MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15005	NC_016844	TGC	2	6	706556	706561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975275
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15059	NC_016844	CTG	2	6	709911	709916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975279
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15112	NC_016844	GC	3	6	712740	712745	0 %	0 %	50 %	50 %	378975281
15113	NC_016844	CG	3	6	712782	712787	0 %	0 %	50 %	50 %	378975281
15114	NC_016844	TCT	2	6	712869	712874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975281
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15120	NC_016844	ACGT	2	8	713232	713239	25 %	25 %	25 %	25 %	378975281
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15125	NC_016844	AAG	2	6	713611	713616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975281
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15127	NC_016844	CTT	2	6	713632	713637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975281
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15241	NC_016844	CAT	2	6	720105	720110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975287
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15243	NC_016844	GGC	2	6	720195	720200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975287
15244	NC_016844	CAT	2	6	720255	720260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975287
15245	NC_016844	TCA	2	6	720317	720322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975287
15246	NC_016844	CCA	2	6	720347	720352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975287
15247	NC_016844	TC	3	6	720392	720397	0 %	50 %	0 %	50 %	378975287
15248	NC_016844	ATC	2	6	720400	720405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975287
15249	NC_016844	ATG	2	6	720424	720429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975287
15250	NC_016844	CCT	2	6	720453	720458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975287
15251	NC_016844	ACT	2	6	720495	720500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975287
15252	NC_016844	TG	3	6	720543	720548	0 %	50 %	50 %	0 %	378975288
15253	NC_016844	TTCT	2	8	720562	720569	0 %	75 %	0 %	25 %	378975288
15254	NC_016844	TC	3	6	720578	720583	0 %	50 %	0 %	50 %	378975288
15255	NC_016844	CCTGTA	2	12	720623	720634	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975288
15256	NC_016844	TAC	2	6	720645	720650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975288
15257	NC_016844	AAC	2	6	720679	720684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975288
15258	NC_016844	ATG	2	6	720706	720711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975288
15259	NC_016844	CAT	2	6	720800	720805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975288
15260	NC_016844	A	6	6	720826	720831	100 %	0 %	0 %	0 %	378975288
15261	NC_016844	AG	3	6	720869	720874	50 %	0 %	50 %	0 %	378975288
15262	NC_016844	TAT	2	6	720924	720929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975288
15263	NC_016844	GGCA	2	8	720938	720945	25 %	0 %	50 %	25 %	378975288
15264	NC_016844	A	6	6	720957	720962	100 %	0 %	0 %	0 %	378975288
15265	NC_016844	CG	3	6	720977	720982	0 %	0 %	50 %	50 %	378975288
15266	NC_016844	TCT	2	6	720994	720999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975288
15267	NC_016844	CGTAT	2	10	721015	721024	20 %	40 %	20 %	20 %	378975288
15268	NC_016844	ATG	2	6	721029	721034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975288
15269	NC_016844	TGC	2	6	721058	721063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975288
15270	NC_016844	A	6	6	721094	721099	100 %	0 %	0 %	0 %	378975288
15271	NC_016844	GCAG	2	8	721115	721122	25 %	0 %	50 %	25 %	378975288
15272	NC_016844	CGGA	2	8	721171	721178	25 %	0 %	50 %	25 %	378975288
15273	NC_016844	TGT	2	6	721208	721213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975288
15274	NC_016844	CTT	2	6	721235	721240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975288
15275	NC_016844	CTT	2	6	721277	721282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975288
15276	NC_016844	CTT	2	6	721376	721381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975288
15277	NC_016844	GCA	2	6	721452	721457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975288
15278	NC_016844	AGA	3	9	721462	721470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975288
15279	NC_016844	TAC	2	6	721476	721481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975288
15280	NC_016844	CGAG	2	8	721496	721503	25 %	0 %	50 %	25 %	378975288
15281	NC_016844	GCA	2	6	721527	721532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975288
15282	NC_016844	TC	4	8	721691	721698	0 %	50 %	0 %	50 %	378975289
15283	NC_016844	CGC	2	6	721772	721777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975289
15284	NC_016844	AAT	2	6	721785	721790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975289
15285	NC_016844	CTT	2	6	721866	721871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975290
15286	NC_016844	CGA	2	6	721885	721890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975290
15287	NC_016844	GGA	2	6	722004	722009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975290
15288	NC_016844	GAA	2	6	722046	722051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975290
15289	NC_016844	CAA	2	6	722066	722071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975290
15290	NC_016844	CTGCA	2	10	722177	722186	20 %	20 %	20 %	40 %	378975290
15291	NC_016844	GAT	2	6	722203	722208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975290
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15293	NC_016844	AAT	2	6	722326	722331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975291
15294	NC_016844	CTG	2	6	722671	722676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975291
15295	NC_016844	CGG	2	6	722687	722692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975291
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15297	NC_016844	CTG	2	6	722921	722926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975291
15298	NC_016844	GC	4	8	722937	722944	0 %	0 %	50 %	50 %	378975291
15299	NC_016844	GAG	2	6	722952	722957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975291
15300	NC_016844	AGA	2	6	722958	722963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975291
15301	NC_016844	TGG	2	6	723000	723005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975291
15302	NC_016844	TGCATT	2	12	723179	723190	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378975291
15303	NC_016844	T	8	8	723232	723239	0 %	100 %	0 %	0 %	378975291
15304	NC_016844	TAC	2	6	723299	723304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975291
15305	NC_016844	TC	3	6	723368	723373	0 %	50 %	0 %	50 %	378975291
15306	NC_016844	GAC	2	6	723396	723401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975291
15307	NC_016844	AGCG	2	8	723425	723432	25 %	0 %	50 %	25 %	378975291
15308	NC_016844	ATC	2	6	723434	723439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975291
15309	NC_016844	GCT	2	6	723445	723450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975291
15310	NC_016844	CTGT	2	8	723525	723532	0 %	50 %	25 %	25 %	378975291
15311	NC_016844	TG	3	6	723541	723546	0 %	50 %	50 %	0 %	378975291
15312	NC_016844	TCC	2	6	723568	723573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975291
15313	NC_016844	TGA	2	6	723619	723624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975292
15314	NC_016844	CCG	2	6	723646	723651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975292
15315	NC_016844	TAA	2	6	723691	723696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975292
15316	NC_016844	TCA	2	6	723711	723716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975292
15317	NC_016844	TGT	2	6	723821	723826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975292
15318	NC_016844	A	6	6	723836	723841	100 %	0 %	0 %	0 %	378975292
15319	NC_016844	GT	3	6	723852	723857	0 %	50 %	50 %	0 %	378975292
15320	NC_016844	GCC	2	6	723906	723911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975292
15321	NC_016844	ACAGC	2	10	723979	723988	40 %	0 %	20 %	40 %	378975292
15322	NC_016844	TCCA	2	8	723999	724006	25 %	25 %	0 %	50 %	378975292
15323	NC_016844	CCTG	2	8	724047	724054	0 %	25 %	25 %	50 %	378975292
15324	NC_016844	CT	3	6	724078	724083	0 %	50 %	0 %	50 %	378975292
15325	NC_016844	TGC	2	6	724112	724117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975292
15326	NC_016844	TCC	2	6	724155	724160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975292
15327	NC_016844	TGAT	2	8	724266	724273	25 %	50 %	25 %	0 %	378975292
15328	NC_016844	CCA	2	6	724279	724284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975292
15329	NC_016844	CCA	2	6	724291	724296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975292
15330	NC_016844	GGC	2	6	724304	724309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975292
15331	NC_016844	GAA	2	6	724419	724424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975292
15332	NC_016844	CCCATC	2	12	724433	724444	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	378975292
15333	NC_016844	TTG	2	6	724467	724472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975292
15334	NC_016844	A	7	7	724490	724496	100 %	0 %	0 %	0 %	378975292
15335	NC_016844	CAC	2	6	724679	724684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975292
15336	NC_016844	GTT	2	6	724704	724709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975292
15337	NC_016844	CTCATC	2	12	724784	724795	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378975292
15338	NC_016844	CCA	2	6	724837	724842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975292
15339	NC_016844	TGA	3	9	725010	725018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975292
15340	NC_016844	ACAG	2	8	725085	725092	50 %	0 %	25 %	25 %	378975292
15341	NC_016844	GCCA	2	8	725098	725105	25 %	0 %	25 %	50 %	378975292
15342	NC_016844	TCC	2	6	725142	725147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975292
15343	NC_016844	GTCT	2	8	725213	725220	0 %	50 %	25 %	25 %	378975292
15344	NC_016844	GAG	2	6	725240	725245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975292
15345	NC_016844	CG	3	6	725259	725264	0 %	0 %	50 %	50 %	378975292
15346	NC_016844	CGAA	2	8	725341	725348	50 %	0 %	25 %	25 %	378975292
15347	NC_016844	GGC	2	6	725365	725370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975292
15348	NC_016844	GAA	2	6	725385	725390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975292
15349	NC_016844	GCA	2	6	725510	725515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15350	NC_016844	CCTC	2	8	725529	725536	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15351	NC_016844	CTC	2	6	725562	725567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15352	NC_016844	AAGAC	2	10	725601	725610	60 %	0 %	20 %	20 %	378975293
15353	NC_016844	CTG	2	6	725660	725665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975293
15354	NC_016844	CG	3	6	725706	725711	0 %	0 %	50 %	50 %	378975293
15355	NC_016844	T	6	6	725745	725750	0 %	100 %	0 %	0 %	378975293
15356	NC_016844	AG	3	6	725782	725787	50 %	0 %	50 %	0 %	378975293
15357	NC_016844	CGA	2	6	725788	725793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975293
15358	NC_016844	CG	3	6	725816	725821	0 %	0 %	50 %	50 %	378975293
15359	NC_016844	AAG	2	6	725835	725840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975293
15360	NC_016844	CACG	2	8	725970	725977	25 %	0 %	25 %	50 %	378975293
15361	NC_016844	AC	3	6	725995	726000	50 %	0 %	0 %	50 %	378975293
15362	NC_016844	CAA	2	6	726025	726030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975293
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15364	NC_016844	CCTGC	2	10	726061	726070	0 %	20 %	20 %	60 %	378975293
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15487	NC_016844	A	7	7	731997	732003	100 %	0 %	0 %	0 %	378975300
15488	NC_016844	CG	3	6	732016	732021	0 %	0 %	50 %	50 %	378975300
15489	NC_016844	AC	3	6	732037	732042	50 %	0 %	0 %	50 %	378975300
15490	NC_016844	CAT	2	6	732126	732131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975300
15491	NC_016844	A	6	6	732135	732140	100 %	0 %	0 %	0 %	378975300
15492	NC_016844	CAGCAA	2	12	732234	732245	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378975300
15493	NC_016844	CAGCAT	2	12	732246	732257	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975300
15494	NC_016844	GCA	2	6	732260	732265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975300
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15497	NC_016844	AAT	2	6	732514	732519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975300
15498	NC_016844	TAGA	2	8	732530	732537	50 %	25 %	25 %	0 %	378975300
15499	NC_016844	GCAC	2	8	732550	732557	25 %	0 %	25 %	50 %	378975301
15500	NC_016844	TGC	2	6	732597	732602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975301

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