MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 24018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016848	CA	3	6	148009	148014	50 %	0 %	0 %	50 %	378981605
3002	NC_016848	CGC	2	6	148032	148037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981605
3003	NC_016848	GTC	2	6	148092	148097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981605
3004	NC_016848	CGC	2	6	148176	148181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981605
3005	NC_016848	AGT	2	6	148182	148187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981605
3006	NC_016848	CAC	2	6	148264	148269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981605
3007	NC_016848	TCG	2	6	148316	148321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_016848	C	9	9	148340	148348	0 %	0 %	0 %	100 %	378981606
3009	NC_016848	GTTC	2	8	148378	148385	0 %	50 %	25 %	25 %	378981606
3010	NC_016848	CG	3	6	148387	148392	0 %	0 %	50 %	50 %	378981606
3011	NC_016848	GCA	2	6	148397	148402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981606
3012	NC_016848	CG	3	6	148403	148408	0 %	0 %	50 %	50 %	378981606
3013	NC_016848	CGGCTG	2	12	148588	148599	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378981606
3014	NC_016848	TTC	2	6	148859	148864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981606
3015	NC_016848	CTTGC	2	10	148894	148903	0 %	40 %	20 %	40 %	378981606
3016	NC_016848	AGC	2	6	148999	149004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981607
3017	NC_016848	GAA	2	6	149044	149049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981607
3018	NC_016848	GGT	2	6	149087	149092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981607
3019	NC_016848	TTC	2	6	149093	149098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981607
3020	NC_016848	GCG	2	6	149107	149112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981607
3021	NC_016848	GC	3	6	149159	149164	0 %	0 %	50 %	50 %	378981607
3022	NC_016848	TCTT	2	8	149258	149265	0 %	75 %	0 %	25 %	378981607
3023	NC_016848	TGC	2	6	149292	149297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981607
3024	NC_016848	GGT	2	6	149341	149346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981607
3025	NC_016848	GCG	2	6	149501	149506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981608
3026	NC_016848	AGC	2	6	149552	149557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981608
3027	NC_016848	TG	3	6	149584	149589	0 %	50 %	50 %	0 %	378981608
3028	NC_016848	GC	3	6	149597	149602	0 %	0 %	50 %	50 %	378981608
3029	NC_016848	CTG	3	9	149612	149620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981608
3030	NC_016848	AGGC	2	8	149658	149665	25 %	0 %	50 %	25 %	378981608
3031	NC_016848	TCC	2	6	149690	149695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981608
3032	NC_016848	CCA	2	6	149715	149720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981608
3033	NC_016848	GTC	2	6	149747	149752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981608
3034	NC_016848	GTG	2	6	149766	149771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981608
3035	NC_016848	GCA	3	9	149817	149825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981608
3036	NC_016848	GTTT	2	8	149946	149953	0 %	75 %	25 %	0 %	378981609
3037	NC_016848	TAC	2	6	150055	150060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981609
3038	NC_016848	TGT	2	6	150116	150121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981609
3039	NC_016848	GT	3	6	150171	150176	0 %	50 %	50 %	0 %	378981609
3040	NC_016848	G	9	9	150203	150211	0 %	0 %	100 %	0 %	378981609
3041	NC_016848	ACT	2	6	150296	150301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981610
3042	NC_016848	CGGA	2	8	150494	150501	25 %	0 %	50 %	25 %	378981610
3043	NC_016848	GTT	2	6	150588	150593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_016848	GGCTGG	2	12	150594	150605	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3045	NC_016848	TCGGGC	2	12	150609	150620	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_016848	GTAC	2	8	150645	150652	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3047	NC_016848	GCT	2	6	150688	150693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_016848	TCC	2	6	150722	150727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981611
3049	NC_016848	T	6	6	150795	150800	0 %	100 %	0 %	0 %	378981611
3050	NC_016848	GC	3	6	150816	150821	0 %	0 %	50 %	50 %	378981611
3051	NC_016848	GAC	2	6	150870	150875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981611
3052	NC_016848	GCA	2	6	150886	150891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981611
3053	NC_016848	GCTT	2	8	150892	150899	0 %	50 %	25 %	25 %	378981611
3054	NC_016848	CCG	2	6	150907	150912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981611
3055	NC_016848	CTG	2	6	150932	150937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981611
3056	NC_016848	GTTTG	2	10	150948	150957	0 %	60 %	40 %	0 %	378981611
3057	NC_016848	G	6	6	150976	150981	0 %	0 %	100 %	0 %	378981611
3058	NC_016848	TCC	2	6	151006	151011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981611
3059	NC_016848	CCA	2	6	151031	151036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981611
3060	NC_016848	T	7	7	151037	151043	0 %	100 %	0 %	0 %	378981611
3061	NC_016848	GCGG	2	8	151140	151147	0 %	0 %	75 %	25 %	378981612
3062	NC_016848	GTC	2	6	151244	151249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981612
3063	NC_016848	CGGCTC	2	12	151267	151278	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378981612
3064	NC_016848	T	6	6	151300	151305	0 %	100 %	0 %	0 %	378981612
3065	NC_016848	GC	3	6	151321	151326	0 %	0 %	50 %	50 %	378981612
3066	NC_016848	GCA	3	9	151370	151378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981612
3067	NC_016848	T	6	6	151381	151386	0 %	100 %	0 %	0 %	378981612
3068	NC_016848	CCG	2	6	151394	151399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981612
3069	NC_016848	GAC	2	6	151426	151431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981612
3070	NC_016848	CCA	2	6	151482	151487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981612
3071	NC_016848	TCTT	2	8	151576	151583	0 %	75 %	0 %	25 %	378981613
3072	NC_016848	GTT	2	6	151778	151783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_016848	CTGCGG	4	24	151786	151809	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_016848	CG	3	6	151862	151867	0 %	0 %	50 %	50 %	378981615
3075	NC_016848	AGC	2	6	151905	151910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981615
3076	NC_016848	AGC	2	6	151914	151919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981615
3077	NC_016848	CCG	2	6	151945	151950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981615
3078	NC_016848	CTG	2	6	151967	151972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981615
3079	NC_016848	TG	3	6	152037	152042	0 %	50 %	50 %	0 %	378981615
3080	NC_016848	CCT	2	6	152043	152048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981615
3081	NC_016848	CCA	2	6	152067	152072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981615
3082	NC_016848	CA	3	6	152128	152133	50 %	0 %	0 %	50 %	378981615
3083	NC_016848	GCGG	2	8	152258	152265	0 %	0 %	75 %	25 %	378981615
3084	NC_016848	CGGCTC	2	12	152291	152302	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_016848	GCT	2	6	152316	152321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_016848	TGGTTG	2	12	152545	152556	0 %	50 %	50 %	0 %	378981616
3087	NC_016848	TTG	2	6	152564	152569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981616
3088	NC_016848	TG	4	8	152583	152590	0 %	50 %	50 %	0 %	378981616
3089	NC_016848	CAC	2	6	152632	152637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981616
3090	NC_016848	TGA	2	6	152660	152665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981616
3091	NC_016848	TTAT	2	8	152704	152711	25 %	75 %	0 %	0 %	378981616
3092	NC_016848	GGTG	2	8	152777	152784	0 %	25 %	75 %	0 %	378981616
3093	NC_016848	AGA	2	6	152907	152912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981616
3094	NC_016848	CG	3	6	153007	153012	0 %	0 %	50 %	50 %	378981616
3095	NC_016848	TTC	2	6	153019	153024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981616
3096	NC_016848	TGC	2	6	153025	153030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981616
3097	NC_016848	ACC	2	6	153084	153089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981616
3098	NC_016848	CGA	2	6	153104	153109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981616
3099	NC_016848	TGCGC	2	10	153113	153122	0 %	20 %	40 %	40 %	378981616
3100	NC_016848	AGA	2	6	153151	153156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981616
3101	NC_016848	ACA	2	6	153190	153195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378981616
3102	NC_016848	TTG	2	6	153198	153203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981616
3103	NC_016848	CAG	2	6	153213	153218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981616
3104	NC_016848	TGA	2	6	153236	153241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981616
3105	NC_016848	CCT	2	6	153364	153369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981616
3106	NC_016848	TGTTT	2	10	153387	153396	0 %	80 %	20 %	0 %	378981616
3107	NC_016848	TCGT	2	8	153397	153404	0 %	50 %	25 %	25 %	378981616
3108	NC_016848	TGC	2	6	153430	153435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981616
3109	NC_016848	AGC	2	6	153469	153474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981616
3110	NC_016848	GTG	2	6	153535	153540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981616
3111	NC_016848	AGGA	2	8	153568	153575	50 %	0 %	50 %	0 %	378981616
3112	NC_016848	CCGGAG	2	12	153643	153654	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378981616
3113	NC_016848	CA	3	6	153732	153737	50 %	0 %	0 %	50 %	378981616
3114	NC_016848	GGAA	2	8	153791	153798	50 %	0 %	50 %	0 %	378981616
3115	NC_016848	AGA	2	6	153837	153842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981616
3116	NC_016848	CAGCTG	2	12	153867	153878	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378981616
3117	NC_016848	CGG	2	6	153907	153912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981616
3118	NC_016848	GT	3	6	153997	154002	0 %	50 %	50 %	0 %	378981616
3119	NC_016848	TTC	2	6	154006	154011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981616
3120	NC_016848	GAGT	2	8	154058	154065	25 %	25 %	50 %	0 %	378981616
3121	NC_016848	AGC	2	6	154083	154088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981616
3122	NC_016848	CACT	2	8	154134	154141	25 %	25 %	0 %	50 %	378981616
3123	NC_016848	CTC	2	6	154146	154151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_016848	C	9	9	154166	154174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3238	NC_016848	AG	3	6	159065	159070	50 %	0 %	50 %	0 %	378981621
3239	NC_016848	CGGT	3	12	159148	159159	0 %	25 %	50 %	25 %	378981621
3240	NC_016848	A	7	7	159187	159193	100 %	0 %	0 %	0 %	378981621
3241	NC_016848	GGGC	2	8	159223	159230	0 %	0 %	75 %	25 %	378981621
3242	NC_016848	CAG	2	6	159266	159271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981621
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3244	NC_016848	ACGA	2	8	159309	159316	50 %	0 %	25 %	25 %	378981621
3245	NC_016848	ACC	2	6	159345	159350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981621
3246	NC_016848	TCTT	2	8	159385	159392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3247	NC_016848	CTG	2	6	159431	159436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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