MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 24018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_016848	CTT	2	6	636832	636837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982070
13502	NC_016848	GTC	3	9	636905	636913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982070
13503	NC_016848	GT	3	6	636982	636987	0 %	50 %	50 %	0 %	378982070
13504	NC_016848	AGC	2	6	637056	637061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982070
13505	NC_016848	TGA	2	6	637126	637131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982070
13506	NC_016848	TAC	2	6	637133	637138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982070
13507	NC_016848	GC	3	6	637159	637164	0 %	0 %	50 %	50 %	378982070
13508	NC_016848	CAC	2	6	637201	637206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982070
13509	NC_016848	CGC	2	6	637314	637319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982071
13510	NC_016848	GTA	2	6	637332	637337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982071
13511	NC_016848	CTT	2	6	637344	637349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982071
13512	NC_016848	CT	3	6	637357	637362	0 %	50 %	0 %	50 %	378982071
13513	NC_016848	TTCC	2	8	637363	637370	0 %	50 %	0 %	50 %	378982071
13514	NC_016848	A	10	10	637372	637381	100 %	0 %	0 %	0 %	378982071
13515	NC_016848	CGC	2	6	637390	637395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982071
13516	NC_016848	GAAA	2	8	637407	637414	75 %	0 %	25 %	0 %	378982071
13517	NC_016848	CG	3	6	637471	637476	0 %	0 %	50 %	50 %	378982071
13518	NC_016848	GCT	2	6	637490	637495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982071
13519	NC_016848	TTTC	2	8	637622	637629	0 %	75 %	0 %	25 %	378982071
13520	NC_016848	GAATG	2	10	637692	637701	40 %	20 %	40 %	0 %	378982071
13521	NC_016848	T	6	6	637715	637720	0 %	100 %	0 %	0 %	378982071
13522	NC_016848	CAG	2	6	637837	637842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982071
13523	NC_016848	TTCA	2	8	637848	637855	25 %	50 %	0 %	25 %	378982071
13524	NC_016848	CAC	2	6	637866	637871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982071
13525	NC_016848	CCACC	2	10	637886	637895	20 %	0 %	0 %	80 %	378982071
13526	NC_016848	CG	3	6	637922	637927	0 %	0 %	50 %	50 %	378982071
13527	NC_016848	CA	3	6	637945	637950	50 %	0 %	0 %	50 %	378982071
13528	NC_016848	ACA	2	6	637988	637993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982071
13529	NC_016848	GTG	2	6	638010	638015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982071
13530	NC_016848	GC	3	6	638097	638102	0 %	0 %	50 %	50 %	378982071
13531	NC_016848	GGA	2	6	638288	638293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982071
13532	NC_016848	CG	3	6	638300	638305	0 %	0 %	50 %	50 %	378982071
13533	NC_016848	TATT	2	8	638307	638314	25 %	75 %	0 %	0 %	378982071
13534	NC_016848	GTA	2	6	638364	638369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982071
13535	NC_016848	GC	4	8	638385	638392	0 %	0 %	50 %	50 %	378982071
13536	NC_016848	CG	3	6	638394	638399	0 %	0 %	50 %	50 %	378982071
13537	NC_016848	CTC	2	6	638440	638445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982071
13538	NC_016848	AC	3	6	638667	638672	50 %	0 %	0 %	50 %	378982071
13539	NC_016848	CTG	2	6	638706	638711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982071
13540	NC_016848	TCG	2	6	638741	638746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982071
13541	NC_016848	CTT	2	6	638754	638759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982071
13542	NC_016848	GCAG	2	8	638762	638769	25 %	0 %	50 %	25 %	378982071
13543	NC_016848	TGCA	2	8	638815	638822	25 %	25 %	25 %	25 %	378982071
13544	NC_016848	GCG	2	6	638837	638842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982071
13545	NC_016848	AAG	2	6	638905	638910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982071
13546	NC_016848	A	6	6	639052	639057	100 %	0 %	0 %	0 %	378982072
13547	NC_016848	TG	3	6	639091	639096	0 %	50 %	50 %	0 %	378982072
13548	NC_016848	GCG	2	6	639123	639128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982072
13549	NC_016848	GGT	2	6	639235	639240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982072
13550	NC_016848	CG	3	6	639320	639325	0 %	0 %	50 %	50 %	378982072
13551	NC_016848	CAGA	2	8	639357	639364	50 %	0 %	25 %	25 %	378982072
13552	NC_016848	GAA	2	6	639535	639540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982072
13553	NC_016848	TGC	2	6	639553	639558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982072
13554	NC_016848	GTG	2	6	639587	639592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982072
13555	NC_016848	ATTGG	2	10	639692	639701	20 %	40 %	40 %	0 %	378982072
13556	NC_016848	GCG	2	6	639710	639715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982072
13557	NC_016848	AC	3	6	639868	639873	50 %	0 %	0 %	50 %	378982072
13558	NC_016848	GCA	2	6	639910	639915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982072
13559	NC_016848	A	6	6	639915	639920	100 %	0 %	0 %	0 %	378982072
13560	NC_016848	CAATC	2	10	639987	639996	40 %	20 %	0 %	40 %	378982072
13561	NC_016848	GTG	2	6	640132	640137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982072
13562	NC_016848	GTC	2	6	640222	640227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982072
13563	NC_016848	CG	3	6	640263	640268	0 %	0 %	50 %	50 %	378982072
13564	NC_016848	TTG	2	6	640277	640282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982072
13565	NC_016848	TCCT	2	8	640392	640399	0 %	50 %	0 %	50 %	378982072
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13568	NC_016848	CTG	2	6	640584	640589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982072
13569	NC_016848	GGT	2	6	640681	640686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982072
13570	NC_016848	CGT	2	6	640805	640810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982072
13571	NC_016848	GC	3	6	640832	640837	0 %	0 %	50 %	50 %	378982072
13572	NC_016848	ACG	2	6	640847	640852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982072
13573	NC_016848	GTC	2	6	640948	640953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982072
13574	NC_016848	TGA	2	6	640959	640964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982072
13575	NC_016848	A	6	6	641081	641086	100 %	0 %	0 %	0 %	378982072
13576	NC_016848	GGC	2	6	641109	641114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982072
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13578	NC_016848	GCAC	2	8	641163	641170	25 %	0 %	25 %	50 %	378982072
13579	NC_016848	GCA	2	6	641183	641188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982072
13580	NC_016848	CGA	2	6	641235	641240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982072
13581	NC_016848	TCAG	2	8	641270	641277	25 %	25 %	25 %	25 %	378982072
13582	NC_016848	ATG	2	6	641278	641283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982072
13583	NC_016848	GGA	2	6	641315	641320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982072
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13585	NC_016848	CAC	2	6	641375	641380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982072
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13587	NC_016848	TG	3	6	641405	641410	0 %	50 %	50 %	0 %	378982072
13588	NC_016848	GCACAC	2	12	641412	641423	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378982072
13589	NC_016848	TG	3	6	641475	641480	0 %	50 %	50 %	0 %	378982072
13590	NC_016848	GTG	2	6	641488	641493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982072
13591	NC_016848	CCG	2	6	641576	641581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982072
13592	NC_016848	GCA	2	6	641604	641609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982072
13593	NC_016848	TG	3	6	641694	641699	0 %	50 %	50 %	0 %	378982073
13594	NC_016848	GTCT	2	8	641788	641795	0 %	50 %	25 %	25 %	378982073
13595	NC_016848	GC	3	6	641849	641854	0 %	0 %	50 %	50 %	378982073
13596	NC_016848	TCC	2	6	641921	641926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982073
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13598	NC_016848	TCT	2	6	642086	642091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982073
13599	NC_016848	TG	3	6	642094	642099	0 %	50 %	50 %	0 %	378982073
13600	NC_016848	GCG	2	6	642133	642138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982073
13601	NC_016848	A	8	8	642148	642155	100 %	0 %	0 %	0 %	378982073
13602	NC_016848	GTT	2	6	642193	642198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982073
13603	NC_016848	CCA	2	6	642201	642206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982073
13604	NC_016848	AAG	2	6	642211	642216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982073
13605	NC_016848	CCT	2	6	642228	642233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982073
13606	NC_016848	A	9	9	642256	642264	100 %	0 %	0 %	0 %	378982073
13607	NC_016848	T	6	6	642283	642288	0 %	100 %	0 %	0 %	378982073
13608	NC_016848	AAC	2	6	642296	642301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982073
13609	NC_016848	A	6	6	642306	642311	100 %	0 %	0 %	0 %	378982073
13610	NC_016848	GC	3	6	642395	642400	0 %	0 %	50 %	50 %	378982073
13611	NC_016848	GCC	2	6	642403	642408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982073
13612	NC_016848	CTT	2	6	642448	642453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982073
13613	NC_016848	CG	3	6	642593	642598	0 %	0 %	50 %	50 %	378982073
13614	NC_016848	CCT	2	6	642603	642608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982073
13615	NC_016848	GCA	2	6	642798	642803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982074
13616	NC_016848	CAAC	2	8	642823	642830	50 %	0 %	0 %	50 %	378982074
13617	NC_016848	AGCCAT	2	12	642854	642865	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378982074
13618	NC_016848	ATA	2	6	642873	642878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982074
13619	NC_016848	TTCC	2	8	643022	643029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13620	NC_016848	T	6	6	643048	643053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13991	NC_016848	CA	3	6	659069	659074	50 %	0 %	0 %	50 %	378982088
13992	NC_016848	CAT	2	6	659115	659120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982088
13993	NC_016848	AGC	2	6	659160	659165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982088
13994	NC_016848	CCT	2	6	659180	659185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13995	NC_016848	AC	3	6	659231	659236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13996	NC_016848	CTCATC	2	12	659286	659297	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378982089
13997	NC_016848	CTC	2	6	659334	659339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982089
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13999	NC_016848	CTC	2	6	659421	659426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982089
14000	NC_016848	CCA	2	6	659579	659584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982089

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