MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 chromosome

Total Repeats: 24018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016848	AT	3	6	543736	543741	50 %	50 %	0 %	0 %	378981988
11502	NC_016848	AGC	2	6	543838	543843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981988
11503	NC_016848	TGA	3	9	543860	543868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981988
11504	NC_016848	GGC	2	6	543976	543981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378981988
11505	NC_016848	T	6	6	544122	544127	0 %	100 %	0 %	0 %	378981988
11506	NC_016848	CAG	2	6	544128	544133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981988
11507	NC_016848	AGC	2	6	544162	544167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981988
11508	NC_016848	TTG	2	6	544174	544179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981988
11509	NC_016848	CTT	2	6	544185	544190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981988
11510	NC_016848	AGCAGG	2	12	544192	544203	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378981988
11511	NC_016848	CTG	2	6	544213	544218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981988
11512	NC_016848	GTAC	2	8	544235	544242	25 %	25 %	25 %	25 %	378981988
11513	NC_016848	TAT	2	6	544287	544292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378981988
11514	NC_016848	GGA	2	6	544298	544303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981988
11515	NC_016848	TG	3	6	544318	544323	0 %	50 %	50 %	0 %	378981988
11516	NC_016848	TG	3	6	544368	544373	0 %	50 %	50 %	0 %	378981988
11517	NC_016848	TGAC	2	8	544399	544406	25 %	25 %	25 %	25 %	378981988
11518	NC_016848	TTC	2	6	544408	544413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981988
11519	NC_016848	CGTG	2	8	544425	544432	0 %	25 %	50 %	25 %	378981988
11520	NC_016848	G	6	6	544473	544478	0 %	0 %	100 %	0 %	378981989
11521	NC_016848	T	6	6	544499	544504	0 %	100 %	0 %	0 %	378981989
11522	NC_016848	TTG	2	6	544510	544515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981989
11523	NC_016848	TAT	2	6	544524	544529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378981989
11524	NC_016848	GGCGG	2	10	544642	544651	0 %	0 %	80 %	20 %	378981989
11525	NC_016848	TACGA	2	10	544672	544681	40 %	20 %	20 %	20 %	378981989
11526	NC_016848	GCA	2	6	544683	544688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981989
11527	NC_016848	GCA	2	6	544738	544743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981989
11528	NC_016848	AGG	2	6	544755	544760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981989
11529	NC_016848	TCT	2	6	544789	544794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981989
11530	NC_016848	TGA	2	6	544799	544804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981989
11531	NC_016848	GGCA	2	8	544832	544839	25 %	0 %	50 %	25 %	378981989
11532	NC_016848	TG	3	6	544845	544850	0 %	50 %	50 %	0 %	378981989
11533	NC_016848	GGA	2	6	544938	544943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378981989
11534	NC_016848	TTC	2	6	544957	544962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981989
11535	NC_016848	GCT	2	6	545055	545060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981990
11536	NC_016848	A	7	7	545071	545077	100 %	0 %	0 %	0 %	378981990
11537	NC_016848	ATT	2	6	545127	545132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378981990
11538	NC_016848	AGGT	2	8	545314	545321	25 %	25 %	50 %	0 %	378981990
11539	NC_016848	ATTG	2	8	545341	545348	25 %	50 %	25 %	0 %	378981990
11540	NC_016848	TGC	2	6	545361	545366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981990
11541	NC_016848	CTA	2	6	545451	545456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981990
11542	NC_016848	TTA	2	6	545501	545506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378981990
11543	NC_016848	TGA	2	6	545566	545571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981990
11544	NC_016848	CAG	2	6	545639	545644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981990
11545	NC_016848	AAT	2	6	545656	545661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378981990
11546	NC_016848	G	6	6	545692	545697	0 %	0 %	100 %	0 %	378981990
11547	NC_016848	TGG	2	6	545758	545763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981990
11548	NC_016848	CGTT	2	8	545766	545773	0 %	50 %	25 %	25 %	378981990
11549	NC_016848	GT	3	6	545801	545806	0 %	50 %	50 %	0 %	378981990
11550	NC_016848	GAT	2	6	545888	545893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981990
11551	NC_016848	GTCTT	2	10	546051	546060	0 %	60 %	20 %	20 %	378981990
11552	NC_016848	TGA	2	6	546061	546066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981990
11553	NC_016848	CAG	2	6	546089	546094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981990
11554	NC_016848	A	6	6	546105	546110	100 %	0 %	0 %	0 %	378981990
11555	NC_016848	GAA	2	6	546208	546213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378981990
11556	NC_016848	TGGTG	2	10	546272	546281	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_016848	ACTTT	2	10	546304	546313	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11558	NC_016848	GTTT	2	8	546319	546326	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_016848	G	6	6	546422	546427	0 %	0 %	100 %	0 %	378981991
11560	NC_016848	TG	3	6	546505	546510	0 %	50 %	50 %	0 %	378981991
11561	NC_016848	CG	4	8	546532	546539	0 %	0 %	50 %	50 %	378981991
11562	NC_016848	GACA	2	8	546625	546632	50 %	0 %	25 %	25 %	378981991
11563	NC_016848	GAT	2	6	546655	546660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981991
11564	NC_016848	GTT	2	6	546700	546705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981991
11565	NC_016848	TCAG	2	8	546826	546833	25 %	25 %	25 %	25 %	378981991
11566	NC_016848	GC	3	6	546948	546953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11567	NC_016848	TGC	2	6	546986	546991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11568	NC_016848	TG	3	6	546998	547003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_016848	GCA	2	6	547039	547044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_016848	A	6	6	547095	547100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_016848	CCA	2	6	547177	547182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981992
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11573	NC_016848	CG	3	6	547294	547299	0 %	0 %	50 %	50 %	378981992
11574	NC_016848	CCG	2	6	547311	547316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981992
11575	NC_016848	CTG	2	6	547343	547348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981992
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11579	NC_016848	CA	3	6	547762	547767	50 %	0 %	0 %	50 %	378981992
11580	NC_016848	GCT	2	6	547855	547860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981992
11581	NC_016848	ACT	2	6	547863	547868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981992
11582	NC_016848	CGT	2	6	547951	547956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981992
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11585	NC_016848	CA	3	6	548161	548166	50 %	0 %	0 %	50 %	378981992
11586	NC_016848	TCT	2	6	548208	548213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378981992
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11589	NC_016848	AC	3	6	548437	548442	50 %	0 %	0 %	50 %	378981992
11590	NC_016848	ACC	2	6	548610	548615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981992
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11592	NC_016848	GC	3	6	548643	548648	0 %	0 %	50 %	50 %	378981992
11593	NC_016848	AC	3	6	548735	548740	50 %	0 %	0 %	50 %	378981992
11594	NC_016848	TGT	2	6	548785	548790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378981992
11595	NC_016848	GC	4	8	548800	548807	0 %	0 %	50 %	50 %	378981992
11596	NC_016848	CG	4	8	548825	548832	0 %	0 %	50 %	50 %	378981992
11597	NC_016848	GC	3	6	548925	548930	0 %	0 %	50 %	50 %	378981992
11598	NC_016848	TAG	2	6	548932	548937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378981992
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11601	NC_016848	GTG	2	6	549098	549103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981993
11602	NC_016848	A	6	6	549144	549149	100 %	0 %	0 %	0 %	378981993
11603	NC_016848	GCT	2	6	549166	549171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981993
11604	NC_016848	TAC	2	6	549173	549178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378981993
11605	NC_016848	AGGA	2	8	549263	549270	50 %	0 %	50 %	0 %	378981993
11606	NC_016848	GC	3	6	549277	549282	0 %	0 %	50 %	50 %	378981993
11607	NC_016848	TCTG	2	8	549292	549299	0 %	50 %	25 %	25 %	378981993
11608	NC_016848	GTG	2	6	549366	549371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981993
11609	NC_016848	GCTC	2	8	549399	549406	0 %	25 %	25 %	50 %	378981993
11610	NC_016848	ACC	2	6	549408	549413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378981993
11611	NC_016848	CGC	2	6	549606	549611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378981994
11612	NC_016848	GCAG	2	8	549628	549635	25 %	0 %	50 %	25 %	378981994
11613	NC_016848	GGT	2	6	549655	549660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378981994
11614	NC_016848	GT	3	6	549663	549668	0 %	50 %	50 %	0 %	378981994
11615	NC_016848	CCT	2	6	549717	549722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378981994
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11619	NC_016848	GC	3	6	549909	549914	0 %	0 %	50 %	50 %	378981994
11620	NC_016848	ACG	2	6	549962	549967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378981994
11621	NC_016848	ATTC	2	8	549997	550004	25 %	50 %	0 %	25 %	378981994
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11623	NC_016848	GCT	2	6	550183	550188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378981994
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11992	NC_016848	CAG	2	6	567698	567703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982005
11993	NC_016848	CGC	2	6	567718	567723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982005
11994	NC_016848	GC	4	8	567722	567729	0 %	0 %	50 %	50 %	378982005
11995	NC_016848	TCG	2	6	567750	567755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982005
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11997	NC_016848	GC	4	8	567906	567913	0 %	0 %	50 %	50 %	378982005
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11999	NC_016848	CAG	2	6	567959	567964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982005
12000	NC_016848	GAT	2	6	567965	567970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982005

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