MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_016844	GCC	2	6	901163	901168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975470
19002	NC_016844	CA	3	6	901175	901180	50 %	0 %	0 %	50 %	378975470
19003	NC_016844	CCTCA	2	10	901193	901202	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
19004	NC_016844	GAAC	2	8	901216	901223	50 %	0 %	25 %	25 %	378975471
19005	NC_016844	TCAA	2	8	901286	901293	50 %	25 %	0 %	25 %	378975471
19006	NC_016844	ACC	2	6	901337	901342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975471
19007	NC_016844	CTC	2	6	901393	901398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975471
19008	NC_016844	CTT	2	6	901422	901427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975471
19009	NC_016844	GC	3	6	901517	901522	0 %	0 %	50 %	50 %	378975471
19010	NC_016844	CCT	2	6	901569	901574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975471
19011	NC_016844	TGT	2	6	901634	901639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975471
19012	NC_016844	AGCCG	2	10	901780	901789	20 %	0 %	40 %	40 %	378975471
19013	NC_016844	ACG	2	6	901798	901803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975471
19014	NC_016844	AC	3	6	901869	901874	50 %	0 %	0 %	50 %	378975471
19015	NC_016844	TCT	2	6	901885	901890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975471
19016	NC_016844	GAAA	2	8	901896	901903	75 %	0 %	25 %	0 %	378975471
19017	NC_016844	TGA	2	6	901951	901956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975471
19018	NC_016844	TGC	2	6	902019	902024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975471
19019	NC_016844	AC	3	6	902025	902030	50 %	0 %	0 %	50 %	378975471
19020	NC_016844	A	6	6	902051	902056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19021	NC_016844	AGC	2	6	902077	902082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19022	NC_016844	CG	3	6	902163	902168	0 %	0 %	50 %	50 %	378975472
19023	NC_016844	CTG	2	6	902170	902175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975472
19024	NC_016844	TATCAG	2	12	902250	902261	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975472
19025	NC_016844	CCT	2	6	902266	902271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975472
19026	NC_016844	TTC	2	6	902284	902289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975472
19027	NC_016844	TAC	2	6	902421	902426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975472
19028	NC_016844	GCG	2	6	902432	902437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975472
19029	NC_016844	CG	3	6	902440	902445	0 %	0 %	50 %	50 %	378975472
19030	NC_016844	AC	4	8	902518	902525	50 %	0 %	0 %	50 %	378975472
19031	NC_016844	GCG	2	6	902528	902533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975472
19032	NC_016844	GCG	2	6	902548	902553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975472
19033	NC_016844	CG	3	6	902615	902620	0 %	0 %	50 %	50 %	378975472
19034	NC_016844	CGTG	2	8	902653	902660	0 %	25 %	50 %	25 %	378975472
19035	NC_016844	AAC	2	6	902678	902683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975472
19036	NC_016844	GC	3	6	902687	902692	0 %	0 %	50 %	50 %	378975472
19037	NC_016844	TCG	2	6	902746	902751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975472
19038	NC_016844	ACA	2	6	902781	902786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975472
19039	NC_016844	GACAC	2	10	902797	902806	40 %	0 %	20 %	40 %	378975472
19040	NC_016844	ACT	2	6	902873	902878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975473
19041	NC_016844	CAC	2	6	902901	902906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975473
19042	NC_016844	T	6	6	902910	902915	0 %	100 %	0 %	0 %	378975473
19043	NC_016844	CG	3	6	902919	902924	0 %	0 %	50 %	50 %	378975473
19044	NC_016844	CCGTC	2	10	902933	902942	0 %	20 %	20 %	60 %	378975473
19045	NC_016844	CTC	2	6	903008	903013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975473
19046	NC_016844	GTA	2	6	903046	903051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975473
19047	NC_016844	ACAA	2	8	903067	903074	75 %	0 %	0 %	25 %	378975473
19048	NC_016844	CCG	2	6	903151	903156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975473
19049	NC_016844	CG	4	8	903162	903169	0 %	0 %	50 %	50 %	378975473
19050	NC_016844	AATT	2	8	903248	903255	50 %	50 %	0 %	0 %	378975473
19051	NC_016844	CGC	2	6	903316	903321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975473
19052	NC_016844	AAG	2	6	903388	903393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975473
19053	NC_016844	T	6	6	903419	903424	0 %	100 %	0 %	0 %	378975473
19054	NC_016844	CAA	2	6	903506	903511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975473
19055	NC_016844	ATC	2	6	903525	903530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975473
19056	NC_016844	GCC	2	6	903531	903536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975473
19057	NC_016844	A	6	6	903574	903579	100 %	0 %	0 %	0 %	378975473
19058	NC_016844	GAAAG	2	10	903614	903623	60 %	0 %	40 %	0 %	378975473
19059	NC_016844	CCAA	2	8	903725	903732	50 %	0 %	0 %	50 %	378975473
19060	NC_016844	ATT	2	6	903738	903743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975473
19061	NC_016844	GAAA	2	8	903772	903779	75 %	0 %	25 %	0 %	378975473
19062	NC_016844	CG	3	6	903877	903882	0 %	0 %	50 %	50 %	378975473
19063	NC_016844	CA	3	6	903923	903928	50 %	0 %	0 %	50 %	378975473
19064	NC_016844	ACT	2	6	903972	903977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975473
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19068	NC_016844	TGC	2	6	904355	904360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975474
19069	NC_016844	CCA	2	6	904411	904416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975474
19070	NC_016844	GTT	2	6	904475	904480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975474
19071	NC_016844	T	6	6	904539	904544	0 %	100 %	0 %	0 %	378975474
19072	NC_016844	GCG	2	6	904750	904755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975474
19073	NC_016844	CG	3	6	904771	904776	0 %	0 %	50 %	50 %	378975474
19074	NC_016844	CCT	2	6	904788	904793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975474
19075	NC_016844	GC	3	6	904797	904802	0 %	0 %	50 %	50 %	378975474
19076	NC_016844	CGC	2	6	904805	904810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975474
19077	NC_016844	ACTG	2	8	904815	904822	25 %	25 %	25 %	25 %	378975474
19078	NC_016844	CATA	2	8	904861	904868	50 %	25 %	0 %	25 %	378975474
19079	NC_016844	CTG	2	6	904871	904876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975474
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19081	NC_016844	CCTG	2	8	905208	905215	0 %	25 %	25 %	50 %	378975474
19082	NC_016844	GCA	2	6	905221	905226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975474
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19084	NC_016844	TCC	2	6	905381	905386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975474
19085	NC_016844	AATCC	2	10	905420	905429	40 %	20 %	0 %	40 %	378975474
19086	NC_016844	TCA	2	6	905512	905517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975474
19087	NC_016844	GCA	2	6	905560	905565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975474
19088	NC_016844	ATC	2	6	905592	905597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975474
19089	NC_016844	CAC	2	6	905678	905683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975474
19090	NC_016844	GAC	2	6	905711	905716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975474
19091	NC_016844	CG	3	6	905737	905742	0 %	0 %	50 %	50 %	378975474
19092	NC_016844	GCG	2	6	905758	905763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975474
19093	NC_016844	TCT	2	6	905778	905783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975474
19094	NC_016844	GAT	2	6	905830	905835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975474
19095	NC_016844	GCG	2	6	905857	905862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975474
19096	NC_016844	CTGCGC	2	12	905893	905904	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975474
19097	NC_016844	CTA	2	6	905905	905910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975474
19098	NC_016844	CCAA	2	8	906018	906025	50 %	0 %	0 %	50 %	378975474
19099	NC_016844	CACG	2	8	906082	906089	25 %	0 %	25 %	50 %	378975474
19100	NC_016844	GCA	3	9	906109	906117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975474
19101	NC_016844	GCA	2	6	906123	906128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975474
19102	NC_016844	CCTGC	2	10	906133	906142	0 %	20 %	20 %	60 %	378975474
19103	NC_016844	T	6	6	906180	906185	0 %	100 %	0 %	0 %	378975474
19104	NC_016844	GCG	2	6	906259	906264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975474
19105	NC_016844	CCA	2	6	906351	906356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975474
19106	NC_016844	GCA	2	6	906369	906374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975474
19107	NC_016844	GCA	2	6	906381	906386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975474
19108	NC_016844	AGA	2	6	906395	906400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975474
19109	NC_016844	CTG	2	6	906402	906407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975474
19110	NC_016844	GCG	2	6	906421	906426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975474
19111	NC_016844	GCAC	2	8	906501	906508	25 %	0 %	25 %	50 %	378975474
19112	NC_016844	CCA	2	6	906697	906702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975474
19113	NC_016844	GCG	2	6	906706	906711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975474
19114	NC_016844	AG	3	6	906752	906757	50 %	0 %	50 %	0 %	378975474
19115	NC_016844	CGT	2	6	906778	906783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975474
19116	NC_016844	CG	3	6	906880	906885	0 %	0 %	50 %	50 %	378975474
19117	NC_016844	GAG	2	6	906916	906921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975474
19118	NC_016844	GTA	2	6	906933	906938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975474
19119	NC_016844	CA	3	6	906987	906992	50 %	0 %	0 %	50 %	378975474
19120	NC_016844	ATGC	2	8	907010	907017	25 %	25 %	25 %	25 %	378975474
19121	NC_016844	TCC	2	6	907024	907029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19122	NC_016844	GT	4	8	907054	907061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19123	NC_016844	CTG	2	6	907171	907176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975475
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19491	NC_016844	CTTCTG	3	18	925905	925922	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378975493
19492	NC_016844	CCA	2	6	925941	925946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975493
19493	NC_016844	CCT	2	6	925974	925979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975493
19494	NC_016844	ACA	2	6	926051	926056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975493
19495	NC_016844	CTG	2	6	926086	926091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975493
19496	NC_016844	GCG	2	6	926152	926157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975493
19497	NC_016844	CCG	2	6	926313	926318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975493
19498	NC_016844	A	7	7	926342	926348	100 %	0 %	0 %	0 %	378975493
19499	NC_016844	ACA	2	6	926382	926387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975493
19500	NC_016844	T	6	6	926402	926407	0 %	100 %	0 %	0 %	378975493

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