MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 24018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_016848	A	6	6	1089888	1089893	100 %	0 %	0 %	0 %	378982498
23003	NC_016848	TTA	2	6	1089924	1089929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982498
23004	NC_016848	TGA	2	6	1089934	1089939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982498
23005	NC_016848	TCA	2	6	1090062	1090067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982498
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23007	NC_016848	TAT	2	6	1090135	1090140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982498
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23012	NC_016848	TGA	2	6	1090303	1090308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982498
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23107	NC_016848	A	6	6	1094296	1094301	100 %	0 %	0 %	0 %	378982502
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23120	NC_016848	CGC	2	6	1094890	1094895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982503
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23123	NC_016848	CAT	2	6	1094986	1094991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982503
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23126	NC_016848	GCA	2	6	1095088	1095093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982503
23127	NC_016848	CA	4	8	1095092	1095099	50 %	0 %	0 %	50 %	378982503
23128	NC_016848	CG	3	6	1095132	1095137	0 %	0 %	50 %	50 %	378982503
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23231	NC_016848	CA	3	6	1100111	1100116	50 %	0 %	0 %	50 %	378982507
23232	NC_016848	CGTA	2	8	1100140	1100147	25 %	25 %	25 %	25 %	378982507
23233	NC_016848	ACTG	2	8	1100236	1100243	25 %	25 %	25 %	25 %	378982507
23234	NC_016848	GCA	2	6	1100275	1100280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982507
23235	NC_016848	GCT	2	6	1100294	1100299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982507
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23237	NC_016848	CTTT	2	8	1100375	1100382	0 %	75 %	0 %	25 %	378982507
23238	NC_016848	ATA	2	6	1100404	1100409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982507
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23243	NC_016848	ATA	2	6	1100796	1100801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982507
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23343	NC_016848	TTC	2	6	1106189	1106194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23344	NC_016848	CG	3	6	1106220	1106225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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23353	NC_016848	TC	3	6	1106648	1106653	0 %	50 %	0 %	50 %	378982513
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23452	NC_016848	AAG	2	6	1111805	1111810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982516
23453	NC_016848	TAT	2	6	1111864	1111869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23454	NC_016848	CTG	2	6	1111880	1111885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23455	NC_016848	CT	3	6	1111926	1111931	0 %	50 %	0 %	50 %	378982517
23456	NC_016848	CA	3	6	1111967	1111972	50 %	0 %	0 %	50 %	378982517
23457	NC_016848	A	6	6	1112007	1112012	100 %	0 %	0 %	0 %	378982517
23458	NC_016848	CA	4	8	1112022	1112029	50 %	0 %	0 %	50 %	378982517
23459	NC_016848	TCC	2	6	1112150	1112155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982518
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23461	NC_016848	AAG	2	6	1112168	1112173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982518
23462	NC_016848	AAAAG	2	10	1112183	1112192	80 %	0 %	20 %	0 %	378982518
23463	NC_016848	GAAA	2	8	1112227	1112234	75 %	0 %	25 %	0 %	378982518
23464	NC_016848	CAG	2	6	1112236	1112241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982518
23465	NC_016848	GAC	2	6	1112248	1112253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982518
23466	NC_016848	AGCTG	2	10	1112265	1112274	20 %	20 %	40 %	20 %	378982518
23467	NC_016848	CTT	2	6	1112293	1112298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982518
23468	NC_016848	CT	3	6	1112314	1112319	0 %	50 %	0 %	50 %	378982518
23469	NC_016848	CG	4	8	1112321	1112328	0 %	0 %	50 %	50 %	378982518
23470	NC_016848	AAG	2	6	1112384	1112389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982518
23471	NC_016848	CTCA	2	8	1112428	1112435	25 %	25 %	0 %	50 %	378982518
23472	NC_016848	TCA	3	9	1112453	1112461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982518
23473	NC_016848	ACG	2	6	1112486	1112491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982518
23474	NC_016848	TCA	2	6	1112501	1112506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982518
23475	NC_016848	AGG	2	6	1112516	1112521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982518
23476	NC_016848	CG	5	10	1112545	1112554	0 %	0 %	50 %	50 %	378982518
23477	NC_016848	TAC	2	6	1112565	1112570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982518
23478	NC_016848	CTG	2	6	1112585	1112590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982518
23479	NC_016848	GAA	2	6	1112635	1112640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982518
23480	NC_016848	CAT	2	6	1112652	1112657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982518
23481	NC_016848	CG	3	6	1112680	1112685	0 %	0 %	50 %	50 %	378982518
23482	NC_016848	AC	3	6	1112723	1112728	50 %	0 %	0 %	50 %	378982518
23483	NC_016848	GTC	2	6	1112737	1112742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982518
23484	NC_016848	GC	3	6	1112776	1112781	0 %	0 %	50 %	50 %	378982518
23485	NC_016848	TC	3	6	1112783	1112788	0 %	50 %	0 %	50 %	378982518
23486	NC_016848	ATCC	2	8	1112815	1112822	25 %	25 %	0 %	50 %	378982518
23487	NC_016848	GC	3	6	1112824	1112829	0 %	0 %	50 %	50 %	378982518
23488	NC_016848	A	6	6	1112870	1112875	100 %	0 %	0 %	0 %	378982518
23489	NC_016848	AGG	2	6	1113002	1113007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982518
23490	NC_016848	TTGCCA	2	12	1113053	1113064	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378982518
23491	NC_016848	TGC	2	6	1113077	1113082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982518
23492	NC_016848	ATGA	2	8	1113157	1113164	50 %	25 %	25 %	0 %	378982518
23493	NC_016848	CAC	2	6	1113196	1113201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982518
23494	NC_016848	GTGTT	2	10	1113216	1113225	0 %	60 %	40 %	0 %	378982518
23495	NC_016848	CTG	2	6	1113260	1113265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982518
23496	NC_016848	TGG	2	6	1113290	1113295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982518
23497	NC_016848	AAC	2	6	1113403	1113408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982518
23498	NC_016848	AG	3	6	1113465	1113470	50 %	0 %	50 %	0 %	378982518
23499	NC_016848	CG	3	6	1113518	1113523	0 %	0 %	50 %	50 %	378982518
23500	NC_016848	GA	3	6	1113559	1113564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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