 %	384421904
8507	NC_017268	TG	3	6	407547	407552	0 %	50 %	50 %	0 %	384421904
8508	NC_017268	CGA	2	6	407560	407565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421904
8509	NC_017268	GCT	2	6	407574	407579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421904
8510	NC_017268	ACA	2	6	407627	407632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421904
8511	NC_017268	AGG	3	9	407648	407656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421904
8512	NC_017268	GA	3	6	407668	407673	50 %	0 %	50 %	0 %	384421904
8513	NC_017268	TCA	2	6	407718	407723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421904
8514	NC_017268	GC	3	6	407852	407857	0 %	0 %	50 %	50 %	384421904
8515	NC_017268	GGC	2	6	407933	407938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421904
8516	NC_017268	TG	3	6	407953	407958	0 %	50 %	50 %	0 %	384421904
8517	NC_017268	CGT	2	6	407993	407998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421904
8518	NC_017268	ATC	2	6	408105	408110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421904
8519	NC_017268	GAGT	2	8	408154	408161	25 %	25 %	50 %	0 %	384421904
8520	NC_017268	TGC	2	6	408224	408229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421904
8521	NC_017268	GAT	2	6	408278	408283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421904
8522	NC_017268	GC	3	6	408360	408365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8523	NC_017268	CCA	2	6	408373	408378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8524	NC_017268	AGC	2	6	408442	408447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421905
8525	NC_017268	TTC	2	6	408467	408472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421905
8526	NC_017268	TTGGC	2	10	408477	408486	0 %	40 %	40 %	20 %	384421905
8527	NC_017268	GTAG	2	8	408494	408501	25 %	25 %	50 %	0 %	384421905
8528	NC_017268	CAG	2	6	408537	408542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421905
8529	NC_017268	A	7	7	408552	408558	100 %	0 %	0 %	0 %	384421905
8530	NC_017268	TGC	2	6	408645	408650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421905
8531	NC_017268	AGA	2	6	408655	408660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421905
8532	NC_017268	CAG	2	6	408846	408851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421905
8533	NC_017268	CGG	2	6	408868	408873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421905
8534	NC_017268	TGA	2	6	408875	408880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421905
8535	NC_017268	CA	3	6	408965	408970	50 %	0 %	0 %	50 %	384421905
8536	NC_017268	A	7	7	408988	408994	100 %	0 %	0 %	0 %	384421905
8537	NC_017268	CG	4	8	409008	409015	0 %	0 %	50 %	50 %	384421905
8538	NC_017268	AGC	2	6	409033	409038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421905
8539	NC_017268	AGC	2	6	409057	409062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421905
8540	NC_017268	GAA	2	6	409079	409084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421905
8541	NC_017268	CGAC	2	8	409088	409095	25 %	0 %	25 %	50 %	384421905
8542	NC_017268	C	13	13	409171	409183	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8543	NC_017268	AAG	2	6	409263	409268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421906
8544	NC_017268	AGGG	2	8	409281	409288	25 %	0 %	75 %	0 %	384421906
8545	NC_017268	ATGT	2	8	409290	409297	25 %	50 %	25 %	0 %	384421906
8546	NC_017268	GGA	2	6	409359	409364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421906
8547	NC_017268	GGA	2	6	409399	409404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421907
8548	NC_017268	GC	3	6	409466	409471	0 %	0 %	50 %	50 %	384421907
8549	NC_017268	CCTG	2	8	409524	409531	0 %	25 %	25 %	50 %	384421907
8550	NC_017268	TTC	2	6	409564	409569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421907
8551	NC_017268	TGC	2	6	409617	409622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421907
8552	NC_017268	AGG	2	6	409644	409649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421907
8553	NC_017268	CG	3	6	409661	409666	0 %	0 %	50 %	50 %	384421907
8554	NC_017268	CCTT	2	8	409685	409692	0 %	50 %	0 %	50 %	384421907
8555	NC_017268	GCC	2	6	409703	409708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421907
8556	NC_017268	CG	4	8	409763	409770	0 %	0 %	50 %	50 %	384421907
8557	NC_017268	CA	3	6	409864	409869	50 %	0 %	0 %	50 %	384421908
8558	NC_017268	AGG	2	6	409874	409879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421908
8559	NC_017268	GTT	2	6	409959	409964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421908
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8561	NC_017268	GGGGCG	2	12	410014	410025	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	384421908
8562	NC_017268	T	6	6	410026	410031	0 %	100 %	0 %	0 %	384421908
8563	NC_017268	AC	4	8	410058	410065	50 %	0 %	0 %	50 %	384421908
8564	NC_017268	GC	3	6	410143	410148	0 %	0 %	50 %	50 %	384421908
8565	NC_017268	GGT	2	6	410186	410191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421908
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8567	NC_017268	GCAG	2	8	410295	410302	25 %	0 %	50 %	25 %	384421908
8568	NC_017268	T	6	6	410325	410330	0 %	100 %	0 %	0 %	384421908
8569	NC_017268	G	6	6	410339	410344	0 %	0 %	100 %	0 %	384421908
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8572	NC_017268	T	6	6	410464	410469	0 %	100 %	0 %	0 %	384421908
8573	NC_017268	CG	3	6	410490	410495	0 %	0 %	50 %	50 %	384421908
8574	NC_017268	GC	3	6	410516	410521	0 %	0 %	50 %	50 %	384421908
8575	NC_017268	GC	4	8	410548	410555	0 %	0 %	50 %	50 %	384421908
8576	NC_017268	GC	3	6	410572	410577	0 %	0 %	50 %	50 %	384421908
8577	NC_017268	GTG	2	6	410578	410583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421908
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8582	NC_017268	AGGAT	2	10	410786	410795	40 %	20 %	40 %	0 %	384421908
8583	NC_017268	GCG	2	6	410864	410869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421908
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8586	NC_017268	TGC	2	6	410928	410933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421908
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8588	NC_017268	AGC	2	6	411023	411028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8589	NC_017268	GTT	2	6	411081	411086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421909
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8591	NC_017268	GTG	2	6	411160	411165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421909
8592	NC_017268	ACG	2	6	411173	411178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421909
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8595	NC_017268	TGA	2	6	411367	411372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421909
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8597	NC_017268	GTG	2	6	411489	411494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421910
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8601	NC_017268	CG	3	6	411749	411754	0 %	0 %	50 %	50 %	384421910
8602	NC_017268	GGT	2	6	411775	411780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421910
8603	NC_017268	T	6	6	411830	411835	0 %	100 %	0 %	0 %	384421910
8604	NC_017268	GTGC	2	8	411836	411843	0 %	25 %	50 %	25 %	384421910
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8607	NC_017268	CGCT	2	8	411900	411907	0 %	25 %	25 %	50 %	384421910
8608	NC_017268	GCA	2	6	411976	411981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421910
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8610	NC_017268	T	6	6	412008	412013	0 %	100 %	0 %	0 %	384421910
8611	NC_017268	CGA	2	6	412048	412053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421910
8612	NC_017268	G	7	7	412111	412117	0 %	0 %	100 %	0 %	384421910
8613	NC_017268	CTG	2	6	412266	412271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421910
8614	NC_017268	GT	3	6	412328	412333	0 %	50 %	50 %	0 %	384421910
8615	NC_017268	GCG	2	6	412388	412393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421910
8616	NC_017268	TG	3	6	412401	412406	0 %	50 %	50 %	0 %	384421910
8617	NC_017268	GT	4	8	412490	412497	0 %	50 %	50 %	0 %	384421910
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8623	NC_017268	T	6	6	412884	412889	0 %	100 %	0 %	0 %	384421911
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8998	NC_017268	TGCG	2	8	430099	430106	0 %	25 %	50 %	25 %	384421928
8999	NC_017268	CTT	2	6	430208	430213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421928
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