MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 24018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_016848	AG	4	8	851876	851883	50 %	0 %	50 %	0 %	378982269
18003	NC_016848	CCCG	2	8	851912	851919	0 %	0 %	25 %	75 %	378982269
18004	NC_016848	GCA	2	6	851997	852002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982269
18005	NC_016848	AC	3	6	852037	852042	50 %	0 %	0 %	50 %	378982269
18006	NC_016848	CG	4	8	852058	852065	0 %	0 %	50 %	50 %	378982269
18007	NC_016848	AGG	2	6	852070	852075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982269
18008	NC_016848	A	6	6	852104	852109	100 %	0 %	0 %	0 %	378982269
18009	NC_016848	CAG	2	6	852166	852171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982269
18010	NC_016848	GT	3	6	852221	852226	0 %	50 %	50 %	0 %	378982269
18011	NC_016848	CCA	2	6	852304	852309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982269
18012	NC_016848	CG	3	6	852353	852358	0 %	0 %	50 %	50 %	378982269
18013	NC_016848	GCT	2	6	852441	852446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982269
18014	NC_016848	T	6	6	852497	852502	0 %	100 %	0 %	0 %	378982269
18015	NC_016848	GC	3	6	852536	852541	0 %	0 %	50 %	50 %	378982269
18016	NC_016848	GTTC	2	8	852554	852561	0 %	50 %	25 %	25 %	378982270
18017	NC_016848	CTT	2	6	852565	852570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982270
18018	NC_016848	TGT	2	6	852579	852584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982270
18019	NC_016848	GTT	2	6	852607	852612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982270
18020	NC_016848	CTT	2	6	852629	852634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982270
18021	NC_016848	TGTC	2	8	852652	852659	0 %	50 %	25 %	25 %	378982270
18022	NC_016848	CTT	2	6	852660	852665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982270
18023	NC_016848	CTC	2	6	852731	852736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982271
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18025	NC_016848	TGC	2	6	852767	852772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982271
18026	NC_016848	CAG	2	6	852778	852783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982271
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18028	NC_016848	ACA	2	6	852864	852869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982272
18029	NC_016848	CAC	2	6	852917	852922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982272
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18031	NC_016848	ACTG	2	8	853013	853020	25 %	25 %	25 %	25 %	378982272
18032	NC_016848	CTT	2	6	853060	853065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982272
18033	NC_016848	TGT	2	6	853177	853182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982272
18034	NC_016848	GGTT	2	8	853189	853196	0 %	50 %	50 %	0 %	378982272
18035	NC_016848	GCAC	2	8	853208	853215	25 %	0 %	25 %	50 %	378982272
18036	NC_016848	CG	3	6	853280	853285	0 %	0 %	50 %	50 %	378982272
18037	NC_016848	CGC	2	6	853294	853299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982272
18038	NC_016848	CG	3	6	853321	853326	0 %	0 %	50 %	50 %	378982273
18039	NC_016848	CTT	2	6	853356	853361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982273
18040	NC_016848	CG	3	6	853419	853424	0 %	0 %	50 %	50 %	378982273
18041	NC_016848	T	6	6	853438	853443	0 %	100 %	0 %	0 %	378982273
18042	NC_016848	CG	3	6	853503	853508	0 %	0 %	50 %	50 %	378982273
18043	NC_016848	CGA	2	6	853560	853565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982273
18044	NC_016848	ATC	2	6	853568	853573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982273
18045	NC_016848	A	9	9	853604	853612	100 %	0 %	0 %	0 %	378982273
18046	NC_016848	TAC	2	6	853665	853670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982273
18047	NC_016848	ACT	2	6	853674	853679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982273
18048	NC_016848	TGC	2	6	853683	853688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982273
18049	NC_016848	A	7	7	853748	853754	100 %	0 %	0 %	0 %	378982273
18050	NC_016848	TACC	2	8	853788	853795	25 %	25 %	0 %	50 %	378982273
18051	NC_016848	GTAT	2	8	853823	853830	25 %	50 %	25 %	0 %	378982273
18052	NC_016848	AAC	2	6	853988	853993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982273
18053	NC_016848	CG	3	6	854024	854029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18054	NC_016848	CAGAGA	2	12	854071	854082	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18055	NC_016848	A	7	7	854086	854092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_016848	GAAT	2	8	854102	854109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18057	NC_016848	GTG	2	6	854172	854177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982274
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18059	NC_016848	GC	5	10	854342	854351	0 %	0 %	50 %	50 %	378982274
18060	NC_016848	GC	3	6	854417	854422	0 %	0 %	50 %	50 %	378982274
18061	NC_016848	GCT	2	6	854480	854485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982274
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18066	NC_016848	GTA	2	6	854790	854795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982274
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18078	NC_016848	GC	3	6	855340	855345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18093	NC_016848	CGAAG	2	10	856047	856056	40 %	0 %	40 %	20 %	378982276
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18103	NC_016848	TG	3	6	856575	856580	0 %	50 %	50 %	0 %	378982277
18104	NC_016848	GCAC	2	8	856596	856603	25 %	0 %	25 %	50 %	378982277
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18108	NC_016848	AAG	2	6	856805	856810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982277
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18111	NC_016848	TGA	2	6	857100	857105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982278
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18119	NC_016848	GTG	2	6	857405	857410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982278
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18121	NC_016848	AAGG	2	8	857475	857482	50 %	0 %	50 %	0 %	378982278
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18492	NC_016848	AGC	2	6	874858	874863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982293
18493	NC_016848	G	6	6	874915	874920	0 %	0 %	100 %	0 %	378982293
18494	NC_016848	TGA	2	6	874981	874986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982293
18495	NC_016848	TC	3	6	875037	875042	0 %	50 %	0 %	50 %	378982293
18496	NC_016848	TTC	2	6	875043	875048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982293
18497	NC_016848	GAT	2	6	875068	875073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982293
18498	NC_016848	TCA	2	6	875124	875129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982293
18499	NC_016848	ACA	2	6	875146	875151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982293
18500	NC_016848	TCTCC	2	10	875159	875168	0 %	40 %	0 %	60 %	378982293

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