MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21005	NC_016844	T	7	7	995589	995595	0 %	100 %	0 %	0 %	378975557
21006	NC_016844	AG	3	6	995650	995655	50 %	0 %	50 %	0 %	378975557
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21122	NC_016844	GC	4	8	1000375	1000382	0 %	0 %	50 %	50 %	378975562
21123	NC_016844	GGCT	2	8	1000405	1000412	0 %	25 %	50 %	25 %	378975562
21124	NC_016844	TG	3	6	1000421	1000426	0 %	50 %	50 %	0 %	378975562
21125	NC_016844	CG	4	8	1000480	1000487	0 %	0 %	50 %	50 %	378975562
21126	NC_016844	TA	3	6	1000525	1000530	50 %	50 %	0 %	0 %	378975562
21127	NC_016844	CAGCGC	2	12	1000537	1000548	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975562
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21135	NC_016844	GAA	2	6	1001059	1001064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975562
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21138	NC_016844	AGG	2	6	1001185	1001190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21159	NC_016844	A	7	7	1002339	1002345	100 %	0 %	0 %	0 %	378975563
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21220	NC_016844	GCA	2	6	1004589	1004594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975565
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21223	NC_016844	C	6	6	1004643	1004648	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21224	NC_016844	CGC	2	6	1004672	1004677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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21228	NC_016844	AAG	2	6	1005069	1005074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975566
21229	NC_016844	GC	3	6	1005095	1005100	0 %	0 %	50 %	50 %	378975566
21230	NC_016844	GGAA	2	8	1005105	1005112	50 %	0 %	50 %	0 %	378975566
21231	NC_016844	CACC	2	8	1005166	1005173	25 %	0 %	0 %	75 %	378975566
21232	NC_016844	AAG	2	6	1005219	1005224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975566
21233	NC_016844	GCA	2	6	1005275	1005280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975566
21234	NC_016844	A	8	8	1005305	1005312	100 %	0 %	0 %	0 %	378975566
21235	NC_016844	GCAG	2	8	1005391	1005398	25 %	0 %	50 %	25 %	378975566
21236	NC_016844	GC	3	6	1005406	1005411	0 %	0 %	50 %	50 %	378975566
21237	NC_016844	TCG	2	6	1005423	1005428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975566
21238	NC_016844	CTG	2	6	1005432	1005437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975566
21239	NC_016844	CGT	2	6	1005565	1005570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975566
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21361	NC_016844	GCA	2	6	1011542	1011547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975572
21362	NC_016844	CA	3	6	1011567	1011572	50 %	0 %	0 %	50 %	378975572
21363	NC_016844	GAG	2	6	1011611	1011616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975572
21364	NC_016844	CCG	3	9	1011660	1011668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975572
21365	NC_016844	C	6	6	1011763	1011768	0 %	0 %	0 %	100 %	378975572
21366	NC_016844	T	7	7	1011797	1011803	0 %	100 %	0 %	0 %	378975572
21367	NC_016844	GTA	2	6	1011863	1011868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975572
21368	NC_016844	CTA	2	6	1011915	1011920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975572
21369	NC_016844	GCT	2	6	1011976	1011981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975572
21370	NC_016844	GCGT	2	8	1012142	1012149	0 %	25 %	50 %	25 %	378975573
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21372	NC_016844	ACCT	2	8	1012219	1012226	25 %	25 %	0 %	50 %	378975573
21373	NC_016844	GC	3	6	1012260	1012265	0 %	0 %	50 %	50 %	378975573
21374	NC_016844	GC	3	6	1012270	1012275	0 %	0 %	50 %	50 %	378975573
21375	NC_016844	GC	3	6	1012310	1012315	0 %	0 %	50 %	50 %	378975573
21376	NC_016844	CTT	2	6	1012342	1012347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975573
21377	NC_016844	CCT	2	6	1012357	1012362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975573
21378	NC_016844	GCA	2	6	1012416	1012421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975573
21379	NC_016844	CA	4	8	1012470	1012477	50 %	0 %	0 %	50 %	378975573
21380	NC_016844	TGC	2	6	1012487	1012492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975573
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21382	NC_016844	GC	3	6	1012666	1012671	0 %	0 %	50 %	50 %	378975573
21383	NC_016844	AT	3	6	1012673	1012678	50 %	50 %	0 %	0 %	378975573
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21389	NC_016844	CGT	2	6	1013070	1013075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975573
21390	NC_016844	CGC	2	6	1013112	1013117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975573
21391	NC_016844	A	6	6	1013142	1013147	100 %	0 %	0 %	0 %	378975573
21392	NC_016844	AAG	2	6	1013411	1013416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975573
21393	NC_016844	CA	4	8	1013435	1013442	50 %	0 %	0 %	50 %	378975573
21394	NC_016844	CGCA	2	8	1013447	1013454	25 %	0 %	25 %	50 %	378975573
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21397	NC_016844	CA	4	8	1013518	1013525	50 %	0 %	0 %	50 %	378975573
21398	NC_016844	GC	3	6	1013607	1013612	0 %	0 %	50 %	50 %	378975573
21399	NC_016844	CAC	2	6	1013640	1013645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975573
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21401	NC_016844	GC	3	6	1013727	1013732	0 %	0 %	50 %	50 %	378975573
21402	NC_016844	TTTC	2	8	1013781	1013788	0 %	75 %	0 %	25 %	378975573
21403	NC_016844	CTC	2	6	1013794	1013799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975573
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21406	NC_016844	CGA	2	6	1013921	1013926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975574
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21430	NC_016844	A	6	6	1015206	1015211	100 %	0 %	0 %	0 %	378975574
21431	NC_016844	CAA	2	6	1015289	1015294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975574
21432	NC_016844	CA	3	6	1015351	1015356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21433	NC_016844	TAA	2	6	1015488	1015493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975575
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21438	NC_016844	AGC	2	6	1015620	1015625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975575
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21442	NC_016844	CG	4	8	1015843	1015850	0 %	0 %	50 %	50 %	378975575
21443	NC_016844	GAAG	2	8	1015884	1015891	50 %	0 %	50 %	0 %	378975575
21444	NC_016844	GCT	2	6	1016041	1016046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975575
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21449	NC_016844	CT	3	6	1016249	1016254	0 %	50 %	0 %	50 %	378975575
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21453	NC_016844	CATA	2	8	1016454	1016461	50 %	25 %	0 %	25 %	378975575
21454	NC_016844	GAC	2	6	1016518	1016523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975575
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21461	NC_016844	GC	3	6	1016915	1016920	0 %	0 %	50 %	50 %	378975575
21462	NC_016844	ACGCA	2	10	1016937	1016946	40 %	0 %	20 %	40 %	378975575
21463	NC_016844	A	8	8	1016946	1016953	100 %	0 %	0 %	0 %	378975575
21464	NC_016844	GAA	2	6	1016992	1016997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975575
21465	NC_016844	CGCA	2	8	1017002	1017009	25 %	0 %	25 %	50 %	378975575
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21468	NC_016844	AGA	2	6	1017139	1017144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975576
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21471	NC_016844	GC	3	6	1017286	1017291	0 %	0 %	50 %	50 %	378975577
21472	NC_016844	T	8	8	1017355	1017362	0 %	100 %	0 %	0 %	378975577
21473	NC_016844	TAC	2	6	1017413	1017418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975577
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21475	NC_016844	CGC	2	6	1017529	1017534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975577
21476	NC_016844	T	8	8	1017561	1017568	0 %	100 %	0 %	0 %	378975577
21477	NC_016844	AGT	2	6	1017585	1017590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975577
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