MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_016844	T	7	7	124323	124329	0 %	100 %	0 %	0 %	378974741
2503	NC_016844	GCG	2	6	124346	124351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974741
2504	NC_016844	CGCAG	2	10	124396	124405	20 %	0 %	40 %	40 %	378974741
2505	NC_016844	AGCAC	2	10	124432	124441	40 %	0 %	20 %	40 %	378974741
2506	NC_016844	TG	3	6	124446	124451	0 %	50 %	50 %	0 %	378974741
2507	NC_016844	GC	3	6	124500	124505	0 %	0 %	50 %	50 %	378974741
2508	NC_016844	ATA	2	6	124518	124523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974741
2509	NC_016844	CACG	2	8	124535	124542	25 %	0 %	25 %	50 %	378974741
2510	NC_016844	TTG	2	6	124548	124553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974741
2511	NC_016844	T	6	6	124564	124569	0 %	100 %	0 %	0 %	378974741
2512	NC_016844	GCA	2	6	124594	124599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974741
2513	NC_016844	GC	4	8	124604	124611	0 %	0 %	50 %	50 %	378974741
2514	NC_016844	TCC	2	6	124665	124670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_016844	GC	3	6	124686	124691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2516	NC_016844	ACTG	2	8	124706	124713	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2517	NC_016844	TG	3	6	124752	124757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_016844	GCT	2	6	124787	124792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_016844	TGAG	2	8	124849	124856	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_016844	CCTC	2	8	124903	124910	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2521	NC_016844	TG	4	8	124948	124955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_016844	TCC	2	6	124966	124971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2523	NC_016844	AGA	2	6	125031	125036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_016844	GAG	2	6	125084	125089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_016844	TCTCAA	2	12	125129	125140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_016844	GT	3	6	125174	125179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_016844	GAAC	2	8	125213	125220	50 %	0 %	25 %	25 %	378974742
2528	NC_016844	TGG	2	6	125242	125247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974742
2529	NC_016844	GC	3	6	125351	125356	0 %	0 %	50 %	50 %	378974742
2530	NC_016844	AG	3	6	125376	125381	50 %	0 %	50 %	0 %	378974742
2531	NC_016844	GGCG	2	8	125390	125397	0 %	0 %	75 %	25 %	378974742
2532	NC_016844	T	8	8	125403	125410	0 %	100 %	0 %	0 %	378974742
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2542	NC_016844	CCT	2	6	125756	125761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974742
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2545	NC_016844	T	6	6	125851	125856	0 %	100 %	0 %	0 %	378974742
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2548	NC_016844	GT	3	6	125960	125965	0 %	50 %	50 %	0 %	378974742
2549	NC_016844	AGCA	2	8	125976	125983	50 %	0 %	25 %	25 %	378974742
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2557	NC_016844	A	6	6	126413	126418	100 %	0 %	0 %	0 %	378974742
2558	NC_016844	GC	3	6	126438	126443	0 %	0 %	50 %	50 %	378974742
2559	NC_016844	CCG	2	6	126453	126458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974742
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2562	NC_016844	CTTG	2	8	126698	126705	0 %	50 %	25 %	25 %	378974742
2563	NC_016844	CATTG	2	10	126726	126735	20 %	40 %	20 %	20 %	378974742
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2569	NC_016844	CCGTG	2	10	127087	127096	0 %	20 %	40 %	40 %	378974743
2570	NC_016844	TCG	2	6	127135	127140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974743
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2599	NC_016844	AACCA	2	10	128811	128820	60 %	0 %	0 %	40 %	378974744
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2605	NC_016844	GAA	2	6	129137	129142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974744
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2610	NC_016844	TCA	2	6	129404	129409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974744
2611	NC_016844	AAAAG	2	10	129462	129471	80 %	0 %	20 %	0 %	378974744
2612	NC_016844	CG	3	6	129527	129532	0 %	0 %	50 %	50 %	378974744
2613	NC_016844	GCA	2	6	129542	129547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974744
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2617	NC_016844	TG	4	8	129617	129624	0 %	50 %	50 %	0 %	378974744
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2625	NC_016844	TG	3	6	129817	129822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2864	NC_016844	GA	3	6	142296	142301	50 %	0 %	50 %	0 %	378974755
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2871	NC_016844	T	7	7	142726	142732	0 %	100 %	0 %	0 %	378974755
2872	NC_016844	AGCCA	2	10	142741	142750	40 %	0 %	20 %	40 %	378974755
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