MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 24018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_016848	CAA	2	6	659588	659593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982089
14002	NC_016848	CTCGC	2	10	659606	659615	0 %	20 %	20 %	60 %	378982089
14003	NC_016848	GCC	2	6	659691	659696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982089
14004	NC_016848	CCT	2	6	659741	659746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982089
14005	NC_016848	AG	3	6	659751	659756	50 %	0 %	50 %	0 %	378982089
14006	NC_016848	TCT	2	6	659792	659797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982089
14007	NC_016848	TGG	2	6	659822	659827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982089
14008	NC_016848	GCC	2	6	659844	659849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982089
14009	NC_016848	GCGCT	2	10	659883	659892	0 %	20 %	40 %	40 %	378982089
14010	NC_016848	TGC	2	6	659908	659913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982089
14011	NC_016848	CTT	2	6	659919	659924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982089
14012	NC_016848	CAAA	2	8	659933	659940	75 %	0 %	0 %	25 %	378982089
14013	NC_016848	ATG	2	6	660019	660024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982089
14014	NC_016848	CCTGA	2	10	660078	660087	20 %	20 %	20 %	40 %	378982089
14015	NC_016848	CAC	2	6	660129	660134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982089
14016	NC_016848	TCC	2	6	660146	660151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14017	NC_016848	AG	3	6	660154	660159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_016848	TC	3	6	660178	660183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14019	NC_016848	CAC	2	6	660187	660192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14020	NC_016848	CA	3	6	660243	660248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14021	NC_016848	GCA	2	6	660319	660324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14022	NC_016848	CCGC	2	8	660484	660491	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14023	NC_016848	CAG	2	6	660499	660504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14024	NC_016848	GCC	2	6	660512	660517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982090
14025	NC_016848	CAC	2	6	660533	660538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982090
14026	NC_016848	GC	3	6	660544	660549	0 %	0 %	50 %	50 %	378982090
14027	NC_016848	GC	3	6	660552	660557	0 %	0 %	50 %	50 %	378982090
14028	NC_016848	CCA	2	6	660604	660609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982090
14029	NC_016848	GC	3	6	660612	660617	0 %	0 %	50 %	50 %	378982090
14030	NC_016848	GA	3	6	660671	660676	50 %	0 %	50 %	0 %	378982090
14031	NC_016848	CCG	2	6	660775	660780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982090
14032	NC_016848	CAC	2	6	660785	660790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982090
14033	NC_016848	CA	3	6	660808	660813	50 %	0 %	0 %	50 %	378982090
14034	NC_016848	CAG	2	6	660940	660945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982090
14035	NC_016848	CCT	2	6	660964	660969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982090
14036	NC_016848	TCA	2	6	660975	660980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982090
14037	NC_016848	CCT	2	6	661003	661008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982090
14038	NC_016848	CAC	2	6	661070	661075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982090
14039	NC_016848	TCA	2	6	661111	661116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982090
14040	NC_016848	CTG	2	6	661166	661171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982090
14041	NC_016848	CAAAAG	2	12	661189	661200	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378982090
14042	NC_016848	AAG	3	9	661215	661223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982090
14043	NC_016848	GCT	2	6	661225	661230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982090
14044	NC_016848	TCC	2	6	661243	661248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14045	NC_016848	GCACG	2	10	661292	661301	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14046	NC_016848	CG	3	6	661300	661305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14047	NC_016848	CAC	2	6	661329	661334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14048	NC_016848	AC	3	6	661372	661377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14049	NC_016848	CG	3	6	661444	661449	0 %	0 %	50 %	50 %	378982091
14050	NC_016848	AGA	2	6	661524	661529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982091
14051	NC_016848	CTC	2	6	661544	661549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982091
14052	NC_016848	AG	3	6	661554	661559	50 %	0 %	50 %	0 %	378982091
14053	NC_016848	ACG	2	6	661579	661584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_016848	GCG	2	6	661618	661623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14055	NC_016848	GCT	2	6	661666	661671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14056	NC_016848	GCGT	2	8	661712	661719	0 %	25 %	50 %	25 %	378982092
14057	NC_016848	C	6	6	661756	661761	0 %	0 %	0 %	100 %	378982092
14058	NC_016848	TCC	2	6	661949	661954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982092
14059	NC_016848	CGCT	2	8	661964	661971	0 %	25 %	25 %	50 %	378982092
14060	NC_016848	TAC	2	6	661989	661994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982092
14061	NC_016848	TCCCC	2	10	662027	662036	0 %	20 %	0 %	80 %	378982092
14062	NC_016848	GC	3	6	662061	662066	0 %	0 %	50 %	50 %	378982092
14063	NC_016848	CTG	2	6	662096	662101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982092
14064	NC_016848	AGA	2	6	662117	662122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982092
14065	NC_016848	TGCG	2	8	662144	662151	0 %	25 %	50 %	25 %	378982092
14066	NC_016848	GC	5	10	662163	662172	0 %	0 %	50 %	50 %	378982092
14067	NC_016848	CA	3	6	662263	662268	50 %	0 %	0 %	50 %	378982092
14068	NC_016848	ACT	2	6	662320	662325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982092
14069	NC_016848	GC	3	6	662344	662349	0 %	0 %	50 %	50 %	378982092
14070	NC_016848	GGCA	2	8	662370	662377	25 %	0 %	50 %	25 %	378982092
14071	NC_016848	GAC	2	6	662401	662406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982092
14072	NC_016848	T	6	6	662407	662412	0 %	100 %	0 %	0 %	378982092
14073	NC_016848	GC	3	6	662422	662427	0 %	0 %	50 %	50 %	378982092
14074	NC_016848	GCC	2	6	662528	662533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982092
14075	NC_016848	TGG	2	6	662552	662557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982092
14076	NC_016848	ACTG	2	8	662584	662591	25 %	25 %	25 %	25 %	378982092
14077	NC_016848	GCA	2	6	662632	662637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982092
14078	NC_016848	GC	3	6	662648	662653	0 %	0 %	50 %	50 %	378982092
14079	NC_016848	CCTT	2	8	662663	662670	0 %	50 %	0 %	50 %	378982092
14080	NC_016848	GC	3	6	662676	662681	0 %	0 %	50 %	50 %	378982092
14081	NC_016848	GCA	2	6	662685	662690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982092
14082	NC_016848	GC	3	6	662699	662704	0 %	0 %	50 %	50 %	378982092
14083	NC_016848	AC	3	6	662711	662716	50 %	0 %	0 %	50 %	378982092
14084	NC_016848	CG	3	6	662724	662729	0 %	0 %	50 %	50 %	378982092
14085	NC_016848	GC	3	6	662737	662742	0 %	0 %	50 %	50 %	378982092
14086	NC_016848	CG	3	6	662797	662802	0 %	0 %	50 %	50 %	378982092
14087	NC_016848	ACT	2	6	662838	662843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982092
14088	NC_016848	T	6	6	662913	662918	0 %	100 %	0 %	0 %	378982092
14089	NC_016848	AGA	2	6	662922	662927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982092
14090	NC_016848	TGC	2	6	663206	663211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982092
14091	NC_016848	CGC	2	6	663263	663268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982092
14092	NC_016848	CGG	2	6	663358	663363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982093
14093	NC_016848	ACGC	2	8	663366	663373	25 %	0 %	25 %	50 %	378982093
14094	NC_016848	CGG	2	6	663386	663391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982093
14095	NC_016848	CTC	2	6	663399	663404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982093
14096	NC_016848	CAG	2	6	663428	663433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982093
14097	NC_016848	GTCAG	2	10	663442	663451	20 %	20 %	40 %	20 %	378982093
14098	NC_016848	CTC	2	6	663466	663471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982093
14099	NC_016848	GTC	2	6	663477	663482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982093
14100	NC_016848	GCA	2	6	663484	663489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982093
14101	NC_016848	TG	3	6	663494	663499	0 %	50 %	50 %	0 %	378982093
14102	NC_016848	CGC	2	6	663530	663535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982093
14103	NC_016848	CCG	2	6	663598	663603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982093
14104	NC_016848	GCC	2	6	663612	663617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982093
14105	NC_016848	CGA	2	6	663636	663641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982093
14106	NC_016848	AGA	2	6	663696	663701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982093
14107	NC_016848	GC	3	6	663718	663723	0 %	0 %	50 %	50 %	378982093
14108	NC_016848	CA	3	6	663756	663761	50 %	0 %	0 %	50 %	378982093
14109	NC_016848	TG	3	6	663764	663769	0 %	50 %	50 %	0 %	378982093
14110	NC_016848	GTT	2	6	663780	663785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982093
14111	NC_016848	GC	3	6	663807	663812	0 %	0 %	50 %	50 %	378982093
14112	NC_016848	AGA	2	6	663915	663920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982093
14113	NC_016848	AGG	2	6	664043	664048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982093
14114	NC_016848	CGG	2	6	664077	664082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982093
14115	NC_016848	CTTT	2	8	664140	664147	0 %	75 %	0 %	25 %	378982093
14116	NC_016848	CTGCTC	2	12	664184	664195	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378982093
14117	NC_016848	GCG	2	6	664207	664212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982093
14118	NC_016848	GACGC	2	10	664249	664258	20 %	0 %	40 %	40 %	378982093
14119	NC_016848	CAGC	2	8	664304	664311	25 %	0 %	25 %	50 %	378982093
14120	NC_016848	GC	4	8	664394	664401	0 %	0 %	50 %	50 %	378982093
14121	NC_016848	CTC	2	6	664412	664417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982093
14122	NC_016848	GGT	2	6	664431	664436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982093
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14124	NC_016848	AGTT	2	8	664689	664696	25 %	50 %	25 %	0 %	378982093
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14493	NC_016848	ACG	2	6	681880	681885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982107
14494	NC_016848	CGA	2	6	681902	681907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982107
14495	NC_016848	CGGTGT	2	12	681917	681928	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378982107
14496	NC_016848	ACG	2	6	681964	681969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982107
14497	NC_016848	AGG	2	6	682108	682113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982107
14498	NC_016848	GCG	2	6	682116	682121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982107
14499	NC_016848	GCGCA	2	10	682137	682146	20 %	0 %	40 %	40 %	378982107
14500	NC_016848	TAC	2	6	682190	682195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982107

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