MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 24018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_016848	GCTC	2	8	925516	925523	0 %	25 %	25 %	50 %	378982343
19502	NC_016848	CGC	2	6	925551	925556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982343
19503	NC_016848	ATT	2	6	925641	925646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982343
19504	NC_016848	ACG	2	6	925660	925665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982343
19505	NC_016848	CA	3	6	925685	925690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19506	NC_016848	CAC	2	6	925760	925765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19507	NC_016848	TTAT	2	8	925854	925861	25 %	75 %	0 %	0 %	378982344
19508	NC_016848	GGA	2	6	925870	925875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982344
19509	NC_016848	CTG	2	6	925910	925915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982344
19510	NC_016848	CA	4	8	925943	925950	50 %	0 %	0 %	50 %	378982344
19511	NC_016848	CTTCTG	3	18	926005	926022	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378982344
19512	NC_016848	CCA	2	6	926041	926046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982344
19513	NC_016848	CCT	2	6	926074	926079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982344
19514	NC_016848	ACA	2	6	926151	926156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982344
19515	NC_016848	CTG	2	6	926186	926191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982344
19516	NC_016848	GCG	2	6	926252	926257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982344
19517	NC_016848	CCG	2	6	926413	926418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982344
19518	NC_016848	A	7	7	926442	926448	100 %	0 %	0 %	0 %	378982344
19519	NC_016848	ACA	2	6	926482	926487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982344
19520	NC_016848	T	6	6	926502	926507	0 %	100 %	0 %	0 %	378982344
19521	NC_016848	GAA	2	6	926568	926573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982344
19522	NC_016848	A	6	6	926579	926584	100 %	0 %	0 %	0 %	378982344
19523	NC_016848	TGCC	2	8	926605	926612	0 %	25 %	25 %	50 %	378982344
19524	NC_016848	CAC	2	6	926624	926629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982344
19525	NC_016848	CGC	2	6	926670	926675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982344
19526	NC_016848	GCA	2	6	926691	926696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982344
19527	NC_016848	AGA	2	6	926771	926776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982344
19528	NC_016848	CTA	3	9	926866	926874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982344
19529	NC_016848	CTT	2	6	926876	926881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982344
19530	NC_016848	GCAA	2	8	926916	926923	50 %	0 %	25 %	25 %	378982344
19531	NC_016848	CA	3	6	926992	926997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19532	NC_016848	TCTT	2	8	927031	927038	0 %	75 %	0 %	25 %	378982345
19533	NC_016848	ATC	2	6	927056	927061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982345
19534	NC_016848	GTC	2	6	927068	927073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982345
19535	NC_016848	GC	3	6	927128	927133	0 %	0 %	50 %	50 %	378982345
19536	NC_016848	T	6	6	927182	927187	0 %	100 %	0 %	0 %	378982345
19537	NC_016848	GGTT	2	8	927208	927215	0 %	50 %	50 %	0 %	378982345
19538	NC_016848	TGC	2	6	927388	927393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982345
19539	NC_016848	CTC	2	6	927413	927418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982345
19540	NC_016848	CAT	2	6	927454	927459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982345
19541	NC_016848	ATCA	2	8	927605	927612	50 %	25 %	0 %	25 %	378982345
19542	NC_016848	GCA	2	6	927633	927638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982345
19543	NC_016848	TGC	2	6	927675	927680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982345
19544	NC_016848	ATTAT	2	10	927696	927705	40 %	60 %	0 %	0 %	378982345
19545	NC_016848	CG	3	6	927787	927792	0 %	0 %	50 %	50 %	378982345
19546	NC_016848	GA	3	6	927814	927819	50 %	0 %	50 %	0 %	378982345
19547	NC_016848	AAG	2	6	927867	927872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982345
19548	NC_016848	ATG	2	6	927945	927950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982345
19549	NC_016848	ATC	2	6	927962	927967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982345
19550	NC_016848	AGT	2	6	927985	927990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982345
19551	NC_016848	GC	3	6	928006	928011	0 %	0 %	50 %	50 %	378982345
19552	NC_016848	ATC	2	6	928040	928045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982345
19553	NC_016848	TTTCC	2	10	928114	928123	0 %	60 %	0 %	40 %	378982345
19554	NC_016848	GCC	2	6	928149	928154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982345
19555	NC_016848	TTC	2	6	928186	928191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982345
19556	NC_016848	GAG	2	6	928193	928198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982345
19557	NC_016848	TTC	2	6	928244	928249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982345
19558	NC_016848	T	7	7	928251	928257	0 %	100 %	0 %	0 %	378982345
19559	NC_016848	ATC	2	6	928269	928274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982345
19560	NC_016848	TGA	2	6	928306	928311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982345
19561	NC_016848	GTT	2	6	928574	928579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982345
19562	NC_016848	A	6	6	928591	928596	100 %	0 %	0 %	0 %	378982345
19563	NC_016848	ATC	2	6	928640	928645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982345
19564	NC_016848	CCT	2	6	928693	928698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982345
19565	NC_016848	TCTT	2	8	928737	928744	0 %	75 %	0 %	25 %	378982345
19566	NC_016848	CTGT	2	8	928748	928755	0 %	50 %	25 %	25 %	378982345
19567	NC_016848	TCC	2	6	928761	928766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982345
19568	NC_016848	CAA	2	6	928798	928803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982345
19569	NC_016848	TTGCC	2	10	928812	928821	0 %	40 %	20 %	40 %	378982345
19570	NC_016848	CA	3	6	928872	928877	50 %	0 %	0 %	50 %	378982345
19571	NC_016848	CTT	2	6	928888	928893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982345
19572	NC_016848	GTT	2	6	928950	928955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982345
19573	NC_016848	CAAGCT	2	12	928972	928983	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378982345
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19578	NC_016848	TCTCT	2	10	929210	929219	0 %	60 %	0 %	40 %	378982345
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19580	NC_016848	ACACC	2	10	929317	929326	40 %	0 %	0 %	60 %	378982345
19581	NC_016848	CCA	2	6	929379	929384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982345
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19583	NC_016848	T	7	7	929525	929531	0 %	100 %	0 %	0 %	378982345
19584	NC_016848	CGAT	2	8	929625	929632	25 %	25 %	25 %	25 %	378982345
19585	NC_016848	CTGA	2	8	929639	929646	25 %	25 %	25 %	25 %	378982345
19586	NC_016848	CAA	2	6	929674	929679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982345
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19588	NC_016848	A	6	6	929762	929767	100 %	0 %	0 %	0 %	378982345
19589	NC_016848	GCTC	2	8	929779	929786	0 %	25 %	25 %	50 %	378982345
19590	NC_016848	TTA	2	6	929841	929846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982345
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19593	NC_016848	CGTGC	2	10	929876	929885	0 %	20 %	40 %	40 %	378982345
19594	NC_016848	GC	3	6	929907	929912	0 %	0 %	50 %	50 %	378982345
19595	NC_016848	GCT	2	6	929920	929925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982345
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19603	NC_016848	CGC	2	6	930310	930315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982345
19604	NC_016848	CG	5	10	930378	930387	0 %	0 %	50 %	50 %	378982345
19605	NC_016848	A	6	6	930502	930507	100 %	0 %	0 %	0 %	378982345
19606	NC_016848	AGT	2	6	930575	930580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982345
19607	NC_016848	CCTT	2	8	930591	930598	0 %	50 %	0 %	50 %	378982345
19608	NC_016848	CA	4	8	930645	930652	50 %	0 %	0 %	50 %	378982345
19609	NC_016848	TGA	2	6	930688	930693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982345
19610	NC_016848	ACGT	2	8	930784	930791	25 %	25 %	25 %	25 %	378982345
19611	NC_016848	ATC	2	6	930821	930826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982345
19612	NC_016848	GA	3	6	930828	930833	50 %	0 %	50 %	0 %	378982345
19613	NC_016848	TCA	2	6	930864	930869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982345
19614	NC_016848	ACAGGC	2	12	930879	930890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982345
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19616	NC_016848	CAG	3	9	931136	931144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982345
19617	NC_016848	GT	3	6	931257	931262	0 %	50 %	50 %	0 %	378982345
19618	NC_016848	GCA	2	6	931275	931280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982345
19619	NC_016848	T	6	6	931293	931298	0 %	100 %	0 %	0 %	378982345
19620	NC_016848	GGT	2	6	931333	931338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982345
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19988	NC_016848	GAT	2	6	947898	947903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982357
19989	NC_016848	TCC	2	6	947905	947910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982357
19990	NC_016848	AGC	2	6	947911	947916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982357
19991	NC_016848	TGC	2	6	948002	948007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982357
19992	NC_016848	GC	4	8	948112	948119	0 %	0 %	50 %	50 %	378982357
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19998	NC_016848	GGCA	2	8	948354	948361	25 %	0 %	50 %	25 %	378982357
19999	NC_016848	GC	3	6	948462	948467	0 %	0 %	50 %	50 %	378982357
20000	NC_016848	CTG	2	6	948483	948488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982357

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