MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_016844	ATC	2	6	757120	757125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975321
16003	NC_016844	TCC	2	6	757261	757266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975321
16004	NC_016844	CTC	2	6	757287	757292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975321
16005	NC_016844	TAA	2	6	757320	757325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975321
16006	NC_016844	ATC	2	6	757357	757362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975321
16007	NC_016844	A	8	8	757401	757408	100 %	0 %	0 %	0 %	378975321
16008	NC_016844	A	6	6	757479	757484	100 %	0 %	0 %	0 %	378975321
16009	NC_016844	CA	3	6	757542	757547	50 %	0 %	0 %	50 %	378975321
16010	NC_016844	TGC	2	6	757586	757591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975321
16011	NC_016844	TCC	2	6	757612	757617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975321
16012	NC_016844	ACTTT	2	10	757635	757644	20 %	60 %	0 %	20 %	378975321
16013	NC_016844	T	6	6	757642	757647	0 %	100 %	0 %	0 %	378975321
16014	NC_016844	GCA	2	6	757658	757663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975321
16015	NC_016844	A	6	6	757703	757708	100 %	0 %	0 %	0 %	378975321
16016	NC_016844	TCG	2	6	757712	757717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975321
16017	NC_016844	AATC	2	8	757791	757798	50 %	25 %	0 %	25 %	378975321
16018	NC_016844	TCA	2	6	757835	757840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975321
16019	NC_016844	GAA	2	6	757841	757846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975321
16020	NC_016844	T	6	6	757858	757863	0 %	100 %	0 %	0 %	378975321
16021	NC_016844	GGA	3	9	758087	758095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975322
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16023	NC_016844	TACA	2	8	758172	758179	50 %	25 %	0 %	25 %	378975322
16024	NC_016844	AG	3	6	758291	758296	50 %	0 %	50 %	0 %	378975322
16025	NC_016844	CTTC	2	8	758300	758307	0 %	50 %	0 %	50 %	378975322
16026	NC_016844	CAA	2	6	758308	758313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975322
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16029	NC_016844	TACAA	2	10	758417	758426	60 %	20 %	0 %	20 %	378975322
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16032	NC_016844	GTA	2	6	758576	758581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975322
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16034	NC_016844	TCA	2	6	758628	758633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975322
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16039	NC_016844	CTC	2	6	758832	758837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975322
16040	NC_016844	TTA	2	6	758846	758851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975322
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16042	NC_016844	TCT	2	6	758906	758911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975322
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16053	NC_016844	ATTTA	2	10	759420	759429	40 %	60 %	0 %	0 %	378975323
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16055	NC_016844	T	10	10	759569	759578	0 %	100 %	0 %	0 %	378975323
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16057	NC_016844	AC	3	6	759659	759664	50 %	0 %	0 %	50 %	378975323
16058	NC_016844	AT	3	6	759749	759754	50 %	50 %	0 %	0 %	378975323
16059	NC_016844	TAC	2	6	759762	759767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975323
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16061	NC_016844	CGG	3	9	759806	759814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975323
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16090	NC_016844	CCTTA	2	10	761119	761128	20 %	40 %	0 %	40 %	378975325
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16106	NC_016844	TTC	2	6	761839	761844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975325
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16109	NC_016844	CA	3	6	761945	761950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16110	NC_016844	GCT	2	6	762003	762008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16111	NC_016844	CGG	2	6	762035	762040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16112	NC_016844	ACA	2	6	762056	762061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_016844	TTC	2	6	762072	762077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_016844	CA	3	6	762292	762297	50 %	0 %	0 %	50 %	378975326
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16120	NC_016844	CCTG	2	8	762587	762594	0 %	25 %	25 %	50 %	378975326
16121	NC_016844	AC	3	6	762639	762644	50 %	0 %	0 %	50 %	378975326
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16236	NC_016844	GAAA	2	8	768187	768194	75 %	0 %	25 %	0 %	378975331
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16241	NC_016844	C	6	6	768328	768333	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16242	NC_016844	A	6	6	768341	768346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16244	NC_016844	CG	3	6	768376	768381	0 %	0 %	50 %	50 %	378975332
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16246	NC_016844	A	6	6	768471	768476	100 %	0 %	0 %	0 %	378975332
16247	NC_016844	GCG	2	6	768482	768487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975332
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16496	NC_016844	CAT	2	6	781612	781617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975345
16497	NC_016844	CAA	2	6	781627	781632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975345
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