MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 24018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20502	NC_016848	CTTT	2	8	972363	972370	0 %	75 %	0 %	25 %	378982383
20503	NC_016848	GC	3	6	972371	972376	0 %	0 %	50 %	50 %	378982383
20504	NC_016848	TCT	2	6	972387	972392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982383
20505	NC_016848	TTA	2	6	972393	972398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982383
20506	NC_016848	ACTC	2	8	972598	972605	25 %	25 %	0 %	50 %	378982384
20507	NC_016848	AGT	2	6	972611	972616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982384
20508	NC_016848	TCA	2	6	972657	972662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982384
20509	NC_016848	CCA	2	6	972663	972668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982384
20510	NC_016848	CCT	2	6	972694	972699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982384
20511	NC_016848	CTC	2	6	972704	972709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982384
20512	NC_016848	GGC	2	6	972734	972739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982384
20513	NC_016848	GAA	2	6	972879	972884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982384
20514	NC_016848	CTT	2	6	972895	972900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982384
20515	NC_016848	ACG	2	6	972932	972937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982384
20516	NC_016848	CATC	2	8	972952	972959	25 %	25 %	0 %	50 %	378982384
20517	NC_016848	CT	3	6	972972	972977	0 %	50 %	0 %	50 %	378982384
20518	NC_016848	CAA	2	6	973069	973074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982384
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20531	NC_016848	GTA	2	6	973577	973582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982384
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20533	NC_016848	CTT	2	6	973600	973605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982384
20534	NC_016848	GCTCA	2	10	973649	973658	20 %	20 %	20 %	40 %	378982384
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20536	NC_016848	AGT	2	6	973742	973747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982384
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20538	NC_016848	AC	3	6	973832	973837	50 %	0 %	0 %	50 %	378982384
20539	NC_016848	CTC	2	6	973841	973846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982384
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20543	NC_016848	GGC	2	6	973998	974003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20544	NC_016848	CCG	2	6	974113	974118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982385
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20547	NC_016848	CTG	2	6	974394	974399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982385
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20549	NC_016848	CA	3	6	974561	974566	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20550	NC_016848	AC	3	6	974597	974602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20551	NC_016848	GGC	2	6	974643	974648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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20553	NC_016848	CAC	2	6	974708	974713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982386
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20555	NC_016848	TCA	2	6	974745	974750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982386
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20591	NC_016848	CTGC	2	8	976873	976880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20592	NC_016848	TCC	2	6	976892	976897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20593	NC_016848	CAA	2	6	976925	976930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20594	NC_016848	TCTT	2	8	976968	976975	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20595	NC_016848	AGC	2	6	976991	976996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20597	NC_016848	N	29	29	977055	977083	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20598	NC_016848	C	6	6	977177	977182	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20599	NC_016848	CTG	2	6	977208	977213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20602	NC_016848	CCA	2	6	977522	977527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20603	NC_016848	CTT	2	6	977605	977610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20604	NC_016848	AGT	3	9	977641	977649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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20606	NC_016848	GA	3	6	977800	977805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20607	NC_016848	ACTA	2	8	977863	977870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20608	NC_016848	T	8	8	977932	977939	0 %	100 %	0 %	0 %	378982390
20609	NC_016848	GGT	2	6	978014	978019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982390
20610	NC_016848	TGC	2	6	978052	978057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982390
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20613	NC_016848	CCACG	2	10	978398	978407	20 %	0 %	20 %	60 %	378982390
20614	NC_016848	G	6	6	978407	978412	0 %	0 %	100 %	0 %	378982390
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20618	NC_016848	GC	3	6	978615	978620	0 %	0 %	50 %	50 %	378982390
20619	NC_016848	TCA	2	6	978634	978639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982390
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20621	NC_016848	G	6	6	978686	978691	0 %	0 %	100 %	0 %	378982390
20622	NC_016848	TGCA	2	8	978693	978700	25 %	25 %	25 %	25 %	378982390
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