MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 24018

< Previous12...37383940414243444546474849Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_016848	A	6	6	994453	994458	100 %	0 %	0 %	0 %	378982408
21003	NC_016848	CTG	2	6	994463	994468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982408
21004	NC_016848	GC	3	6	994474	994479	0 %	0 %	50 %	50 %	378982408
21005	NC_016848	GAGT	2	8	994585	994592	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21006	NC_016848	TCT	2	6	994606	994611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982409
21007	NC_016848	TTG	2	6	994645	994650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982409
21008	NC_016848	AGA	2	6	994686	994691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982409
21009	NC_016848	TC	3	6	994704	994709	0 %	50 %	0 %	50 %	378982409
21010	NC_016848	GCA	2	6	994840	994845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982409
21011	NC_016848	GCG	2	6	994897	994902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982409
21012	NC_016848	AAG	2	6	994929	994934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982409
21013	NC_016848	CCA	2	6	994964	994969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982409
21014	NC_016848	GCAGC	2	10	995079	995088	20 %	0 %	40 %	40 %	378982409
21015	NC_016848	GAA	2	6	995144	995149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982409
21016	NC_016848	ATC	2	6	995248	995253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982409
21017	NC_016848	GGA	2	6	995327	995332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982409
21018	NC_016848	AG	3	6	995463	995468	50 %	0 %	50 %	0 %	378982409
21019	NC_016848	GGT	2	6	995600	995605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982409
21020	NC_016848	CG	3	6	995624	995629	0 %	0 %	50 %	50 %	378982409
21021	NC_016848	CA	3	6	995664	995669	50 %	0 %	0 %	50 %	378982409
21022	NC_016848	T	7	7	995723	995729	0 %	100 %	0 %	0 %	378982409
21023	NC_016848	AG	3	6	995784	995789	50 %	0 %	50 %	0 %	378982409
21024	NC_016848	CCG	2	6	995818	995823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982409
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21027	NC_016848	GAAC	2	8	995929	995936	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21028	NC_016848	TC	3	6	995940	995945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21029	NC_016848	CT	3	6	995951	995956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21030	NC_016848	GAGCAG	2	12	995996	996007	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21031	NC_016848	GAA	2	6	996036	996041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21032	NC_016848	A	6	6	996106	996111	100 %	0 %	0 %	0 %	378982410
21033	NC_016848	GTT	2	6	996221	996226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982410
21034	NC_016848	TGC	2	6	996238	996243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982410
21035	NC_016848	AGC	2	6	996282	996287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982410
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21038	NC_016848	AG	3	6	996321	996326	50 %	0 %	50 %	0 %	378982410
21039	NC_016848	GAT	2	6	996357	996362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982410
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21042	NC_016848	CTG	2	6	996542	996547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982410
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21044	NC_016848	A	6	6	996635	996640	100 %	0 %	0 %	0 %	378982410
21045	NC_016848	TTGA	2	8	996666	996673	25 %	50 %	25 %	0 %	378982410
21046	NC_016848	TG	3	6	996679	996684	0 %	50 %	50 %	0 %	378982410
21047	NC_016848	AC	3	6	996704	996709	50 %	0 %	0 %	50 %	378982410
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21052	NC_016848	TGG	2	6	996772	996777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982410
21053	NC_016848	CAT	2	6	996818	996823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982410
21054	NC_016848	GCA	2	6	996833	996838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982410
21055	NC_016848	GGC	2	6	996866	996871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982410
21056	NC_016848	GGCT	2	8	996936	996943	0 %	25 %	50 %	25 %	378982410
21057	NC_016848	ACT	2	6	996944	996949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982410
21058	NC_016848	TTG	2	6	997002	997007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982410
21059	NC_016848	G	6	6	997056	997061	0 %	0 %	100 %	0 %	378982410
21060	NC_016848	CAGT	2	8	997070	997077	25 %	25 %	25 %	25 %	378982410
21061	NC_016848	TTA	2	6	997087	997092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982410
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21065	NC_016848	GTA	2	6	997275	997280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982410
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21067	NC_016848	CAT	2	6	997343	997348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982410
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21071	NC_016848	GTA	2	6	997416	997421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982410
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21087	NC_016848	GCG	2	6	998135	998140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982411
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21092	NC_016848	GTC	2	6	998388	998393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982412
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21101	NC_016848	TCT	2	6	998913	998918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982414
21102	NC_016848	GC	3	6	998974	998979	0 %	0 %	50 %	50 %	378982414
21103	NC_016848	GC	3	6	999066	999071	0 %	0 %	50 %	50 %	378982414
21104	NC_016848	AGGCG	2	10	999101	999110	20 %	0 %	60 %	20 %	378982414
21105	NC_016848	GCCT	2	8	999170	999177	0 %	25 %	25 %	50 %	378982414
21106	NC_016848	CGAG	2	8	999230	999237	25 %	0 %	50 %	25 %	378982414
21107	NC_016848	CTT	2	6	999297	999302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982414
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21110	NC_016848	GAT	2	6	999447	999452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982414
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21112	NC_016848	TGC	2	6	999509	999514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982414
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21114	NC_016848	GC	3	6	999637	999642	0 %	0 %	50 %	50 %	378982414
21115	NC_016848	A	6	6	999705	999710	100 %	0 %	0 %	0 %	378982414
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21122	NC_016848	CA	3	6	999911	999916	50 %	0 %	0 %	50 %	378982414
21123	NC_016848	TTTC	2	8	999942	999949	0 %	75 %	0 %	25 %	378982414
21124	NC_016848	CTTGCA	2	12	999966	999977	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378982414
21125	NC_016848	GCT	3	9	999996	1000004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982414
21126	NC_016848	GCG	2	6	1000059	1000064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982414
21127	NC_016848	AGCA	2	8	1000093	1000100	50 %	0 %	25 %	25 %	378982414
21128	NC_016848	GCG	2	6	1000119	1000124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982414
21129	NC_016848	T	7	7	1000129	1000135	0 %	100 %	0 %	0 %	378982414
21130	NC_016848	TAT	2	6	1000233	1000238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982414
21131	NC_016848	CA	3	6	1000261	1000266	50 %	0 %	0 %	50 %	378982414
21132	NC_016848	GA	3	6	1000337	1000342	50 %	0 %	50 %	0 %	378982414
21133	NC_016848	GCAC	2	8	1000351	1000358	25 %	0 %	25 %	50 %	378982414
21134	NC_016848	ACG	2	6	1000363	1000368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982414
21135	NC_016848	CTG	2	6	1000372	1000377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982414
21136	NC_016848	CAG	2	6	1000378	1000383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982414
21137	NC_016848	GC	3	6	1000394	1000399	0 %	0 %	50 %	50 %	378982414
21138	NC_016848	T	7	7	1000474	1000480	0 %	100 %	0 %	0 %	378982414
21139	NC_016848	GC	4	8	1000509	1000516	0 %	0 %	50 %	50 %	378982414
21140	NC_016848	GGCT	2	8	1000539	1000546	0 %	25 %	50 %	25 %	378982414
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21142	NC_016848	CG	4	8	1000614	1000621	0 %	0 %	50 %	50 %	378982414
21143	NC_016848	TA	3	6	1000659	1000664	50 %	50 %	0 %	0 %	378982414
21144	NC_016848	CAGCGC	2	12	1000671	1000682	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378982414
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21152	NC_016848	GAA	2	6	1001193	1001198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982414
21153	NC_016848	ACC	2	6	1001201	1001206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982414
21154	NC_016848	AACAA	2	10	1001248	1001257	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21155	NC_016848	AGG	2	6	1001319	1001324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21156	NC_016848	ACC	2	6	1001396	1001401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982415
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21159	NC_016848	A	6	6	1001587	1001592	100 %	0 %	0 %	0 %	378982415
21160	NC_016848	TTA	2	6	1001646	1001651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982415
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21176	NC_016848	A	7	7	1002473	1002479	100 %	0 %	0 %	0 %	378982415
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21182	NC_016848	AGA	2	6	1002729	1002734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21226	NC_016848	GCTAAC	2	12	1004240	1004251	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378982417
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21228	NC_016848	C	6	6	1004286	1004291	0 %	0 %	0 %	100 %	378982417
21229	NC_016848	AACT	2	8	1004309	1004316	50 %	25 %	0 %	25 %	378982417
21230	NC_016848	CTC	2	6	1004324	1004329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982417
21231	NC_016848	CAC	2	6	1004333	1004338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982417
21232	NC_016848	TACCGT	2	12	1004357	1004368	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378982417
21233	NC_016848	CCG	2	6	1004419	1004424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982417
21234	NC_016848	CCA	2	6	1004500	1004505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982417
21235	NC_016848	CCT	2	6	1004683	1004688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982417
21236	NC_016848	AC	3	6	1004709	1004714	50 %	0 %	0 %	50 %	378982417
21237	NC_016848	GCA	2	6	1004723	1004728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982417
21238	NC_016848	GC	4	8	1004731	1004738	0 %	0 %	50 %	50 %	378982417
21239	NC_016848	ACA	2	6	1004771	1004776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21240	NC_016848	C	6	6	1004777	1004782	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21241	NC_016848	CGC	2	6	1004806	1004811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21242	NC_016848	CAG	2	6	1004900	1004905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21243	NC_016848	GC	3	6	1005148	1005153	0 %	0 %	50 %	50 %	378982418
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21362	NC_016848	TCG	2	6	1010951	1010956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982424
21363	NC_016848	TGC	2	6	1010966	1010971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982424
21364	NC_016848	CGC	2	6	1010978	1010983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982424
21365	NC_016848	CAAA	2	8	1011009	1011016	75 %	0 %	0 %	25 %	378982424
21366	NC_016848	GAG	2	6	1011039	1011044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982424
21367	NC_016848	ACGCTG	2	12	1011073	1011084	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378982424
21368	NC_016848	TACT	2	8	1011089	1011096	25 %	50 %	0 %	25 %	378982424
21369	NC_016848	CGC	2	6	1011097	1011102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982424
21370	NC_016848	ACC	2	6	1011187	1011192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982424
21371	NC_016848	GAA	2	6	1011266	1011271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982424
21372	NC_016848	CGT	2	6	1011290	1011295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982424
21373	NC_016848	CTC	2	6	1011392	1011397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982424
21374	NC_016848	CG	3	6	1011407	1011412	0 %	0 %	50 %	50 %	378982424
21375	NC_016848	GCACG	2	10	1011415	1011424	20 %	0 %	40 %	40 %	378982424
21376	NC_016848	CCA	2	6	1011475	1011480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982424
21377	NC_016848	CGG	2	6	1011580	1011585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982424
21378	NC_016848	GCA	2	6	1011675	1011680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982424
21379	NC_016848	CA	3	6	1011700	1011705	50 %	0 %	0 %	50 %	378982424
21380	NC_016848	GAG	2	6	1011744	1011749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982424
21381	NC_016848	CCG	3	9	1011793	1011801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982424
21382	NC_016848	C	6	6	1011896	1011901	0 %	0 %	0 %	100 %	378982424
21383	NC_016848	T	7	7	1011930	1011936	0 %	100 %	0 %	0 %	378982424
21384	NC_016848	GTA	2	6	1011996	1012001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982424
21385	NC_016848	CTA	2	6	1012048	1012053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982424
21386	NC_016848	GCT	2	6	1012109	1012114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982424
21387	NC_016848	GCGT	2	8	1012275	1012282	0 %	25 %	50 %	25 %	378982425
21388	NC_016848	CGC	2	6	1012302	1012307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982425
21389	NC_016848	ACCT	2	8	1012352	1012359	25 %	25 %	0 %	50 %	378982425
21390	NC_016848	GC	3	6	1012393	1012398	0 %	0 %	50 %	50 %	378982425
21391	NC_016848	GC	3	6	1012403	1012408	0 %	0 %	50 %	50 %	378982425
21392	NC_016848	GC	3	6	1012443	1012448	0 %	0 %	50 %	50 %	378982425
21393	NC_016848	CTT	2	6	1012475	1012480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982425
21394	NC_016848	CCT	2	6	1012490	1012495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982425
21395	NC_016848	GCA	2	6	1012549	1012554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982425
21396	NC_016848	CA	4	8	1012603	1012610	50 %	0 %	0 %	50 %	378982425
21397	NC_016848	TGC	2	6	1012620	1012625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982425
21398	NC_016848	AGGA	2	8	1012786	1012793	50 %	0 %	50 %	0 %	378982425
21399	NC_016848	GC	3	6	1012799	1012804	0 %	0 %	50 %	50 %	378982425
21400	NC_016848	AT	3	6	1012806	1012811	50 %	50 %	0 %	0 %	378982425
21401	NC_016848	ACC	2	6	1012854	1012859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982425
21402	NC_016848	TGCC	2	8	1012918	1012925	0 %	25 %	25 %	50 %	378982425
21403	NC_016848	TTA	2	6	1013024	1013029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982425
21404	NC_016848	GTGCG	2	10	1013115	1013124	0 %	20 %	60 %	20 %	378982425
21405	NC_016848	AC	3	6	1013141	1013146	50 %	0 %	0 %	50 %	378982425
21406	NC_016848	CGT	2	6	1013203	1013208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982425
21407	NC_016848	CGC	2	6	1013245	1013250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982425
21408	NC_016848	A	6	6	1013275	1013280	100 %	0 %	0 %	0 %	378982425
21409	NC_016848	AAG	2	6	1013544	1013549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982425
21410	NC_016848	CA	4	8	1013568	1013575	50 %	0 %	0 %	50 %	378982425
21411	NC_016848	CGCA	2	8	1013580	1013587	25 %	0 %	25 %	50 %	378982425
21412	NC_016848	ATC	2	6	1013600	1013605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982425
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21414	NC_016848	CA	4	8	1013651	1013658	50 %	0 %	0 %	50 %	378982425
21415	NC_016848	GC	3	6	1013740	1013745	0 %	0 %	50 %	50 %	378982425
21416	NC_016848	CAC	2	6	1013773	1013778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982425
21417	NC_016848	CG	3	6	1013807	1013812	0 %	0 %	50 %	50 %	378982425
21418	NC_016848	GC	3	6	1013860	1013865	0 %	0 %	50 %	50 %	378982425
21419	NC_016848	TTTC	2	8	1013914	1013921	0 %	75 %	0 %	25 %	378982425
21420	NC_016848	CTC	2	6	1013927	1013932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982425
21421	NC_016848	TCT	2	6	1013945	1013950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982425
21422	NC_016848	GCA	2	6	1014007	1014012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21423	NC_016848	CGA	2	6	1014054	1014059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982426
21424	NC_016848	TCT	2	6	1014093	1014098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982426
21425	NC_016848	AG	3	6	1014181	1014186	50 %	0 %	50 %	0 %	378982426
21426	NC_016848	TAG	2	6	1014318	1014323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982426
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21428	NC_016848	TTTG	2	8	1014431	1014438	0 %	75 %	25 %	0 %	378982426
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21432	NC_016848	TCA	2	6	1014587	1014592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982426
21433	NC_016848	GCT	2	6	1014744	1014749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982426
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21440	NC_016848	GAT	2	6	1015179	1015184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982426
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21443	NC_016848	A	6	6	1015226	1015231	100 %	0 %	0 %	0 %	378982426
21444	NC_016848	GAA	2	6	1015273	1015278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982426
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21446	NC_016848	TAAT	2	8	1015311	1015318	50 %	50 %	0 %	0 %	378982426
21447	NC_016848	A	6	6	1015339	1015344	100 %	0 %	0 %	0 %	378982426
21448	NC_016848	CAA	2	6	1015422	1015427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982426
21449	NC_016848	CA	3	6	1015484	1015489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21450	NC_016848	TAA	2	6	1015621	1015626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982427
21451	NC_016848	TTC	2	6	1015642	1015647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982427
21452	NC_016848	ATAA	2	8	1015672	1015679	75 %	25 %	0 %	0 %	378982427
21453	NC_016848	CAG	3	9	1015702	1015710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982427
21454	NC_016848	AG	3	6	1015733	1015738	50 %	0 %	50 %	0 %	378982427
21455	NC_016848	AGC	2	6	1015753	1015758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982427
21456	NC_016848	TCCTC	2	10	1015844	1015853	0 %	40 %	0 %	60 %	378982427
21457	NC_016848	TTGCA	2	10	1015909	1015918	20 %	40 %	20 %	20 %	378982427
21458	NC_016848	GCCGA	2	10	1015943	1015952	20 %	0 %	40 %	40 %	378982427
21459	NC_016848	CG	4	8	1015976	1015983	0 %	0 %	50 %	50 %	378982427
21460	NC_016848	GAAG	2	8	1016017	1016024	50 %	0 %	50 %	0 %	378982427
21461	NC_016848	GCT	2	6	1016174	1016179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982427
21462	NC_016848	CAT	2	6	1016220	1016225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982427
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21464	NC_016848	CAGG	2	8	1016347	1016354	25 %	0 %	50 %	25 %	378982427
21465	NC_016848	CTG	2	6	1016355	1016360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982427
21466	NC_016848	CT	3	6	1016382	1016387	0 %	50 %	0 %	50 %	378982427
21467	NC_016848	A	6	6	1016393	1016398	100 %	0 %	0 %	0 %	378982427
21468	NC_016848	AAG	2	6	1016463	1016468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982427
21469	NC_016848	CCGT	2	8	1016476	1016483	0 %	25 %	25 %	50 %	378982427
21470	NC_016848	CATA	2	8	1016587	1016594	50 %	25 %	0 %	25 %	378982427
21471	NC_016848	GAC	2	6	1016651	1016656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982427
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21473	NC_016848	ATC	2	6	1016761	1016766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982427
21474	NC_016848	TGC	2	6	1016847	1016852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982427
21475	NC_016848	GCA	3	9	1016918	1016926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982427
21476	NC_016848	CGA	2	6	1016973	1016978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982427
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21478	NC_016848	GC	3	6	1017048	1017053	0 %	0 %	50 %	50 %	378982427
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