MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

< Previous12...3233343536373839404142...4849Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_016844	TGTC	2	8	852552	852559	0 %	50 %	25 %	25 %	378975419
18003	NC_016844	CTT	2	6	852560	852565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975419
18004	NC_016844	CTC	2	6	852631	852636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975420
18005	NC_016844	CCT	2	6	852654	852659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975420
18006	NC_016844	TGC	2	6	852667	852672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975420
18007	NC_016844	CAG	2	6	852678	852683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975420
18008	NC_016844	AC	3	6	852722	852727	50 %	0 %	0 %	50 %	378975420
18009	NC_016844	ACA	2	6	852764	852769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975421
18010	NC_016844	CAC	2	6	852817	852822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975421
18011	NC_016844	ACG	2	6	852863	852868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975421
18012	NC_016844	ACTG	2	8	852913	852920	25 %	25 %	25 %	25 %	378975421
18013	NC_016844	CTT	2	6	852960	852965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975421
18014	NC_016844	TGT	2	6	853077	853082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975421
18015	NC_016844	GGTT	2	8	853089	853096	0 %	50 %	50 %	0 %	378975421
18016	NC_016844	GCAC	2	8	853108	853115	25 %	0 %	25 %	50 %	378975421
18017	NC_016844	CG	3	6	853180	853185	0 %	0 %	50 %	50 %	378975421
18018	NC_016844	CGC	2	6	853194	853199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975421
18019	NC_016844	CG	3	6	853221	853226	0 %	0 %	50 %	50 %	378975422
18020	NC_016844	CTT	2	6	853256	853261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975422
18021	NC_016844	CG	3	6	853319	853324	0 %	0 %	50 %	50 %	378975422
18022	NC_016844	T	6	6	853338	853343	0 %	100 %	0 %	0 %	378975422
18023	NC_016844	CG	3	6	853403	853408	0 %	0 %	50 %	50 %	378975422
18024	NC_016844	CGA	2	6	853460	853465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975422
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18027	NC_016844	TAC	2	6	853565	853570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975422
18028	NC_016844	ACT	2	6	853574	853579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975422
18029	NC_016844	TGC	2	6	853583	853588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975422
18030	NC_016844	A	7	7	853648	853654	100 %	0 %	0 %	0 %	378975422
18031	NC_016844	TACC	2	8	853688	853695	25 %	25 %	0 %	50 %	378975422
18032	NC_016844	GTAT	2	8	853723	853730	25 %	50 %	25 %	0 %	378975422
18033	NC_016844	AAC	2	6	853888	853893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975422
18034	NC_016844	CG	3	6	853924	853929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18035	NC_016844	CAGAGA	2	12	853971	853982	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18036	NC_016844	A	7	7	853986	853992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18037	NC_016844	GAAT	2	8	854002	854009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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18040	NC_016844	GC	5	10	854242	854251	0 %	0 %	50 %	50 %	378975423
18041	NC_016844	GC	3	6	854317	854322	0 %	0 %	50 %	50 %	378975423
18042	NC_016844	GCT	2	6	854380	854385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975423
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18044	NC_016844	TGA	2	6	854503	854508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975423
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18046	NC_016844	ACGT	2	8	854607	854614	25 %	25 %	25 %	25 %	378975423
18047	NC_016844	GTA	2	6	854690	854695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975423
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18049	NC_016844	ACG	2	6	854863	854868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975424
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18052	NC_016844	CA	3	6	854939	854944	50 %	0 %	0 %	50 %	378975424
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18054	NC_016844	CA	3	6	855056	855061	50 %	0 %	0 %	50 %	378975424
18055	NC_016844	GCA	2	6	855062	855067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975424
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18057	NC_016844	CCG	2	6	855119	855124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975424
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18059	NC_016844	GC	3	6	855240	855245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18060	NC_016844	GTTTT	2	10	855308	855317	0 %	80 %	20 %	0 %	378975425
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18062	NC_016844	CGG	2	6	855385	855390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975425
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18085	NC_016844	GCAC	2	8	856496	856503	25 %	0 %	25 %	50 %	378975426
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18094	NC_016844	ACAG	2	8	857149	857156	50 %	0 %	25 %	25 %	378975427
18095	NC_016844	GCCC	2	8	857173	857180	0 %	0 %	25 %	75 %	378975427
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18098	NC_016844	CGC	2	6	857244	857249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975427
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18103	NC_016844	AGCG	2	8	857404	857411	25 %	0 %	50 %	25 %	378975427
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18106	NC_016844	A	6	6	857450	857455	100 %	0 %	0 %	0 %	378975427
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18112	NC_016844	ATA	2	6	857769	857774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975427
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18232	NC_016844	TGC	2	6	863240	863245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975431
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18235	NC_016844	G	6	6	863394	863399	0 %	0 %	100 %	0 %	378975431
18236	NC_016844	TGA	3	9	863525	863533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975431
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18239	NC_016844	A	6	6	863803	863808	100 %	0 %	0 %	0 %	378975431
18240	NC_016844	CTC	2	6	863825	863830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18241	NC_016844	GCGCT	2	10	863893	863902	0 %	20 %	40 %	40 %	378975432
18242	NC_016844	CGCA	2	8	863941	863948	25 %	0 %	25 %	50 %	378975432
18243	NC_016844	CA	4	8	863954	863961	50 %	0 %	0 %	50 %	378975432
18244	NC_016844	ATG	2	6	863964	863969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975432
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18247	NC_016844	CACG	2	8	864050	864057	25 %	0 %	25 %	50 %	378975433
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18493	NC_016844	CGC	2	6	875637	875642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975443
18494	NC_016844	CAGA	2	8	875657	875664	50 %	0 %	25 %	25 %	378975443
18495	NC_016844	CACG	2	8	875694	875701	25 %	0 %	25 %	50 %	378975443
18496	NC_016844	CGTT	2	8	875717	875724	0 %	50 %	25 %	25 %	378975443
18497	NC_016844	CAG	2	6	875769	875774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975443
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18499	NC_016844	GAC	2	6	875868	875873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975443
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