MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 24018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_016848	CCTA	2	8	828186	828193	25 %	25 %	0 %	50 %	378982246
17502	NC_016848	GCACAC	2	12	828204	828215	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378982246
17503	NC_016848	CTC	2	6	828225	828230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982246
17504	NC_016848	GCC	2	6	828252	828257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982246
17505	NC_016848	AGG	2	6	828268	828273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982246
17506	NC_016848	GT	3	6	828315	828320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17507	NC_016848	GCAGGG	2	12	828326	828337	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17508	NC_016848	GCGT	2	8	828373	828380	0 %	25 %	50 %	25 %	378982247
17509	NC_016848	CTT	2	6	828421	828426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982247
17510	NC_016848	GCG	2	6	828448	828453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982247
17511	NC_016848	TGC	2	6	828490	828495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982247
17512	NC_016848	CG	3	6	828507	828512	0 %	0 %	50 %	50 %	378982247
17513	NC_016848	CGT	2	6	828525	828530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982247
17514	NC_016848	GC	3	6	828539	828544	0 %	0 %	50 %	50 %	378982247
17515	NC_016848	CGC	2	6	828657	828662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982247
17516	NC_016848	TG	3	6	828716	828721	0 %	50 %	50 %	0 %	378982247
17517	NC_016848	CG	3	6	828729	828734	0 %	0 %	50 %	50 %	378982247
17518	NC_016848	GC	3	6	828795	828800	0 %	0 %	50 %	50 %	378982247
17519	NC_016848	GA	3	6	828895	828900	50 %	0 %	50 %	0 %	378982247
17520	NC_016848	TCC	3	9	828938	828946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982247
17521	NC_016848	A	8	8	829054	829061	100 %	0 %	0 %	0 %	378982247
17522	NC_016848	CG	3	6	829069	829074	0 %	0 %	50 %	50 %	378982247
17523	NC_016848	CAG	3	9	829138	829146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982247
17524	NC_016848	ACT	2	6	829166	829171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982247
17525	NC_016848	CTA	2	6	829233	829238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17526	NC_016848	GCGA	2	8	829244	829251	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17527	NC_016848	TGA	2	6	829317	829322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982248
17528	NC_016848	T	6	6	829326	829331	0 %	100 %	0 %	0 %	378982248
17529	NC_016848	CAC	2	6	829395	829400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982248
17530	NC_016848	CGG	2	6	829410	829415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982248
17531	NC_016848	TCT	2	6	829426	829431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982248
17532	NC_016848	CTGC	2	8	829453	829460	0 %	25 %	25 %	50 %	378982248
17533	NC_016848	GAA	2	6	829536	829541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982248
17534	NC_016848	CG	4	8	829613	829620	0 %	0 %	50 %	50 %	378982248
17535	NC_016848	A	6	6	829656	829661	100 %	0 %	0 %	0 %	378982248
17536	NC_016848	CCA	2	6	829691	829696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982248
17537	NC_016848	TGT	2	6	829755	829760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982248
17538	NC_016848	GC	3	6	829840	829845	0 %	0 %	50 %	50 %	378982248
17539	NC_016848	TAT	2	6	829917	829922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982248
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17541	NC_016848	GCA	2	6	830083	830088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982248
17542	NC_016848	CGC	2	6	830121	830126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982248
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17544	NC_016848	CG	4	8	830183	830190	0 %	0 %	50 %	50 %	378982248
17545	NC_016848	GGT	2	6	830259	830264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982248
17546	NC_016848	CGA	2	6	830277	830282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982248
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17550	NC_016848	TCG	2	6	830524	830529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982249
17551	NC_016848	T	6	6	830583	830588	0 %	100 %	0 %	0 %	378982249
17552	NC_016848	ACC	2	6	830605	830610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982249
17553	NC_016848	CG	3	6	830633	830638	0 %	0 %	50 %	50 %	378982249
17554	NC_016848	TCA	2	6	830647	830652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982249
17555	NC_016848	CTG	2	6	830658	830663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982249
17556	NC_016848	TG	3	6	830662	830667	0 %	50 %	50 %	0 %	378982249
17557	NC_016848	CG	3	6	830681	830686	0 %	0 %	50 %	50 %	378982249
17558	NC_016848	ATC	2	6	830770	830775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982249
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17561	NC_016848	CTG	2	6	830892	830897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982249
17562	NC_016848	AAT	2	6	830967	830972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982249
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17564	NC_016848	CTT	2	6	831059	831064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982249
17565	NC_016848	T	7	7	831080	831086	0 %	100 %	0 %	0 %	378982249
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17575	NC_016848	GCAA	2	8	831670	831677	50 %	0 %	25 %	25 %	378982249
17576	NC_016848	GACC	2	8	831698	831705	25 %	0 %	25 %	50 %	378982249
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17594	NC_016848	CGAG	2	8	832301	832308	25 %	0 %	50 %	25 %	378982249
17595	NC_016848	GAC	2	6	832348	832353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982249
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17602	NC_016848	TGC	2	6	832575	832580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982249
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17604	NC_016848	CG	4	8	832592	832599	0 %	0 %	50 %	50 %	378982249
17605	NC_016848	GC	3	6	832618	832623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17606	NC_016848	ACCT	2	8	832649	832656	25 %	25 %	0 %	50 %	378982250
17607	NC_016848	CGC	2	6	832694	832699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982250
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17609	NC_016848	GCAC	2	8	832815	832822	25 %	0 %	25 %	50 %	378982250
17610	NC_016848	CGA	2	6	832877	832882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982250
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17613	NC_016848	CTCC	2	8	832956	832963	0 %	25 %	0 %	75 %	378982250
17614	NC_016848	GCCC	2	8	832969	832976	0 %	0 %	25 %	75 %	378982250
17615	NC_016848	TTC	3	9	832991	832999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982250
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17621	NC_016848	GC	3	6	833258	833263	0 %	0 %	50 %	50 %	378982250
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17991	NC_016848	AGAA	2	8	851469	851476	75 %	0 %	25 %	0 %	378982269
17992	NC_016848	T	8	8	851477	851484	0 %	100 %	0 %	0 %	378982269
17993	NC_016848	CG	3	6	851543	851548	0 %	0 %	50 %	50 %	378982269
17994	NC_016848	GCT	2	6	851572	851577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982269
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