MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23003	NC_016844	G	6	6	1090348	1090353	0 %	0 %	100 %	0 %	378975646
23004	NC_016844	GGTC	2	8	1090355	1090362	0 %	25 %	50 %	25 %	378975646
23005	NC_016844	GTT	2	6	1090403	1090408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975646
23006	NC_016844	ACG	2	6	1090429	1090434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23007	NC_016844	A	6	6	1090491	1090496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23008	NC_016844	GC	3	6	1090551	1090556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23009	NC_016844	CTT	2	6	1090557	1090562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23010	NC_016844	GGC	2	6	1090572	1090577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23011	NC_016844	AGG	2	6	1090635	1090640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975647
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23013	NC_016844	CG	3	6	1090665	1090670	0 %	0 %	50 %	50 %	378975647
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23023	NC_016844	ATGG	2	8	1091013	1091020	25 %	25 %	50 %	0 %	378975647
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23103	NC_016844	T	6	6	1094647	1094652	0 %	100 %	0 %	0 %	378975651
23104	NC_016844	GGT	2	6	1094666	1094671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975651
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23119	NC_016844	AC	3	6	1095257	1095262	50 %	0 %	0 %	50 %	378975652
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23237	NC_016844	TCC	2	6	1101071	1101076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975655
23238	NC_016844	TCC	2	6	1101086	1101091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975655
23239	NC_016844	ACG	2	6	1101141	1101146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975655
23240	NC_016844	ATT	2	6	1101235	1101240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975655
23241	NC_016844	ACTGCA	2	12	1101329	1101340	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975655
23242	NC_016844	ACC	2	6	1101373	1101378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975655
23243	NC_016844	GCA	2	6	1101380	1101385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975655
23244	NC_016844	CGCA	2	8	1101415	1101422	25 %	0 %	25 %	50 %	378975655
23245	NC_016844	TCCC	2	8	1101444	1101451	0 %	25 %	0 %	75 %	378975655
23246	NC_016844	TGC	2	6	1101483	1101488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975655
23247	NC_016844	TGA	2	6	1101542	1101547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975655
23248	NC_016844	GC	3	6	1101556	1101561	0 %	0 %	50 %	50 %	378975655
23249	NC_016844	TCAT	2	8	1101650	1101657	25 %	50 %	0 %	25 %	378975655
23250	NC_016844	GAG	2	6	1101693	1101698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975655
23251	NC_016844	CTG	2	6	1101758	1101763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975655
23252	NC_016844	GTGC	2	8	1101832	1101839	0 %	25 %	50 %	25 %	378975655
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23254	NC_016844	GC	3	6	1101958	1101963	0 %	0 %	50 %	50 %	378975655
23255	NC_016844	CAGT	2	8	1101996	1102003	25 %	25 %	25 %	25 %	378975655
23256	NC_016844	TAA	2	6	1102017	1102022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975655
23257	NC_016844	CTT	2	6	1102053	1102058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975655
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23259	NC_016844	TTG	2	6	1102120	1102125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975655
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23261	NC_016844	T	6	6	1102196	1102201	0 %	100 %	0 %	0 %	378975655
23262	NC_016844	CTTCA	2	10	1102231	1102240	20 %	40 %	0 %	40 %	378975655
23263	NC_016844	TGA	2	6	1102362	1102367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975655
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23266	NC_016844	TGA	2	6	1102473	1102478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975655
23267	NC_016844	AT	3	6	1102484	1102489	50 %	50 %	0 %	0 %	378975655
23268	NC_016844	TCCG	2	8	1102493	1102500	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23269	NC_016844	CG	3	6	1102588	1102593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23270	NC_016844	GAA	2	6	1102594	1102599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23272	NC_016844	TTCA	2	8	1102960	1102967	25 %	50 %	0 %	25 %	378975656
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23275	NC_016844	CA	3	6	1103076	1103081	50 %	0 %	0 %	50 %	378975656
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23281	NC_016844	GCA	2	6	1103372	1103377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975656
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23284	NC_016844	TTTCG	2	10	1103547	1103556	0 %	60 %	20 %	20 %	378975656
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23289	NC_016844	TTC	2	6	1103713	1103718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23298	NC_016844	TTCT	2	8	1104279	1104286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23299	NC_016844	TCC	2	6	1104296	1104301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23300	NC_016844	CTTC	2	8	1104322	1104329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23301	NC_016844	T	7	7	1104378	1104384	0 %	100 %	0 %	0 %	378975658
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23326	NC_016844	CATGCA	2	12	1105781	1105792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975659
23327	NC_016844	TTC	2	6	1105795	1105800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975659
23328	NC_016844	GTAC	2	8	1105911	1105918	25 %	25 %	25 %	25 %	378975659
23329	NC_016844	GC	3	6	1106023	1106028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23330	NC_016844	TTC	2	6	1106043	1106048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23331	NC_016844	CG	3	6	1106074	1106079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23332	NC_016844	GAG	2	6	1106125	1106130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23333	NC_016844	ATC	3	9	1106209	1106217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975660
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23335	NC_016844	CTG	2	6	1106362	1106367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975660
23336	NC_016844	AGT	2	6	1106399	1106404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975660
23337	NC_016844	GC	4	8	1106425	1106432	0 %	0 %	50 %	50 %	378975661
23338	NC_016844	CG	3	6	1106445	1106450	0 %	0 %	50 %	50 %	378975661
23339	NC_016844	TGC	2	6	1106469	1106474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975661
23340	NC_016844	TC	3	6	1106502	1106507	0 %	50 %	0 %	50 %	378975661
23341	NC_016844	CGC	2	6	1106525	1106530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975661
23342	NC_016844	GC	3	6	1106534	1106539	0 %	0 %	50 %	50 %	378975661
23343	NC_016844	TTC	2	6	1106549	1106554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975661
23344	NC_016844	CCT	2	6	1106572	1106577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975661
23345	NC_016844	CG	3	6	1106599	1106604	0 %	0 %	50 %	50 %	378975661
23346	NC_016844	CGCTG	2	10	1106690	1106699	0 %	20 %	40 %	40 %	378975661
23347	NC_016844	CCA	2	6	1106725	1106730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975661
23348	NC_016844	GCA	2	6	1106772	1106777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975661
23349	NC_016844	ACC	2	6	1106804	1106809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975661
23350	NC_016844	A	6	6	1106855	1106860	100 %	0 %	0 %	0 %	378975661
23351	NC_016844	TG	3	6	1106886	1106891	0 %	50 %	50 %	0 %	378975661
23352	NC_016844	GC	3	6	1106923	1106928	0 %	0 %	50 %	50 %	378975661
23353	NC_016844	GCCC	2	8	1107000	1107007	0 %	0 %	25 %	75 %	378975661
23354	NC_016844	C	6	6	1107106	1107111	0 %	0 %	0 %	100 %	378975661
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23356	NC_016844	CTGT	2	8	1107143	1107150	0 %	50 %	25 %	25 %	378975661
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23470	NC_016844	GTC	2	6	1112591	1112596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975666
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23472	NC_016844	TC	3	6	1112637	1112642	0 %	50 %	0 %	50 %	378975666
23473	NC_016844	ATCC	2	8	1112669	1112676	25 %	25 %	0 %	50 %	378975666
23474	NC_016844	GC	3	6	1112678	1112683	0 %	0 %	50 %	50 %	378975666
23475	NC_016844	A	6	6	1112724	1112729	100 %	0 %	0 %	0 %	378975666
23476	NC_016844	AGG	2	6	1112856	1112861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975666
23477	NC_016844	TTGCCA	2	12	1112907	1112918	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975666
23478	NC_016844	TGC	2	6	1112931	1112936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975666
23479	NC_016844	ATGA	2	8	1113011	1113018	50 %	25 %	25 %	0 %	378975666
23480	NC_016844	CAC	2	6	1113050	1113055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975666
23481	NC_016844	GTGTT	2	10	1113070	1113079	0 %	60 %	40 %	0 %	378975666
23482	NC_016844	CTG	2	6	1113114	1113119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975666
23483	NC_016844	TGG	2	6	1113144	1113149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975666
23484	NC_016844	AAC	2	6	1113257	1113262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975666
23485	NC_016844	AG	3	6	1113319	1113324	50 %	0 %	50 %	0 %	378975666
23486	NC_016844	CG	3	6	1113372	1113377	0 %	0 %	50 %	50 %	378975666
23487	NC_016844	GA	3	6	1113413	1113418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23488	NC_016844	CAA	2	6	1113496	1113501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975667
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23492	NC_016844	CTG	2	6	1113733	1113738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975667
23493	NC_016844	CG	4	8	1113837	1113844	0 %	0 %	50 %	50 %	378975667
23494	NC_016844	TGCG	2	8	1113948	1113955	0 %	25 %	50 %	25 %	378975668
23495	NC_016844	AC	3	6	1113978	1113983	50 %	0 %	0 %	50 %	378975668
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23497	NC_016844	CG	3	6	1114039	1114044	0 %	0 %	50 %	50 %	378975668
23498	NC_016844	G	6	6	1114103	1114108	0 %	0 %	100 %	0 %	378975668
23499	NC_016844	GAAAG	2	10	1114168	1114177	60 %	0 %	40 %	0 %	378975668
23500	NC_016844	GTT	2	6	1114235	1114240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975668

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