MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 24018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_016848	GTG	2	6	900332	900337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982321
19002	NC_016848	AGA	2	6	900376	900381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982321
19003	NC_016848	TCC	2	6	900404	900409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982321
19004	NC_016848	A	6	6	900417	900422	100 %	0 %	0 %	0 %	378982321
19005	NC_016848	CGC	2	6	900423	900428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982321
19006	NC_016848	TGTT	2	8	900520	900527	0 %	75 %	25 %	0 %	378982321
19007	NC_016848	GCAC	2	8	900569	900576	25 %	0 %	25 %	50 %	378982321
19008	NC_016848	CTT	2	6	900630	900635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982321
19009	NC_016848	CTG	2	6	900643	900648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982321
19010	NC_016848	TGA	2	6	900783	900788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982321
19011	NC_016848	CAC	2	6	900810	900815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982321
19012	NC_016848	AAT	2	6	900823	900828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982321
19013	NC_016848	AC	3	6	900995	901000	50 %	0 %	0 %	50 %	378982321
19014	NC_016848	GCG	2	6	901041	901046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982321
19015	NC_016848	CA	3	6	901056	901061	50 %	0 %	0 %	50 %	378982321
19016	NC_016848	TCT	2	6	901070	901075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982321
19017	NC_016848	CTG	2	6	901093	901098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982321
19018	NC_016848	CGG	2	6	901177	901182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982321
19019	NC_016848	TAAC	2	8	901191	901198	50 %	25 %	0 %	25 %	378982321
19020	NC_016848	GCC	2	6	901263	901268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982321
19021	NC_016848	CA	3	6	901275	901280	50 %	0 %	0 %	50 %	378982321
19022	NC_016848	CCTCA	2	10	901293	901302	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
19023	NC_016848	GAAC	2	8	901316	901323	50 %	0 %	25 %	25 %	378982322
19024	NC_016848	TCAA	2	8	901386	901393	50 %	25 %	0 %	25 %	378982322
19025	NC_016848	ACC	2	6	901437	901442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982322
19026	NC_016848	CTC	2	6	901493	901498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982322
19027	NC_016848	CTT	2	6	901522	901527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982322
19028	NC_016848	GC	3	6	901617	901622	0 %	0 %	50 %	50 %	378982322
19029	NC_016848	CCT	2	6	901669	901674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982322
19030	NC_016848	AGCCG	2	10	901880	901889	20 %	0 %	40 %	40 %	378982322
19031	NC_016848	ACG	2	6	901898	901903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982322
19032	NC_016848	AC	3	6	901969	901974	50 %	0 %	0 %	50 %	378982322
19033	NC_016848	TCT	2	6	901985	901990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982322
19034	NC_016848	GAAA	2	8	901996	902003	75 %	0 %	25 %	0 %	378982322
19035	NC_016848	TGA	2	6	902051	902056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982322
19036	NC_016848	TGC	2	6	902119	902124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982322
19037	NC_016848	AC	3	6	902125	902130	50 %	0 %	0 %	50 %	378982322
19038	NC_016848	A	6	6	902151	902156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19039	NC_016848	AGC	2	6	902177	902182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19040	NC_016848	CG	3	6	902263	902268	0 %	0 %	50 %	50 %	378982323
19041	NC_016848	CTG	2	6	902270	902275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982323
19042	NC_016848	TATCAG	2	12	902350	902361	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378982323
19043	NC_016848	CCT	2	6	902366	902371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982323
19044	NC_016848	TTC	2	6	902384	902389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982323
19045	NC_016848	TAC	2	6	902521	902526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982323
19046	NC_016848	GCG	2	6	902532	902537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982323
19047	NC_016848	CG	3	6	902540	902545	0 %	0 %	50 %	50 %	378982323
19048	NC_016848	AC	4	8	902618	902625	50 %	0 %	0 %	50 %	378982323
19049	NC_016848	GCG	2	6	902628	902633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982323
19050	NC_016848	GCG	2	6	902648	902653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982323
19051	NC_016848	CG	3	6	902715	902720	0 %	0 %	50 %	50 %	378982323
19052	NC_016848	CGTG	2	8	902753	902760	0 %	25 %	50 %	25 %	378982323
19053	NC_016848	AAC	2	6	902778	902783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982323
19054	NC_016848	GC	3	6	902787	902792	0 %	0 %	50 %	50 %	378982323
19055	NC_016848	TCG	2	6	902846	902851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982323
19056	NC_016848	ACA	2	6	902881	902886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982323
19057	NC_016848	GACAC	2	10	902897	902906	40 %	0 %	20 %	40 %	378982323
19058	NC_016848	ACT	2	6	902973	902978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982324
19059	NC_016848	CAC	2	6	903001	903006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982324
19060	NC_016848	T	6	6	903010	903015	0 %	100 %	0 %	0 %	378982324
19061	NC_016848	CG	3	6	903019	903024	0 %	0 %	50 %	50 %	378982324
19062	NC_016848	CCGTC	2	10	903033	903042	0 %	20 %	20 %	60 %	378982324
19063	NC_016848	CTC	2	6	903108	903113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982324
19064	NC_016848	GTA	2	6	903146	903151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982324
19065	NC_016848	ACAA	2	8	903167	903174	75 %	0 %	0 %	25 %	378982324
19066	NC_016848	CCG	2	6	903251	903256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982324
19067	NC_016848	CG	4	8	903262	903269	0 %	0 %	50 %	50 %	378982324
19068	NC_016848	AATT	2	8	903348	903355	50 %	50 %	0 %	0 %	378982324
19069	NC_016848	CGC	2	6	903416	903421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982324
19070	NC_016848	AAG	2	6	903488	903493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982324
19071	NC_016848	T	6	6	903519	903524	0 %	100 %	0 %	0 %	378982324
19072	NC_016848	CAA	2	6	903606	903611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982324
19073	NC_016848	ATC	2	6	903625	903630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982324
19074	NC_016848	GCC	2	6	903631	903636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982324
19075	NC_016848	A	6	6	903674	903679	100 %	0 %	0 %	0 %	378982324
19076	NC_016848	GAAAG	2	10	903714	903723	60 %	0 %	40 %	0 %	378982324
19077	NC_016848	CCAA	2	8	903825	903832	50 %	0 %	0 %	50 %	378982324
19078	NC_016848	ATT	2	6	903838	903843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982324
19079	NC_016848	GAAA	2	8	903872	903879	75 %	0 %	25 %	0 %	378982324
19080	NC_016848	CG	3	6	903977	903982	0 %	0 %	50 %	50 %	378982324
19081	NC_016848	CA	3	6	904023	904028	50 %	0 %	0 %	50 %	378982324
19082	NC_016848	ACT	2	6	904072	904077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982324
19083	NC_016848	TAA	2	6	904161	904166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982324
19084	NC_016848	GAC	2	6	904340	904345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982325
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19086	NC_016848	TGC	2	6	904455	904460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982325
19087	NC_016848	CCA	2	6	904511	904516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982325
19088	NC_016848	GTT	2	6	904575	904580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982325
19089	NC_016848	T	6	6	904639	904644	0 %	100 %	0 %	0 %	378982325
19090	NC_016848	GCG	2	6	904850	904855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982325
19091	NC_016848	CG	3	6	904871	904876	0 %	0 %	50 %	50 %	378982325
19092	NC_016848	CCT	2	6	904888	904893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982325
19093	NC_016848	GC	3	6	904897	904902	0 %	0 %	50 %	50 %	378982325
19094	NC_016848	CGC	2	6	904905	904910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982325
19095	NC_016848	ACTG	2	8	904915	904922	25 %	25 %	25 %	25 %	378982325
19096	NC_016848	CATA	2	8	904961	904968	50 %	25 %	0 %	25 %	378982325
19097	NC_016848	CTG	2	6	904971	904976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982325
19098	NC_016848	CA	3	6	905247	905252	50 %	0 %	0 %	50 %	378982325
19099	NC_016848	CCTG	2	8	905308	905315	0 %	25 %	25 %	50 %	378982325
19100	NC_016848	GCA	2	6	905321	905326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982325
19101	NC_016848	GCG	2	6	905471	905476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982325
19102	NC_016848	TCC	2	6	905481	905486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982325
19103	NC_016848	AATCC	2	10	905520	905529	40 %	20 %	0 %	40 %	378982325
19104	NC_016848	TCA	2	6	905612	905617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982325
19105	NC_016848	GCA	2	6	905660	905665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982325
19106	NC_016848	ATC	2	6	905692	905697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982325
19107	NC_016848	CAC	2	6	905778	905783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982325
19108	NC_016848	GAC	2	6	905811	905816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982325
19109	NC_016848	CG	3	6	905837	905842	0 %	0 %	50 %	50 %	378982325
19110	NC_016848	GCG	2	6	905858	905863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982325
19111	NC_016848	TCT	2	6	905878	905883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982325
19112	NC_016848	GAT	2	6	905930	905935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982325
19113	NC_016848	GCG	2	6	905957	905962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982325
19114	NC_016848	CTGCGC	2	12	905993	906004	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378982325
19115	NC_016848	CTA	2	6	906005	906010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982325
19116	NC_016848	CCAA	2	8	906118	906125	50 %	0 %	0 %	50 %	378982325
19117	NC_016848	CACG	2	8	906182	906189	25 %	0 %	25 %	50 %	378982325
19118	NC_016848	GCA	3	9	906209	906217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982325
19119	NC_016848	GCA	2	6	906223	906228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982325
19120	NC_016848	CCTGC	2	10	906233	906242	0 %	20 %	20 %	60 %	378982325
19121	NC_016848	T	6	6	906280	906285	0 %	100 %	0 %	0 %	378982325
19122	NC_016848	GCG	2	6	906359	906364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982325
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19241	NC_016848	TTCG	2	8	912983	912990	0 %	50 %	25 %	25 %	378982330
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