MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 24018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_016848	CAGTA	2	10	705495	705504	40 %	20 %	20 %	20 %	378982126
15003	NC_016848	ACG	2	6	705582	705587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982126
15004	NC_016848	A	7	7	705612	705618	100 %	0 %	0 %	0 %	378982126
15005	NC_016848	GAA	2	6	705626	705631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982126
15006	NC_016848	TGA	2	6	705715	705720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982126
15007	NC_016848	GTC	2	6	705916	705921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982126
15008	NC_016848	AGA	2	6	705931	705936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982126
15009	NC_016848	GT	3	6	706050	706055	0 %	50 %	50 %	0 %	378982126
15010	NC_016848	AACAA	2	10	706122	706131	80 %	0 %	0 %	20 %	378982126
15011	NC_016848	CG	3	6	706138	706143	0 %	0 %	50 %	50 %	378982126
15012	NC_016848	GTT	2	6	706163	706168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982126
15013	NC_016848	GCAC	2	8	706193	706200	25 %	0 %	25 %	50 %	378982126
15014	NC_016848	GT	3	6	706213	706218	0 %	50 %	50 %	0 %	378982126
15015	NC_016848	GAA	2	6	706304	706309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982126
15016	NC_016848	GA	3	6	706339	706344	50 %	0 %	50 %	0 %	378982126
15017	NC_016848	CGC	2	6	706360	706365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982126
15018	NC_016848	GT	3	6	706386	706391	0 %	50 %	50 %	0 %	378982126
15019	NC_016848	GATC	2	8	706417	706424	25 %	25 %	25 %	25 %	378982126
15020	NC_016848	AAT	2	6	706519	706524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982126
15021	NC_016848	GC	3	6	706559	706564	0 %	0 %	50 %	50 %	378982126
15022	NC_016848	AT	4	8	706587	706594	50 %	50 %	0 %	0 %	378982126
15023	NC_016848	CTTT	2	8	706640	706647	0 %	75 %	0 %	25 %	378982126
15024	NC_016848	TGC	2	6	706662	706667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982126
15025	NC_016848	GAACA	2	10	706713	706722	60 %	0 %	20 %	20 %	378982126
15026	NC_016848	A	6	6	706722	706727	100 %	0 %	0 %	0 %	378982126
15027	NC_016848	ATC	2	6	706739	706744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982126
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15030	NC_016848	AAC	2	6	706902	706907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982127
15031	NC_016848	AGA	3	9	706920	706928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982127
15032	NC_016848	TAT	2	6	706971	706976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982127
15033	NC_016848	GC	3	6	706978	706983	0 %	0 %	50 %	50 %	378982127
15034	NC_016848	CGA	2	6	707049	707054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982127
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15036	NC_016848	TCG	2	6	707126	707131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982127
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15038	NC_016848	TACG	2	8	707217	707224	25 %	25 %	25 %	25 %	378982127
15039	NC_016848	GCA	2	6	707311	707316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982127
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15041	NC_016848	CAC	2	6	707374	707379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982127
15042	NC_016848	CAAA	2	8	707382	707389	75 %	0 %	0 %	25 %	378982127
15043	NC_016848	A	7	7	707427	707433	100 %	0 %	0 %	0 %	378982127
15044	NC_016848	ACTG	2	8	707461	707468	25 %	25 %	25 %	25 %	378982127
15045	NC_016848	TCTG	2	8	707618	707625	0 %	50 %	25 %	25 %	378982128
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15050	NC_016848	AT	3	6	707906	707911	50 %	50 %	0 %	0 %	378982128
15051	NC_016848	CGG	2	6	707949	707954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982128
15052	NC_016848	ATG	2	6	708324	708329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982128
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15054	NC_016848	TGC	2	6	708562	708567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982128
15055	NC_016848	TACC	2	8	708689	708696	25 %	25 %	0 %	50 %	378982128
15056	NC_016848	CG	3	6	708733	708738	0 %	0 %	50 %	50 %	378982128
15057	NC_016848	CTG	2	6	708750	708755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982128
15058	NC_016848	TC	3	6	708929	708934	0 %	50 %	0 %	50 %	378982128
15059	NC_016848	TCCT	2	8	709073	709080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15062	NC_016848	TGCG	2	8	709252	709259	0 %	25 %	50 %	25 %	378982129
15063	NC_016848	CG	3	6	709269	709274	0 %	0 %	50 %	50 %	378982129
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15067	NC_016848	CA	4	8	709546	709553	50 %	0 %	0 %	50 %	378982130
15068	NC_016848	TGC	2	6	709562	709567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982130
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15071	NC_016848	AC	3	6	709695	709700	50 %	0 %	0 %	50 %	378982130
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15101	NC_016848	CAAAC	2	10	711311	711320	60 %	0 %	0 %	40 %	378982131
15102	NC_016848	AGC	2	6	711339	711344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982131
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15105	NC_016848	CGCT	2	8	711594	711601	0 %	25 %	25 %	50 %	378982131
15106	NC_016848	AC	3	6	711639	711644	50 %	0 %	0 %	50 %	378982131
15107	NC_016848	TGCA	2	8	711776	711783	25 %	25 %	25 %	25 %	378982131
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15124	NC_016848	ATGCA	2	10	712575	712584	40 %	20 %	20 %	20 %	378982132
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15127	NC_016848	TCT	2	6	712685	712690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982132
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15132	NC_016848	CG	3	6	712888	712893	0 %	0 %	50 %	50 %	378982132
15133	NC_016848	TCT	2	6	712975	712980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982132
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15139	NC_016848	ACGT	2	8	713338	713345	25 %	25 %	25 %	25 %	378982132
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15143	NC_016848	GC	3	6	713523	713528	0 %	0 %	50 %	50 %	378982132
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15244	NC_016848	ACA	2	6	719749	719754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982137
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15353	NC_016848	CAC	2	6	724785	724790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982143
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15359	NC_016848	GCCA	2	8	725204	725211	25 %	0 %	25 %	50 %	378982143
15360	NC_016848	TCC	2	6	725248	725253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982143
15361	NC_016848	GTCT	2	8	725319	725326	0 %	50 %	25 %	25 %	378982143
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15364	NC_016848	CGAA	2	8	725447	725454	50 %	0 %	25 %	25 %	378982143
15365	NC_016848	GGC	2	6	725471	725476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982143
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