MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 23978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_017268	GCA	2	6	315663	315668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421834
6503	NC_017268	GCCG	2	8	315690	315697	0 %	0 %	50 %	50 %	384421834
6504	NC_017268	TAG	2	6	315716	315721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421834
6505	NC_017268	T	8	8	315738	315745	0 %	100 %	0 %	0 %	384421834
6506	NC_017268	TG	3	6	315834	315839	0 %	50 %	50 %	0 %	384421834
6507	NC_017268	T	7	7	315880	315886	0 %	100 %	0 %	0 %	384421834
6508	NC_017268	CA	3	6	315974	315979	50 %	0 %	0 %	50 %	384421834
6509	NC_017268	TGGA	2	8	316015	316022	25 %	25 %	50 %	0 %	384421834
6510	NC_017268	GGC	2	6	316086	316091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421834
6511	NC_017268	GCG	2	6	316140	316145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421834
6512	NC_017268	T	6	6	316181	316186	0 %	100 %	0 %	0 %	384421834
6513	NC_017268	CAT	2	6	316246	316251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421834
6514	NC_017268	CAC	2	6	316277	316282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6515	NC_017268	GCA	2	6	316305	316310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421835
6516	NC_017268	GCA	2	6	316326	316331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421835
6517	NC_017268	GT	4	8	316461	316468	0 %	50 %	50 %	0 %	384421835
6518	NC_017268	T	6	6	316485	316490	0 %	100 %	0 %	0 %	384421835
6519	NC_017268	CGCGG	2	10	316823	316832	0 %	0 %	60 %	40 %	384421835
6520	NC_017268	GT	3	6	316863	316868	0 %	50 %	50 %	0 %	384421835
6521	NC_017268	GT	3	6	316872	316877	0 %	50 %	50 %	0 %	384421835
6522	NC_017268	G	6	6	316880	316885	0 %	0 %	100 %	0 %	384421835
6523	NC_017268	GTAC	2	8	316906	316913	25 %	25 %	25 %	25 %	384421835
6524	NC_017268	GCAG	2	8	316929	316936	25 %	0 %	50 %	25 %	384421835
6525	NC_017268	GAT	2	6	316979	316984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421835
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6527	NC_017268	TG	3	6	316989	316994	0 %	50 %	50 %	0 %	384421835
6528	NC_017268	CGG	2	6	316996	317001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421835
6529	NC_017268	T	7	7	317005	317011	0 %	100 %	0 %	0 %	384421835
6530	NC_017268	TG	3	6	317029	317034	0 %	50 %	50 %	0 %	384421835
6531	NC_017268	GTG	2	6	317055	317060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421835
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6534	NC_017268	CTT	2	6	317166	317171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421835
6535	NC_017268	CCGT	2	8	317248	317255	0 %	25 %	25 %	50 %	384421836
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6537	NC_017268	T	6	6	317393	317398	0 %	100 %	0 %	0 %	384421836
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6542	NC_017268	AAT	2	6	317629	317634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421836
6543	NC_017268	TGC	2	6	317644	317649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421836
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6545	NC_017268	GTT	2	6	317674	317679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421836
6546	NC_017268	GTATGG	2	12	317735	317746	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384421836
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6552	NC_017268	GC	3	6	317892	317897	0 %	0 %	50 %	50 %	384421836
6553	NC_017268	GCG	2	6	317903	317908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421836
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6555	NC_017268	G	6	6	317932	317937	0 %	0 %	100 %	0 %	384421836
6556	NC_017268	ACGT	2	8	317992	317999	25 %	25 %	25 %	25 %	384421836
6557	NC_017268	GT	3	6	318048	318053	0 %	50 %	50 %	0 %	384421836
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6560	NC_017268	CGT	2	6	318227	318232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421836
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6563	NC_017268	CTGA	2	8	318397	318404	25 %	25 %	25 %	25 %	384421836
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6573	NC_017268	TG	3	6	318810	318815	0 %	50 %	50 %	0 %	384421836
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6591	NC_017268	TAA	2	6	319823	319828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421837
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6594	NC_017268	C	6	6	319873	319878	0 %	0 %	0 %	100 %	384421837
6595	NC_017268	GTT	2	6	319879	319884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421837
6596	NC_017268	GCA	2	6	319888	319893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421837
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6598	NC_017268	CAGG	2	8	319921	319928	25 %	0 %	50 %	25 %	384421837
6599	NC_017268	A	6	6	319960	319965	100 %	0 %	0 %	0 %	384421837
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6602	NC_017268	GT	3	6	320210	320215	0 %	50 %	50 %	0 %	384421837
6603	NC_017268	GCT	2	6	320230	320235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421837
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6606	NC_017268	CGC	2	6	320417	320422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421837
6607	NC_017268	CTG	2	6	320526	320531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421837
6608	NC_017268	GCA	2	6	320549	320554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421837
6609	NC_017268	ACC	2	6	320570	320575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421837
6610	NC_017268	C	7	7	320586	320592	0 %	0 %	0 %	100 %	384421837
6611	NC_017268	CGT	2	6	320634	320639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421837
6612	NC_017268	GA	3	6	320652	320657	50 %	0 %	50 %	0 %	384421837
6613	NC_017268	CG	3	6	320748	320753	0 %	0 %	50 %	50 %	384421837
6614	NC_017268	CAT	2	6	320761	320766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421837
6615	NC_017268	GTC	2	6	320773	320778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421837
6616	NC_017268	AAT	2	6	320821	320826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421837
6617	NC_017268	AAGC	2	8	320999	321006	50 %	0 %	25 %	25 %	384421837
6618	NC_017268	GT	4	8	321049	321056	0 %	50 %	50 %	0 %	384421837
6619	NC_017268	GTGC	2	8	321073	321080	0 %	25 %	50 %	25 %	384421837
6620	NC_017268	GCTC	2	8	321081	321088	0 %	25 %	25 %	50 %	384421837
6621	NC_017268	CGTC	2	8	321122	321129	0 %	25 %	25 %	50 %	384421837
6622	NC_017268	GAT	2	6	321144	321149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421837
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6624	NC_017268	ACGGTC	2	12	321217	321228	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384421837
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