MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_017268	AGG	2	6	338614	338619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421847
7003	NC_017268	GC	3	6	338642	338647	0 %	0 %	50 %	50 %	384421847
7004	NC_017268	CG	3	6	338691	338696	0 %	0 %	50 %	50 %	384421847
7005	NC_017268	G	7	7	338754	338760	0 %	0 %	100 %	0 %	384421847
7006	NC_017268	CTC	2	6	338768	338773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421847
7007	NC_017268	GA	3	6	338835	338840	50 %	0 %	50 %	0 %	384421847
7008	NC_017268	A	6	6	338909	338914	100 %	0 %	0 %	0 %	384421847
7009	NC_017268	A	7	7	338927	338933	100 %	0 %	0 %	0 %	384421847
7010	NC_017268	GCT	2	6	338994	338999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421848
7011	NC_017268	GGT	2	6	339042	339047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421848
7012	NC_017268	GTG	2	6	339175	339180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421848
7013	NC_017268	GT	4	8	339289	339296	0 %	50 %	50 %	0 %	384421848
7014	NC_017268	CTTT	3	12	339319	339330	0 %	75 %	0 %	25 %	384421848
7015	NC_017268	GCG	2	6	339340	339345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421848
7016	NC_017268	GGA	2	6	339367	339372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421848
7017	NC_017268	GC	3	6	339399	339404	0 %	0 %	50 %	50 %	384421848
7018	NC_017268	GGT	3	9	339423	339431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421848
7019	NC_017268	TC	3	6	339552	339557	0 %	50 %	0 %	50 %	384421848
7020	NC_017268	AAC	2	6	339642	339647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421848
7021	NC_017268	GGC	2	6	339716	339721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421848
7022	NC_017268	GTAT	2	8	339749	339756	25 %	50 %	25 %	0 %	384421848
7023	NC_017268	GT	3	6	339770	339775	0 %	50 %	50 %	0 %	384421848
7024	NC_017268	CGGG	2	8	339801	339808	0 %	0 %	75 %	25 %	384421848
7025	NC_017268	TGG	2	6	339857	339862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421848
7026	NC_017268	GT	4	8	339882	339889	0 %	50 %	50 %	0 %	384421848
7027	NC_017268	CGG	2	6	339891	339896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421848
7028	NC_017268	GCT	2	6	339900	339905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421848
7029	NC_017268	GC	3	6	339915	339920	0 %	0 %	50 %	50 %	384421848
7030	NC_017268	AGG	2	6	339956	339961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421848
7031	NC_017268	ATT	2	6	339985	339990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421848
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7033	NC_017268	TGG	2	6	340078	340083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421849
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7035	NC_017268	GAGCG	2	10	340143	340152	20 %	0 %	60 %	20 %	384421849
7036	NC_017268	TGA	2	6	340180	340185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421849
7037	NC_017268	GCT	2	6	340242	340247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421849
7038	NC_017268	TGGCA	2	10	340268	340277	20 %	20 %	40 %	20 %	384421849
7039	NC_017268	GTT	2	6	340295	340300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421849
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7041	NC_017268	TG	3	6	340363	340368	0 %	50 %	50 %	0 %	384421849
7042	NC_017268	T	7	7	340384	340390	0 %	100 %	0 %	0 %	384421849
7043	NC_017268	GCA	2	6	340409	340414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421849
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7045	NC_017268	T	6	6	340460	340465	0 %	100 %	0 %	0 %	384421849
7046	NC_017268	TAG	2	6	340537	340542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421849
7047	NC_017268	GTAC	2	8	340553	340560	25 %	25 %	25 %	25 %	384421849
7048	NC_017268	CGTG	2	8	340586	340593	0 %	25 %	50 %	25 %	384421849
7049	NC_017268	GT	3	6	340636	340641	0 %	50 %	50 %	0 %	384421849
7050	NC_017268	GCG	2	6	340656	340661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421849
7051	NC_017268	GGC	2	6	340692	340697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421849
7052	NC_017268	GTT	2	6	340871	340876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421849
7053	NC_017268	GC	3	6	340903	340908	0 %	0 %	50 %	50 %	384421849
7054	NC_017268	TGC	2	6	340933	340938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421849
7055	NC_017268	GGC	2	6	340947	340952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421849
7056	NC_017268	GAA	2	6	341016	341021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_017268	T	6	6	341090	341095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_017268	GCTGTG	2	12	341110	341121	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384421850
7059	NC_017268	CTTC	2	8	341122	341129	0 %	50 %	0 %	50 %	384421850
7060	NC_017268	GTGCTC	2	12	341161	341172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421850
7061	NC_017268	GCA	2	6	341211	341216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421850
7062	NC_017268	TGGCT	2	10	341242	341251	0 %	40 %	40 %	20 %	384421850
7063	NC_017268	GAG	2	6	341257	341262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421850
7064	NC_017268	TC	4	8	341290	341297	0 %	50 %	0 %	50 %	384421850
7065	NC_017268	TGTTCG	2	12	341331	341342	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384421850
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7067	NC_017268	ACCGTC	2	12	341483	341494	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384421850
7068	NC_017268	GAAA	2	8	341499	341506	75 %	0 %	25 %	0 %	384421850
7069	NC_017268	CG	3	6	341620	341625	0 %	0 %	50 %	50 %	384421850
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7071	NC_017268	CGT	2	6	341771	341776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421850
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7073	NC_017268	GTA	2	6	342224	342229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421850
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7085	NC_017268	CT	4	8	343043	343050	0 %	50 %	0 %	50 %	384421850
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7095	NC_017268	GCGT	2	8	343686	343693	0 %	25 %	50 %	25 %	384421850
7096	NC_017268	CAC	2	6	343701	343706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421850
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7101	NC_017268	CAG	2	6	344059	344064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421850
7102	NC_017268	TTG	2	6	344090	344095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421850
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7104	NC_017268	GC	3	6	344188	344193	0 %	0 %	50 %	50 %	384421850
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7107	NC_017268	TAG	2	6	344285	344290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421850
7108	NC_017268	GCA	2	6	344297	344302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421850
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7110	NC_017268	GGT	2	6	344394	344399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421850
7111	NC_017268	CGC	2	6	344504	344509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421850
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7114	NC_017268	T	6	6	344553	344558	0 %	100 %	0 %	0 %	384421850
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7117	NC_017268	T	7	7	344791	344797	0 %	100 %	0 %	0 %	384421850
7118	NC_017268	TTTCG	2	10	344873	344882	0 %	60 %	20 %	20 %	384421850
7119	NC_017268	CCG	2	6	344986	344991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421850
7120	NC_017268	GGT	2	6	345027	345032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421850
7121	NC_017268	GGA	2	6	345123	345128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421850
7122	NC_017268	TTTGGA	2	12	345144	345155	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384421850
7123	NC_017268	GCA	2	6	345221	345226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421850
7124	NC_017268	CCTC	2	8	345260	345267	0 %	25 %	0 %	75 %	384421850
7125	NC_017268	CGT	2	6	345277	345282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421850
7126	NC_017268	GCT	2	6	345309	345314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421850
7127	NC_017268	AAT	2	6	345346	345351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421850
7128	NC_017268	CCGG	2	8	345390	345397	0 %	0 %	50 %	50 %	384421850
7129	NC_017268	T	7	7	345424	345430	0 %	100 %	0 %	0 %	384421850
7130	NC_017268	A	6	6	345555	345560	100 %	0 %	0 %	0 %	384421851
7131	NC_017268	GTT	2	6	345583	345588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421851
7132	NC_017268	AT	3	6	345674	345679	50 %	50 %	0 %	0 %	384421851
7133	NC_017268	T	6	6	345703	345708	0 %	100 %	0 %	0 %	384421851
7134	NC_017268	TCC	2	6	345931	345936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421851
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7137	NC_017268	GTG	2	6	346065	346070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421851
7138	NC_017268	TGT	2	6	346103	346108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421851
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7141	NC_017268	T	6	6	346187	346192	0 %	100 %	0 %	0 %	384421851
7142	NC_017268	GGC	2	6	346235	346240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421851
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7144	NC_017268	CG	3	6	346277	346282	0 %	0 %	50 %	50 %	384421851
7145	NC_017268	A	7	7	346311	346317	100 %	0 %	0 %	0 %	384421851
7146	NC_017268	TGG	2	6	346357	346362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421851
7147	NC_017268	CGG	2	6	346382	346387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421851
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7152	NC_017268	CGG	2	6	346567	346572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421851
7153	NC_017268	GGT	2	6	346598	346603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421851
7154	NC_017268	GAGCGC	2	12	346605	346616	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384421851
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7156	NC_017268	TGC	2	6	346684	346689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421851
7157	NC_017268	TCG	2	6	346764	346769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421851
7158	NC_017268	TGG	2	6	346807	346812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421851
7159	NC_017268	GGA	2	6	346829	346834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421851
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7162	NC_017268	GAA	2	6	346923	346928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421851
7163	NC_017268	T	6	6	346934	346939	0 %	100 %	0 %	0 %	384421851
7164	NC_017268	CTTTGA	2	12	347048	347059	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384421851
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7166	NC_017268	GC	3	6	347209	347214	0 %	0 %	50 %	50 %	384421851
7167	NC_017268	G	7	7	347262	347268	0 %	0 %	100 %	0 %	384421851
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7174	NC_017268	CTG	2	6	347724	347729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421851
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7177	NC_017268	AGTC	2	8	347823	347830	25 %	25 %	25 %	25 %	384421851
7178	NC_017268	CAG	2	6	347852	347857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421851
7179	NC_017268	CAG	4	12	347861	347872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421851
7180	NC_017268	TAG	3	9	347873	347881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421851
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7185	NC_017268	CCA	2	6	348100	348105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7189	NC_017268	TGA	2	6	348307	348312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421852
7190	NC_017268	A	8	8	348330	348337	100 %	0 %	0 %	0 %	384421852
7191	NC_017268	GCA	2	6	348352	348357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421852
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7199	NC_017268	CA	3	6	348980	348985	50 %	0 %	0 %	50 %	384421853
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7227	NC_017268	TCA	2	6	350560	350565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421853
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7229	NC_017268	T	6	6	350686	350691	0 %	100 %	0 %	0 %	384421853
7230	NC_017268	GC	3	6	350718	350723	0 %	0 %	50 %	50 %	384421853
7231	NC_017268	CTT	2	6	350735	350740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421853
7232	NC_017268	CA	3	6	350761	350766	50 %	0 %	0 %	50 %	384421853
7233	NC_017268	GCA	2	6	350775	350780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421853
7234	NC_017268	GCAG	2	8	350852	350859	25 %	0 %	50 %	25 %	384421853
7235	NC_017268	CAT	2	6	350877	350882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421853
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7238	NC_017268	CG	3	6	351084	351089	0 %	0 %	50 %	50 %	384421853
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7241	NC_017268	GC	3	6	351214	351219	0 %	0 %	50 %	50 %	384421853
7242	NC_017268	GT	3	6	351223	351228	0 %	50 %	50 %	0 %	384421853
7243	NC_017268	AAG	2	6	351247	351252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421853
7244	NC_017268	CG	3	6	351323	351328	0 %	0 %	50 %	50 %	384421853
7245	NC_017268	GCA	2	6	351359	351364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421853
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7372	NC_017268	AC	3	6	357506	357511	50 %	0 %	0 %	50 %	384421857
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