MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22003	NC_016844	TCG	2	6	1042543	1042548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975602
22004	NC_016844	GCA	2	6	1042569	1042574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975602
22005	NC_016844	TGG	2	6	1042597	1042602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975602
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22008	NC_016844	CGT	2	6	1042796	1042801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975602
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22015	NC_016844	TGC	2	6	1043041	1043046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22119	NC_016844	GC	5	10	1048024	1048033	0 %	0 %	50 %	50 %	378975608
22120	NC_016844	GCT	2	6	1048045	1048050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975608
22121	NC_016844	CCT	2	6	1048056	1048061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975608
22122	NC_016844	GAGC	2	8	1048081	1048088	25 %	0 %	50 %	25 %	378975608
22123	NC_016844	A	6	6	1048209	1048214	100 %	0 %	0 %	0 %	378975608
22124	NC_016844	TGA	2	6	1048313	1048318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975608
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22149	NC_016844	CTTC	2	8	1049465	1049472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22150	NC_016844	TGA	2	6	1049559	1049564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975610
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22184	NC_016844	TGCG	2	8	1051107	1051114	0 %	25 %	50 %	25 %	378975610
22185	NC_016844	C	6	6	1051124	1051129	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22186	NC_016844	GCA	2	6	1051138	1051143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22190	NC_016844	TTCGCC	2	12	1051233	1051244	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975611
22191	NC_016844	CGTA	2	8	1051260	1051267	25 %	25 %	25 %	25 %	378975611
22192	NC_016844	CG	3	6	1051293	1051298	0 %	0 %	50 %	50 %	378975611
22193	NC_016844	GC	3	6	1051330	1051335	0 %	0 %	50 %	50 %	378975611
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22197	NC_016844	CG	3	6	1051725	1051730	0 %	0 %	50 %	50 %	378975611
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22216	NC_016844	GCC	2	6	1052568	1052573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975611
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22218	NC_016844	CCCA	2	8	1052624	1052631	25 %	0 %	0 %	75 %	378975611
22219	NC_016844	ATG	2	6	1052639	1052644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975611
22220	NC_016844	AC	3	6	1052665	1052670	50 %	0 %	0 %	50 %	378975611
22221	NC_016844	GCC	2	6	1052676	1052681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975611
22222	NC_016844	ACC	2	6	1052699	1052704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975611
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22224	NC_016844	CG	3	6	1052834	1052839	0 %	0 %	50 %	50 %	378975612
22225	NC_016844	TCC	2	6	1052848	1052853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975612
22226	NC_016844	CG	3	6	1052862	1052867	0 %	0 %	50 %	50 %	378975612
22227	NC_016844	GC	3	6	1052873	1052878	0 %	0 %	50 %	50 %	378975612
22228	NC_016844	CG	3	6	1052910	1052915	0 %	0 %	50 %	50 %	378975612
22229	NC_016844	TGC	2	6	1052935	1052940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975612
22230	NC_016844	TCTTGC	2	12	1053023	1053034	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378975612
22231	NC_016844	CTC	2	6	1053040	1053045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975612
22232	NC_016844	GCGCG	2	10	1053315	1053324	0 %	0 %	60 %	40 %	378975612
22233	NC_016844	GCC	2	6	1053347	1053352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975612
22234	NC_016844	CGAG	2	8	1053387	1053394	25 %	0 %	50 %	25 %	378975612
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22236	NC_016844	GCA	2	6	1053429	1053434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975612
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22473	NC_016844	G	6	6	1064005	1064010	0 %	0 %	100 %	0 %	378975622
22474	NC_016844	GC	3	6	1064038	1064043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22475	NC_016844	CG	3	6	1064114	1064119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22476	NC_016844	TG	3	6	1064120	1064125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22477	NC_016844	CG	3	6	1064127	1064132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22478	NC_016844	CG	3	6	1064160	1064165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22479	NC_016844	GTA	2	6	1064262	1064267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975623
22480	NC_016844	ACG	2	6	1064276	1064281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975623
22481	NC_016844	CAT	2	6	1064297	1064302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975623
22482	NC_016844	GCC	2	6	1064331	1064336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975623
22483	NC_016844	GATA	2	8	1064423	1064430	50 %	25 %	25 %	0 %	378975623
22484	NC_016844	A	6	6	1064437	1064442	100 %	0 %	0 %	0 %	378975623
22485	NC_016844	ACT	2	6	1064488	1064493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975623
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22487	NC_016844	ATC	2	6	1064577	1064582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975623
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22491	NC_016844	TTTC	2	8	1064713	1064720	0 %	75 %	0 %	25 %	378975623
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22497	NC_016844	CAA	2	6	1064980	1064985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975624
22498	NC_016844	ATC	2	6	1064996	1065001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975624
22499	NC_016844	TC	3	6	1065022	1065027	0 %	50 %	0 %	50 %	378975624
22500	NC_016844	T	6	6	1065040	1065045	0 %	100 %	0 %	0 %	378975624

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