MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_016844	A	10	10	637262	637271	100 %	0 %	0 %	0 %	378975221
13502	NC_016844	CGC	2	6	637280	637285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975221
13503	NC_016844	GAAA	2	8	637297	637304	75 %	0 %	25 %	0 %	378975221
13504	NC_016844	CG	3	6	637361	637366	0 %	0 %	50 %	50 %	378975221
13505	NC_016844	GCT	2	6	637380	637385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975221
13506	NC_016844	TTTC	2	8	637512	637519	0 %	75 %	0 %	25 %	378975221
13507	NC_016844	GAATG	2	10	637582	637591	40 %	20 %	40 %	0 %	378975221
13508	NC_016844	T	6	6	637605	637610	0 %	100 %	0 %	0 %	378975221
13509	NC_016844	CAG	2	6	637727	637732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975221
13510	NC_016844	TTCA	2	8	637738	637745	25 %	50 %	0 %	25 %	378975221
13511	NC_016844	CAC	2	6	637756	637761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975221
13512	NC_016844	CCACC	2	10	637776	637785	20 %	0 %	0 %	80 %	378975221
13513	NC_016844	CG	3	6	637812	637817	0 %	0 %	50 %	50 %	378975221
13514	NC_016844	CA	3	6	637835	637840	50 %	0 %	0 %	50 %	378975221
13515	NC_016844	ACA	2	6	637878	637883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975221
13516	NC_016844	GTG	2	6	637900	637905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975221
13517	NC_016844	GC	3	6	637987	637992	0 %	0 %	50 %	50 %	378975221
13518	NC_016844	GGA	2	6	638178	638183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975221
13519	NC_016844	CG	3	6	638190	638195	0 %	0 %	50 %	50 %	378975221
13520	NC_016844	TATT	2	8	638197	638204	25 %	75 %	0 %	0 %	378975221
13521	NC_016844	GTA	2	6	638254	638259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975221
13522	NC_016844	GC	4	8	638275	638282	0 %	0 %	50 %	50 %	378975221
13523	NC_016844	CG	3	6	638284	638289	0 %	0 %	50 %	50 %	378975221
13524	NC_016844	CTC	2	6	638330	638335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975221
13525	NC_016844	AC	3	6	638557	638562	50 %	0 %	0 %	50 %	378975221
13526	NC_016844	CTG	2	6	638596	638601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975221
13527	NC_016844	TCG	2	6	638631	638636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975221
13528	NC_016844	CTT	2	6	638644	638649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975221
13529	NC_016844	GCAG	2	8	638652	638659	25 %	0 %	50 %	25 %	378975221
13530	NC_016844	TGCA	2	8	638705	638712	25 %	25 %	25 %	25 %	378975221
13531	NC_016844	GCG	2	6	638727	638732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975221
13532	NC_016844	AAG	2	6	638795	638800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975221
13533	NC_016844	A	6	6	638942	638947	100 %	0 %	0 %	0 %	378975222
13534	NC_016844	TG	3	6	638981	638986	0 %	50 %	50 %	0 %	378975222
13535	NC_016844	GCG	2	6	639013	639018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975222
13536	NC_016844	GGT	2	6	639125	639130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975222
13537	NC_016844	CG	3	6	639210	639215	0 %	0 %	50 %	50 %	378975222
13538	NC_016844	CAGA	2	8	639247	639254	50 %	0 %	25 %	25 %	378975222
13539	NC_016844	GAA	2	6	639425	639430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975222
13540	NC_016844	TGC	2	6	639443	639448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975222
13541	NC_016844	GTG	2	6	639477	639482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975222
13542	NC_016844	ATTGG	2	10	639582	639591	20 %	40 %	40 %	0 %	378975222
13543	NC_016844	GCG	2	6	639600	639605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975222
13544	NC_016844	AC	3	6	639758	639763	50 %	0 %	0 %	50 %	378975222
13545	NC_016844	GCA	2	6	639800	639805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975222
13546	NC_016844	A	6	6	639805	639810	100 %	0 %	0 %	0 %	378975222
13547	NC_016844	CAATC	2	10	639877	639886	40 %	20 %	0 %	40 %	378975222
13548	NC_016844	GTG	2	6	640022	640027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975222
13549	NC_016844	GTC	2	6	640112	640117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975222
13550	NC_016844	CG	3	6	640153	640158	0 %	0 %	50 %	50 %	378975222
13551	NC_016844	TTG	2	6	640167	640172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975222
13552	NC_016844	TCCT	2	8	640282	640289	0 %	50 %	0 %	50 %	378975222
13553	NC_016844	CCG	2	6	640341	640346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975222
13554	NC_016844	GC	3	6	640388	640393	0 %	0 %	50 %	50 %	378975222
13555	NC_016844	AAAC	2	8	640443	640450	75 %	0 %	0 %	25 %	378975222
13556	NC_016844	CTG	2	6	640474	640479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975222
13557	NC_016844	GGT	2	6	640571	640576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975222
13558	NC_016844	CGT	2	6	640695	640700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975222
13559	NC_016844	GC	3	6	640722	640727	0 %	0 %	50 %	50 %	378975222
13560	NC_016844	ACG	2	6	640737	640742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975222
13561	NC_016844	GTC	2	6	640838	640843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975222
13562	NC_016844	TGA	2	6	640849	640854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975222
13563	NC_016844	A	6	6	640971	640976	100 %	0 %	0 %	0 %	378975222
13564	NC_016844	GGC	2	6	640999	641004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975222
13565	NC_016844	GCC	2	6	641038	641043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975222
13566	NC_016844	GCAC	2	8	641053	641060	25 %	0 %	25 %	50 %	378975222
13567	NC_016844	GCA	2	6	641073	641078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975222
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13569	NC_016844	TCAG	2	8	641160	641167	25 %	25 %	25 %	25 %	378975222
13570	NC_016844	ATG	2	6	641168	641173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975222
13571	NC_016844	GGA	2	6	641205	641210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975222
13572	NC_016844	CT	3	6	641252	641257	0 %	50 %	0 %	50 %	378975222
13573	NC_016844	CAC	2	6	641265	641270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975222
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13576	NC_016844	GCACAC	2	12	641302	641313	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378975222
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13578	NC_016844	GTG	2	6	641378	641383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975222
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13580	NC_016844	GCA	2	6	641494	641499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975222
13581	NC_016844	TG	3	6	641584	641589	0 %	50 %	50 %	0 %	378975223
13582	NC_016844	GTCT	2	8	641678	641685	0 %	50 %	25 %	25 %	378975223
13583	NC_016844	GC	3	6	641739	641744	0 %	0 %	50 %	50 %	378975223
13584	NC_016844	TCC	2	6	641811	641816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975223
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13587	NC_016844	TG	3	6	641984	641989	0 %	50 %	50 %	0 %	378975223
13588	NC_016844	GCG	2	6	642023	642028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975223
13589	NC_016844	A	8	8	642038	642045	100 %	0 %	0 %	0 %	378975223
13590	NC_016844	GTT	2	6	642083	642088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975223
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13592	NC_016844	AAG	2	6	642101	642106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975223
13593	NC_016844	CCT	2	6	642118	642123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975223
13594	NC_016844	A	9	9	642146	642154	100 %	0 %	0 %	0 %	378975223
13595	NC_016844	T	6	6	642173	642178	0 %	100 %	0 %	0 %	378975223
13596	NC_016844	AAC	2	6	642186	642191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975223
13597	NC_016844	A	6	6	642196	642201	100 %	0 %	0 %	0 %	378975223
13598	NC_016844	GC	3	6	642285	642290	0 %	0 %	50 %	50 %	378975223
13599	NC_016844	GCC	2	6	642293	642298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975223
13600	NC_016844	CTT	2	6	642338	642343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975223
13601	NC_016844	CG	3	6	642483	642488	0 %	0 %	50 %	50 %	378975223
13602	NC_016844	CCT	2	6	642493	642498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975223
13603	NC_016844	GCA	2	6	642690	642695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975224
13604	NC_016844	CAAC	2	8	642715	642722	50 %	0 %	0 %	50 %	378975224
13605	NC_016844	AGCCAT	2	12	642746	642757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975224
13606	NC_016844	ATA	2	6	642765	642770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975224
13607	NC_016844	TTCC	2	8	642914	642921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13608	NC_016844	T	6	6	642940	642945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_016844	ATC	2	6	642961	642966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975225
13610	NC_016844	ATA	2	6	642973	642978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975225
13611	NC_016844	TGC	2	6	642988	642993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975225
13612	NC_016844	AGC	2	6	643075	643080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975225
13613	NC_016844	GAT	2	6	643090	643095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975225
13614	NC_016844	TTCC	2	8	643103	643110	0 %	50 %	0 %	50 %	378975225
13615	NC_016844	TAG	2	6	643155	643160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975225
13616	NC_016844	GAA	2	6	643199	643204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975225
13617	NC_016844	ACC	2	6	643223	643228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975225
13618	NC_016844	TTTC	2	8	643236	643243	0 %	75 %	0 %	25 %	378975225
13619	NC_016844	TGA	2	6	643284	643289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975225
13620	NC_016844	C	6	6	643335	643340	0 %	0 %	0 %	100 %	378975225
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13622	NC_016844	CAA	2	6	643392	643397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975225
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13992	NC_016844	AG	3	6	659643	659648	50 %	0 %	50 %	0 %	378975239
13993	NC_016844	TCT	2	6	659684	659689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975239
13994	NC_016844	TGG	2	6	659714	659719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975239
13995	NC_016844	GCC	2	6	659736	659741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975239
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13997	NC_016844	TGC	2	6	659800	659805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975239
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13999	NC_016844	CAAA	2	8	659825	659832	75 %	0 %	0 %	25 %	378975239
14000	NC_016844	ATG	2	6	659911	659916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975239

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