MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 24018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016848	A	6	6	613363	613368	100 %	0 %	0 %	0 %	378982051
13002	NC_016848	TCC	2	6	613384	613389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982051
13003	NC_016848	CGA	2	6	613416	613421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982051
13004	NC_016848	ACC	2	6	613431	613436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982051
13005	NC_016848	CTT	2	6	613480	613485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982051
13006	NC_016848	CAC	2	6	613513	613518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982051
13007	NC_016848	TGCAC	2	10	613653	613662	20 %	20 %	20 %	40 %	378982051
13008	NC_016848	AGA	2	6	613695	613700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982051
13009	NC_016848	CGG	2	6	613731	613736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982051
13010	NC_016848	TCTTA	2	10	613773	613782	20 %	60 %	0 %	20 %	378982051
13011	NC_016848	TCA	2	6	613790	613795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982051
13012	NC_016848	CT	3	6	613804	613809	0 %	50 %	0 %	50 %	378982051
13013	NC_016848	TTTC	2	8	613825	613832	0 %	75 %	0 %	25 %	378982051
13014	NC_016848	TGG	2	6	613876	613881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982051
13015	NC_016848	GT	3	6	613909	613914	0 %	50 %	50 %	0 %	378982051
13016	NC_016848	T	8	8	613946	613953	0 %	100 %	0 %	0 %	378982051
13017	NC_016848	GCAC	2	8	613967	613974	25 %	0 %	25 %	50 %	378982051
13018	NC_016848	CTT	2	6	613996	614001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982051
13019	NC_016848	CGTG	2	8	614039	614046	0 %	25 %	50 %	25 %	378982051
13020	NC_016848	GGA	2	6	614101	614106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982051
13021	NC_016848	CTGT	2	8	614124	614131	0 %	50 %	25 %	25 %	378982051
13022	NC_016848	T	6	6	614144	614149	0 %	100 %	0 %	0 %	378982051
13023	NC_016848	CAG	2	6	614171	614176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982051
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13025	NC_016848	GAC	2	6	614234	614239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982051
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13027	NC_016848	TCT	2	6	614262	614267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982051
13028	NC_016848	CCTT	2	8	614276	614283	0 %	50 %	0 %	50 %	378982051
13029	NC_016848	CCA	2	6	614328	614333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982051
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13031	NC_016848	CT	3	6	614387	614392	0 %	50 %	0 %	50 %	378982051
13032	NC_016848	T	6	6	614392	614397	0 %	100 %	0 %	0 %	378982051
13033	NC_016848	ACTG	2	8	614466	614473	25 %	25 %	25 %	25 %	378982051
13034	NC_016848	GCAC	2	8	614617	614624	25 %	0 %	25 %	50 %	378982051
13035	NC_016848	AC	3	6	614623	614628	50 %	0 %	0 %	50 %	378982051
13036	NC_016848	CGG	2	6	614642	614647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982051
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13038	NC_016848	CTG	2	6	614786	614791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982051
13039	NC_016848	GC	3	6	614857	614862	0 %	0 %	50 %	50 %	378982051
13040	NC_016848	CCA	2	6	614863	614868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982051
13041	NC_016848	TCG	2	6	615040	615045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982051
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13044	NC_016848	CAC	2	6	615145	615150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982052
13045	NC_016848	CGTG	2	8	615202	615209	0 %	25 %	50 %	25 %	378982052
13046	NC_016848	ACT	2	6	615300	615305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982052
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13048	NC_016848	TG	3	6	615395	615400	0 %	50 %	50 %	0 %	378982052
13049	NC_016848	AAT	2	6	615404	615409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982052
13050	NC_016848	GC	3	6	615420	615425	0 %	0 %	50 %	50 %	378982052
13051	NC_016848	T	6	6	615427	615432	0 %	100 %	0 %	0 %	378982052
13052	NC_016848	CG	3	6	615440	615445	0 %	0 %	50 %	50 %	378982052
13053	NC_016848	CA	4	8	615467	615474	50 %	0 %	0 %	50 %	378982052
13054	NC_016848	CAT	2	6	615487	615492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982052
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13056	NC_016848	TTG	2	6	615548	615553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982052
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13062	NC_016848	GTT	2	6	615765	615770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982052
13063	NC_016848	TTTC	2	8	615771	615778	0 %	75 %	0 %	25 %	378982052
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13068	NC_016848	TTA	2	6	616161	616166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982052
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13088	NC_016848	ACC	2	6	617101	617106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982053
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13091	NC_016848	A	7	7	617220	617226	100 %	0 %	0 %	0 %	378982053
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13093	NC_016848	AT	3	6	617342	617347	50 %	50 %	0 %	0 %	378982053
13094	NC_016848	TG	3	6	617373	617378	0 %	50 %	50 %	0 %	378982053
13095	NC_016848	GCAC	2	8	617404	617411	25 %	0 %	25 %	50 %	378982053
13096	NC_016848	AAAAG	2	10	617447	617456	80 %	0 %	20 %	0 %	378982053
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13102	NC_016848	A	7	7	617708	617714	100 %	0 %	0 %	0 %	378982053
13103	NC_016848	CAG	2	6	617760	617765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982054
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13106	NC_016848	CCA	2	6	617871	617876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982054
13107	NC_016848	ATC	2	6	617902	617907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982054
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13109	NC_016848	CAA	2	6	618003	618008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982054
13110	NC_016848	GC	4	8	618039	618046	0 %	0 %	50 %	50 %	378982054
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13112	NC_016848	CAG	2	6	618189	618194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982054
13113	NC_016848	CTCC	2	8	618204	618211	0 %	25 %	0 %	75 %	378982054
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13118	NC_016848	CCA	2	6	618438	618443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13119	NC_016848	CTG	2	6	618475	618480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982055
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13124	NC_016848	TAC	2	6	618697	618702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982055
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13127	NC_016848	CTG	2	6	618847	618852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982055
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13214	NC_016848	CA	3	6	622416	622421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13227	NC_016848	CGGTTG	2	12	623109	623120	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378982059
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13230	NC_016848	GCC	2	6	623215	623220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982059
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13240	NC_016848	AGG	2	6	623629	623634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982059
13241	NC_016848	AAAGG	2	10	623637	623646	60 %	0 %	40 %	0 %	378982059
13242	NC_016848	TCA	2	6	623756	623761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982059
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13245	NC_016848	GCT	2	6	623927	623932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982059
13246	NC_016848	TTC	2	6	623944	623949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982059
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13249	NC_016848	CAGA	2	8	624106	624113	50 %	0 %	25 %	25 %	378982059
13250	NC_016848	GC	3	6	624140	624145	0 %	0 %	50 %	50 %	378982059
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13252	NC_016848	AC	3	6	624273	624278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13253	NC_016848	CGCA	2	8	624316	624323	25 %	0 %	25 %	50 %	378982060
13254	NC_016848	AACCT	2	10	624341	624350	40 %	20 %	0 %	40 %	378982060
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13350	NC_016848	CCCG	2	8	629173	629180	0 %	0 %	25 %	75 %	378982064
13351	NC_016848	A	7	7	629306	629312	100 %	0 %	0 %	0 %	378982064
13352	NC_016848	TTTC	2	8	629328	629335	0 %	75 %	0 %	25 %	378982064
13353	NC_016848	AGCGCG	2	12	629347	629358	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378982064
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13366	NC_016848	GCA	2	6	630099	630104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982064
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13373	NC_016848	CG	3	6	630618	630623	0 %	0 %	50 %	50 %	378982064
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13475	NC_016848	TC	3	6	635114	635119	0 %	50 %	0 %	50 %	378982069
13476	NC_016848	CTTT	2	8	635136	635143	0 %	75 %	0 %	25 %	378982069
13477	NC_016848	ATCG	2	8	635254	635261	25 %	25 %	25 %	25 %	378982069
13478	NC_016848	GTTATT	2	12	635291	635302	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378982069
13479	NC_016848	TAG	2	6	635323	635328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982069
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13481	NC_016848	CTC	2	6	635410	635415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982069
13482	NC_016848	AGG	2	6	635702	635707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982069
13483	NC_016848	CAT	2	6	635735	635740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982069
13484	NC_016848	T	7	7	635810	635816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13485	NC_016848	AGA	2	6	635860	635865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13486	NC_016848	GAA	2	6	635894	635899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982070
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13489	NC_016848	ACT	2	6	636192	636197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982070
13490	NC_016848	ACC	2	6	636287	636292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982070
13491	NC_016848	AC	3	6	636303	636308	50 %	0 %	0 %	50 %	378982070
13492	NC_016848	GCT	2	6	636344	636349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982070
13493	NC_016848	CAGCA	2	10	636415	636424	40 %	0 %	20 %	40 %	378982070
13494	NC_016848	CAA	2	6	636517	636522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982070
13495	NC_016848	GA	3	6	636613	636618	50 %	0 %	50 %	0 %	378982070
13496	NC_016848	TCC	2	6	636657	636662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982070
13497	NC_016848	GAA	2	6	636671	636676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982070
13498	NC_016848	TCT	2	6	636677	636682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982070
13499	NC_016848	TAC	2	6	636726	636731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982070
13500	NC_016848	GAG	2	6	636803	636808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982070

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