MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 24018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_016848	ACTGAC	2	12	1017981	1017992	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378982429
21502	NC_016848	TTA	2	6	1018028	1018033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982429
21503	NC_016848	GCA	2	6	1018075	1018080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982429
21504	NC_016848	TGC	2	6	1018190	1018195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982429
21505	NC_016848	CTT	2	6	1018293	1018298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982429
21506	NC_016848	CTG	2	6	1018319	1018324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982429
21507	NC_016848	CAT	2	6	1018325	1018330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982429
21508	NC_016848	TC	3	6	1018332	1018337	0 %	50 %	0 %	50 %	378982429
21509	NC_016848	AGG	2	6	1018362	1018367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982429
21510	NC_016848	CTG	2	6	1018442	1018447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982429
21511	NC_016848	T	6	6	1018450	1018455	0 %	100 %	0 %	0 %	378982429
21512	NC_016848	CG	3	6	1018543	1018548	0 %	0 %	50 %	50 %	378982429
21513	NC_016848	AC	3	6	1018657	1018662	50 %	0 %	0 %	50 %	378982430
21514	NC_016848	TG	3	6	1018760	1018765	0 %	50 %	50 %	0 %	378982430
21515	NC_016848	AAC	2	6	1018767	1018772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982430
21516	NC_016848	G	6	6	1018828	1018833	0 %	0 %	100 %	0 %	378982430
21517	NC_016848	CG	3	6	1018897	1018902	0 %	0 %	50 %	50 %	378982430
21518	NC_016848	TTCT	2	8	1018913	1018920	0 %	75 %	0 %	25 %	378982430
21519	NC_016848	CTCC	2	8	1018927	1018934	0 %	25 %	0 %	75 %	378982430
21520	NC_016848	GC	3	6	1018986	1018991	0 %	0 %	50 %	50 %	378982430
21521	NC_016848	AC	3	6	1018994	1018999	50 %	0 %	0 %	50 %	378982430
21522	NC_016848	ATA	2	6	1019070	1019075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982430
21523	NC_016848	TCT	2	6	1019092	1019097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982430
21524	NC_016848	CAT	2	6	1019119	1019124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982430
21525	NC_016848	GCA	2	6	1019139	1019144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982430
21526	NC_016848	A	6	6	1019255	1019260	100 %	0 %	0 %	0 %	378982430
21527	NC_016848	CCA	2	6	1019262	1019267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982430
21528	NC_016848	ACA	2	6	1019275	1019280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982430
21529	NC_016848	A	7	7	1019383	1019389	100 %	0 %	0 %	0 %	378982430
21530	NC_016848	TCA	2	6	1019391	1019396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982430
21531	NC_016848	CGCA	2	8	1019402	1019409	25 %	0 %	25 %	50 %	378982430
21532	NC_016848	TCT	2	6	1019443	1019448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982430
21533	NC_016848	T	6	6	1019456	1019461	0 %	100 %	0 %	0 %	378982430
21534	NC_016848	GC	3	6	1019481	1019486	0 %	0 %	50 %	50 %	378982430
21535	NC_016848	CTC	2	6	1019686	1019691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21536	NC_016848	T	6	6	1019710	1019715	0 %	100 %	0 %	0 %	378982431
21537	NC_016848	G	6	6	1019732	1019737	0 %	0 %	100 %	0 %	378982431
21538	NC_016848	CCCT	2	8	1019766	1019773	0 %	25 %	0 %	75 %	378982431
21539	NC_016848	CGAT	2	8	1019830	1019837	25 %	25 %	25 %	25 %	378982431
21540	NC_016848	GT	3	6	1019956	1019961	0 %	50 %	50 %	0 %	378982431
21541	NC_016848	CGT	2	6	1019967	1019972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982431
21542	NC_016848	CATC	2	8	1020012	1020019	25 %	25 %	0 %	50 %	378982431
21543	NC_016848	AACGC	2	10	1020096	1020105	40 %	0 %	20 %	40 %	378982431
21544	NC_016848	TCA	2	6	1020115	1020120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982431
21545	NC_016848	TTA	2	6	1020215	1020220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982431
21546	NC_016848	GCT	2	6	1020239	1020244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982431
21547	NC_016848	GCC	2	6	1020305	1020310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982431
21548	NC_016848	CA	4	8	1020458	1020465	50 %	0 %	0 %	50 %	378982431
21549	NC_016848	TGC	2	6	1020487	1020492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982431
21550	NC_016848	ATC	2	6	1020496	1020501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982431
21551	NC_016848	GC	4	8	1020523	1020530	0 %	0 %	50 %	50 %	378982431
21552	NC_016848	AC	3	6	1020588	1020593	50 %	0 %	0 %	50 %	378982431
21553	NC_016848	GCA	2	6	1020617	1020622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982431
21554	NC_016848	GCGCGT	2	12	1020628	1020639	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378982431
21555	NC_016848	A	6	6	1020671	1020676	100 %	0 %	0 %	0 %	378982431
21556	NC_016848	TAA	2	6	1020725	1020730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982431
21557	NC_016848	GC	3	6	1020790	1020795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21558	NC_016848	AGC	2	6	1020828	1020833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21559	NC_016848	CAAC	2	8	1020898	1020905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21560	NC_016848	CTAC	2	8	1020925	1020932	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21561	NC_016848	GCC	2	6	1020980	1020985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982432
21562	NC_016848	CGTG	2	8	1021002	1021009	0 %	25 %	50 %	25 %	378982432
21563	NC_016848	TG	4	8	1021008	1021015	0 %	50 %	50 %	0 %	378982432
21564	NC_016848	TGCG	2	8	1021047	1021054	0 %	25 %	50 %	25 %	378982432
21565	NC_016848	GATT	2	8	1021085	1021092	25 %	50 %	25 %	0 %	378982432
21566	NC_016848	AC	3	6	1021111	1021116	50 %	0 %	0 %	50 %	378982432
21567	NC_016848	TAC	2	6	1021151	1021156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982432
21568	NC_016848	CGT	2	6	1021348	1021353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982432
21569	NC_016848	ACA	2	6	1021370	1021375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982432
21570	NC_016848	AAG	2	6	1021401	1021406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982432
21571	NC_016848	ACC	2	6	1021435	1021440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982432
21572	NC_016848	CAA	2	6	1021482	1021487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982432
21573	NC_016848	CCA	2	6	1021608	1021613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982433
21574	NC_016848	GCAC	2	8	1021671	1021678	25 %	0 %	25 %	50 %	378982433
21575	NC_016848	CATAG	2	10	1021706	1021715	40 %	20 %	20 %	20 %	378982433
21576	NC_016848	GGA	2	6	1021718	1021723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982433
21577	NC_016848	A	6	6	1021723	1021728	100 %	0 %	0 %	0 %	378982433
21578	NC_016848	CG	3	6	1021806	1021811	0 %	0 %	50 %	50 %	378982433
21579	NC_016848	TGC	2	6	1021838	1021843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982433
21580	NC_016848	TCT	2	6	1021905	1021910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982433
21581	NC_016848	CCTG	2	8	1021941	1021948	0 %	25 %	25 %	50 %	378982433
21582	NC_016848	ACC	2	6	1022030	1022035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982433
21583	NC_016848	CCA	2	6	1022146	1022151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982433
21584	NC_016848	CG	4	8	1022154	1022161	0 %	0 %	50 %	50 %	378982433
21585	NC_016848	T	6	6	1022223	1022228	0 %	100 %	0 %	0 %	378982433
21586	NC_016848	CTG	2	6	1022249	1022254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982433
21587	NC_016848	AGGA	2	8	1022257	1022264	50 %	0 %	50 %	0 %	378982433
21588	NC_016848	GA	3	6	1022263	1022268	50 %	0 %	50 %	0 %	378982433
21589	NC_016848	GA	3	6	1022321	1022326	50 %	0 %	50 %	0 %	378982433
21590	NC_016848	AC	3	6	1022333	1022338	50 %	0 %	0 %	50 %	378982433
21591	NC_016848	CG	3	6	1022349	1022354	0 %	0 %	50 %	50 %	378982433
21592	NC_016848	TTCA	2	8	1022394	1022401	25 %	50 %	0 %	25 %	378982433
21593	NC_016848	CTC	2	6	1022426	1022431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21594	NC_016848	GC	3	6	1022450	1022455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21595	NC_016848	ACGG	2	8	1022468	1022475	25 %	0 %	50 %	25 %	378982434
21596	NC_016848	CTTCT	2	10	1022514	1022523	0 %	60 %	0 %	40 %	378982434
21597	NC_016848	GC	3	6	1022524	1022529	0 %	0 %	50 %	50 %	378982434
21598	NC_016848	AGC	2	6	1022533	1022538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982434
21599	NC_016848	GCTC	2	8	1022545	1022552	0 %	25 %	25 %	50 %	378982434
21600	NC_016848	CTT	2	6	1022585	1022590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982434
21601	NC_016848	T	6	6	1022647	1022652	0 %	100 %	0 %	0 %	378982434
21602	NC_016848	CAT	2	6	1022792	1022797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982434
21603	NC_016848	CT	3	6	1022808	1022813	0 %	50 %	0 %	50 %	378982434
21604	NC_016848	CGC	2	6	1022925	1022930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982434
21605	NC_016848	ACC	2	6	1022976	1022981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982434
21606	NC_016848	ACC	2	6	1023054	1023059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982434
21607	NC_016848	GGT	2	6	1023119	1023124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982434
21608	NC_016848	GA	3	6	1023129	1023134	50 %	0 %	50 %	0 %	378982434
21609	NC_016848	GCT	2	6	1023203	1023208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982434
21610	NC_016848	CTG	2	6	1023231	1023236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982434
21611	NC_016848	A	6	6	1023242	1023247	100 %	0 %	0 %	0 %	378982434
21612	NC_016848	GCC	2	6	1023265	1023270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982434
21613	NC_016848	CTG	2	6	1023356	1023361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982434
21614	NC_016848	CGT	2	6	1023411	1023416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982434
21615	NC_016848	AT	3	6	1023444	1023449	50 %	50 %	0 %	0 %	378982434
21616	NC_016848	GAA	2	6	1023451	1023456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982434
21617	NC_016848	CAA	2	6	1023491	1023496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982434
21618	NC_016848	TCA	2	6	1023503	1023508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982434
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21620	NC_016848	CTT	2	6	1023606	1023611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982434
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