MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_016844	CCTGA	2	10	659970	659979	20 %	20 %	20 %	40 %	378975239
14002	NC_016844	CAC	2	6	660021	660026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975239
14003	NC_016844	TCC	2	6	660038	660043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14004	NC_016844	AG	3	6	660046	660051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_016844	TC	3	6	660070	660075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14006	NC_016844	CAC	2	6	660079	660084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14007	NC_016844	CA	3	6	660135	660140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14008	NC_016844	GCA	2	6	660211	660216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_016844	CCGC	2	8	660376	660383	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14010	NC_016844	CAG	2	6	660391	660396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_016844	GCC	2	6	660404	660409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975240
14012	NC_016844	CAC	2	6	660425	660430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975240
14013	NC_016844	GC	3	6	660436	660441	0 %	0 %	50 %	50 %	378975240
14014	NC_016844	GC	3	6	660444	660449	0 %	0 %	50 %	50 %	378975240
14015	NC_016844	CCA	2	6	660496	660501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975240
14016	NC_016844	GC	3	6	660504	660509	0 %	0 %	50 %	50 %	378975240
14017	NC_016844	GA	3	6	660563	660568	50 %	0 %	50 %	0 %	378975240
14018	NC_016844	CCG	2	6	660667	660672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975240
14019	NC_016844	CAC	2	6	660677	660682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975240
14020	NC_016844	CA	3	6	660700	660705	50 %	0 %	0 %	50 %	378975240
14021	NC_016844	CAG	2	6	660832	660837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975240
14022	NC_016844	CCT	2	6	660856	660861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975240
14023	NC_016844	TCA	2	6	660867	660872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975240
14024	NC_016844	CCT	2	6	660895	660900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975240
14025	NC_016844	CAC	2	6	660962	660967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975240
14026	NC_016844	TCA	2	6	661003	661008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975240
14027	NC_016844	CTG	2	6	661058	661063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975240
14028	NC_016844	CAAAAG	2	12	661081	661092	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378975240
14029	NC_016844	AAG	3	9	661107	661115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975240
14030	NC_016844	GCT	2	6	661117	661122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975240
14031	NC_016844	TCC	2	6	661135	661140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14032	NC_016844	GCACG	2	10	661184	661193	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14033	NC_016844	CG	3	6	661192	661197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14034	NC_016844	CAC	2	6	661221	661226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14035	NC_016844	AC	3	6	661264	661269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14036	NC_016844	CG	3	6	661336	661341	0 %	0 %	50 %	50 %	378975241
14037	NC_016844	AGA	2	6	661416	661421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975241
14038	NC_016844	CTC	2	6	661436	661441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975241
14039	NC_016844	AG	3	6	661446	661451	50 %	0 %	50 %	0 %	378975241
14040	NC_016844	ACG	2	6	661471	661476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14041	NC_016844	GCG	2	6	661510	661515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14042	NC_016844	GCT	2	6	661558	661563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_016844	GTGC	2	8	661606	661613	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14044	NC_016844	C	6	6	661648	661653	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14045	NC_016844	TCC	2	6	661841	661846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14046	NC_016844	CGCT	2	8	661856	661863	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14047	NC_016844	TAC	2	6	661881	661886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14048	NC_016844	TCCCC	2	10	661919	661928	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
14049	NC_016844	GC	3	6	661953	661958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14050	NC_016844	CTG	2	6	661988	661993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14051	NC_016844	AGA	2	6	662009	662014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_016844	TGCG	2	8	662036	662043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14053	NC_016844	GC	5	10	662055	662064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14054	NC_016844	CA	3	6	662155	662160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14055	NC_016844	ACT	2	6	662212	662217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14056	NC_016844	GC	3	6	662236	662241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14057	NC_016844	GGCA	2	8	662262	662269	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14058	NC_016844	GAC	2	6	662293	662298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14059	NC_016844	T	6	6	662299	662304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_016844	GC	3	6	662314	662319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14061	NC_016844	GCC	2	6	662420	662425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14062	NC_016844	TGG	2	6	662444	662449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_016844	ACTG	2	8	662476	662483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14064	NC_016844	GCA	2	6	662524	662529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_016844	GC	3	6	662540	662545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14066	NC_016844	CCTT	2	8	662555	662562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14067	NC_016844	GC	3	6	662568	662573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14068	NC_016844	GCA	2	6	662577	662582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14069	NC_016844	GC	3	6	662591	662596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14070	NC_016844	AC	3	6	662603	662608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14071	NC_016844	CG	3	6	662616	662621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14072	NC_016844	GC	3	6	662629	662634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14073	NC_016844	CG	3	6	662689	662694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14074	NC_016844	ACT	2	6	662730	662735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14075	NC_016844	T	6	6	662801	662806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_016844	AGA	2	6	662810	662815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_016844	TGC	2	6	663094	663099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14078	NC_016844	CGC	2	6	663151	663156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14079	NC_016844	CGG	2	6	663246	663251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975242
14080	NC_016844	ACGC	2	8	663254	663261	25 %	0 %	25 %	50 %	378975242
14081	NC_016844	CGG	2	6	663274	663279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975242
14082	NC_016844	CTC	2	6	663287	663292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975242
14083	NC_016844	CAG	2	6	663316	663321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975242
14084	NC_016844	GTCAG	2	10	663330	663339	20 %	20 %	40 %	20 %	378975242
14085	NC_016844	CTC	2	6	663354	663359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975242
14086	NC_016844	GTC	2	6	663365	663370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975242
14087	NC_016844	GCA	2	6	663372	663377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975242
14088	NC_016844	TG	3	6	663382	663387	0 %	50 %	50 %	0 %	378975242
14089	NC_016844	CGC	2	6	663418	663423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975242
14090	NC_016844	CCG	2	6	663486	663491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975242
14091	NC_016844	GCC	2	6	663500	663505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975242
14092	NC_016844	CGA	2	6	663524	663529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975242
14093	NC_016844	AGA	2	6	663584	663589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975242
14094	NC_016844	GC	3	6	663606	663611	0 %	0 %	50 %	50 %	378975242
14095	NC_016844	CA	3	6	663644	663649	50 %	0 %	0 %	50 %	378975242
14096	NC_016844	TG	3	6	663652	663657	0 %	50 %	50 %	0 %	378975242
14097	NC_016844	GTT	2	6	663668	663673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975242
14098	NC_016844	GC	3	6	663695	663700	0 %	0 %	50 %	50 %	378975242
14099	NC_016844	AGA	2	6	663803	663808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975242
14100	NC_016844	AGG	2	6	663931	663936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975242
14101	NC_016844	CGG	2	6	663965	663970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975242
14102	NC_016844	CTTT	2	8	664028	664035	0 %	75 %	0 %	25 %	378975242
14103	NC_016844	CTGCTC	2	12	664072	664083	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975242
14104	NC_016844	GCG	2	6	664095	664100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975242
14105	NC_016844	GACGC	2	10	664137	664146	20 %	0 %	40 %	40 %	378975242
14106	NC_016844	CAGC	2	8	664192	664199	25 %	0 %	25 %	50 %	378975242
14107	NC_016844	GC	4	8	664282	664289	0 %	0 %	50 %	50 %	378975242
14108	NC_016844	CTC	2	6	664300	664305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975242
14109	NC_016844	GGT	2	6	664319	664324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975242
14110	NC_016844	A	6	6	664402	664407	100 %	0 %	0 %	0 %	378975242
14111	NC_016844	AGTT	2	8	664577	664584	25 %	50 %	25 %	0 %	378975242
14112	NC_016844	CTTG	2	8	664592	664599	0 %	50 %	25 %	25 %	378975242
14113	NC_016844	CAA	2	6	664623	664628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975242
14114	NC_016844	GCG	2	6	664687	664692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975242
14115	NC_016844	CA	4	8	664754	664761	50 %	0 %	0 %	50 %	378975242
14116	NC_016844	CGG	3	9	664766	664774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975242
14117	NC_016844	AC	3	6	664812	664817	50 %	0 %	0 %	50 %	378975242
14118	NC_016844	TAC	2	6	664902	664907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975242
14119	NC_016844	TC	3	6	664909	664914	0 %	50 %	0 %	50 %	378975242
14120	NC_016844	GT	3	6	664921	664926	0 %	50 %	50 %	0 %	378975242
14121	NC_016844	GC	3	6	664977	664982	0 %	0 %	50 %	50 %	378975242
14122	NC_016844	CAC	2	6	665039	665044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975242
14123	NC_016844	CT	3	6	665121	665126	0 %	50 %	0 %	50 %	378975242
14124	NC_016844	TTA	2	6	665194	665199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975242
14125	NC_016844	ACAT	2	8	665349	665356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14126	NC_016844	CTC	2	6	665415	665420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975243
14127	NC_016844	ATTT	2	8	665592	665599	25 %	75 %	0 %	0 %	378975243
14128	NC_016844	ACG	2	6	665617	665622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975243
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14130	NC_016844	CGG	2	6	665643	665648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975243
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14136	NC_016844	GA	3	6	665848	665853	50 %	0 %	50 %	0 %	378975243
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14247	NC_016844	TGAC	2	8	671180	671187	25 %	25 %	25 %	25 %	378975248
14248	NC_016844	ATTTT	2	10	671195	671204	20 %	80 %	0 %	0 %	378975248
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14495	NC_016844	A	6	6	682595	682600	100 %	0 %	0 %	0 %	378975257
14496	NC_016844	GCAG	2	8	682610	682617	25 %	0 %	50 %	25 %	378975257
14497	NC_016844	GCCT	2	8	682623	682630	0 %	25 %	25 %	50 %	378975257
14498	NC_016844	CTA	2	6	682636	682641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975257
14499	NC_016844	AAG	2	6	682734	682739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975257
14500	NC_016844	CA	3	6	682786	682791	50 %	0 %	0 %	50 %	378975257

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