MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016844	GT	3	6	613811	613816	0 %	50 %	50 %	0 %	378975201
13002	NC_016844	T	8	8	613848	613855	0 %	100 %	0 %	0 %	378975201
13003	NC_016844	GCAC	2	8	613869	613876	25 %	0 %	25 %	50 %	378975201
13004	NC_016844	CTT	2	6	613898	613903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975201
13005	NC_016844	CGTG	2	8	613941	613948	0 %	25 %	50 %	25 %	378975201
13006	NC_016844	GGA	2	6	614003	614008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975201
13007	NC_016844	CTGT	2	8	614026	614033	0 %	50 %	25 %	25 %	378975201
13008	NC_016844	T	6	6	614046	614051	0 %	100 %	0 %	0 %	378975201
13009	NC_016844	CAG	2	6	614073	614078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975201
13010	NC_016844	TCT	2	6	614109	614114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975201
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13012	NC_016844	ATG	2	6	614156	614161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975201
13013	NC_016844	TCT	2	6	614164	614169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975201
13014	NC_016844	CCTT	2	8	614178	614185	0 %	50 %	0 %	50 %	378975201
13015	NC_016844	CCA	2	6	614230	614235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975201
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13017	NC_016844	CT	3	6	614289	614294	0 %	50 %	0 %	50 %	378975201
13018	NC_016844	T	6	6	614294	614299	0 %	100 %	0 %	0 %	378975201
13019	NC_016844	ACTG	2	8	614368	614375	25 %	25 %	25 %	25 %	378975201
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13022	NC_016844	CGG	2	6	614544	614549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975201
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13031	NC_016844	CGTG	2	8	615104	615111	0 %	25 %	50 %	25 %	378975202
13032	NC_016844	ACT	2	6	615202	615207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975202
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13034	NC_016844	TG	3	6	615297	615302	0 %	50 %	50 %	0 %	378975202
13035	NC_016844	AAT	2	6	615306	615311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975202
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13037	NC_016844	T	6	6	615329	615334	0 %	100 %	0 %	0 %	378975202
13038	NC_016844	CG	3	6	615342	615347	0 %	0 %	50 %	50 %	378975202
13039	NC_016844	CA	4	8	615369	615376	50 %	0 %	0 %	50 %	378975202
13040	NC_016844	CAT	2	6	615389	615394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975202
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13042	NC_016844	TTG	2	6	615450	615455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975202
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13054	NC_016844	TTA	2	6	616063	616068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975202
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13070	NC_016844	TGA	2	6	616878	616883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975203
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13072	NC_016844	AGAA	2	8	616951	616958	75 %	0 %	25 %	0 %	378975203
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13087	NC_016844	A	7	7	617610	617616	100 %	0 %	0 %	0 %	378975203
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13091	NC_016844	CCA	2	6	617773	617778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975204
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13094	NC_016844	CAA	2	6	617905	617910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975204
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13096	NC_016844	TCCTTT	2	12	617985	617996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975204
13097	NC_016844	CAG	2	6	618091	618096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975204
13098	NC_016844	CTCC	2	8	618106	618113	0 %	25 %	0 %	75 %	378975204
13099	NC_016844	AAT	2	6	618178	618183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975204
13100	NC_016844	AGC	2	6	618228	618233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975204
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13102	NC_016844	CT	3	6	618315	618320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13103	NC_016844	CCA	2	6	618340	618345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13104	NC_016844	CTG	2	6	618377	618382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975205
13105	NC_016844	ATT	2	6	618491	618496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975205
13106	NC_016844	C	6	6	618507	618512	0 %	0 %	0 %	100 %	378975205
13107	NC_016844	CCG	2	6	618529	618534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975205
13108	NC_016844	TCA	2	6	618556	618561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975205
13109	NC_016844	TAC	2	6	618599	618604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975205
13110	NC_016844	CAA	2	6	618691	618696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975205
13111	NC_016844	CTG	2	6	618736	618741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975205
13112	NC_016844	CTG	2	6	618749	618754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975205
13113	NC_016844	GCA	2	6	618834	618839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975205
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13115	NC_016844	CAC	2	6	618932	618937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975205
13116	NC_016844	CTC	2	6	618989	618994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13117	NC_016844	GC	3	6	619135	619140	0 %	0 %	50 %	50 %	378975206
13118	NC_016844	TACA	2	8	619170	619177	50 %	25 %	0 %	25 %	378975206
13119	NC_016844	CGC	3	9	619335	619343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975206
13120	NC_016844	TCC	2	6	619348	619353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975206
13121	NC_016844	TCCC	2	8	619356	619363	0 %	25 %	0 %	75 %	378975206
13122	NC_016844	TCCT	2	8	619365	619372	0 %	50 %	0 %	50 %	378975206
13123	NC_016844	CA	4	8	619375	619382	50 %	0 %	0 %	50 %	378975206
13124	NC_016844	ACC	2	6	619408	619413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975206
13125	NC_016844	AGCC	2	8	619445	619452	25 %	0 %	25 %	50 %	378975206
13126	NC_016844	CGC	2	6	619503	619508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975206
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13128	NC_016844	A	7	7	619517	619523	100 %	0 %	0 %	0 %	378975206
13129	NC_016844	GGA	2	6	619525	619530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975206
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13131	NC_016844	ACCC	2	8	619629	619636	25 %	0 %	0 %	75 %	378975206
13132	NC_016844	GC	3	6	619731	619736	0 %	0 %	50 %	50 %	378975206
13133	NC_016844	GGT	2	6	619830	619835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975206
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13135	NC_016844	AAT	2	6	619864	619869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975206
13136	NC_016844	A	6	6	619870	619875	100 %	0 %	0 %	0 %	378975206
13137	NC_016844	CG	4	8	619879	619886	0 %	0 %	50 %	50 %	378975206
13138	NC_016844	TGC	2	6	619893	619898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975206
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13148	NC_016844	CTG	2	6	620317	620322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975206
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13159	NC_016844	A	7	7	620568	620574	100 %	0 %	0 %	0 %	378975206
13160	NC_016844	ATGCA	2	10	620619	620628	40 %	20 %	20 %	20 %	378975206
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13168	NC_016844	GC	3	6	620800	620805	0 %	0 %	50 %	50 %	378975206
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13171	NC_016844	CTG	2	6	620952	620957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975206
13172	NC_016844	CGCC	2	8	621080	621087	0 %	0 %	25 %	75 %	378975206
13173	NC_016844	CAC	3	9	621186	621194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975206
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13175	NC_016844	CATC	2	8	621338	621345	25 %	25 %	0 %	50 %	378975206
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13186	NC_016844	TGC	2	6	621775	621780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975207
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13189	NC_016844	A	7	7	621835	621841	100 %	0 %	0 %	0 %	378975207
13190	NC_016844	AC	3	6	621844	621849	50 %	0 %	0 %	50 %	378975207
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13194	NC_016844	GCA	2	6	622091	622096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975207
13195	NC_016844	AGTCC	2	10	622106	622115	20 %	20 %	20 %	40 %	378975207
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13197	NC_016844	TCC	3	9	622159	622167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975207
13198	NC_016844	GC	3	6	622190	622195	0 %	0 %	50 %	50 %	378975207
13199	NC_016844	GA	3	6	622261	622266	50 %	0 %	50 %	0 %	378975207
13200	NC_016844	CA	3	6	622318	622323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13201	NC_016844	GCA	2	6	622344	622349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975208
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13203	NC_016844	GC	3	6	622539	622544	0 %	0 %	50 %	50 %	378975208
13204	NC_016844	CAA	2	6	622571	622576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975208
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13206	NC_016844	CACC	2	8	622654	622661	25 %	0 %	0 %	75 %	378975208
13207	NC_016844	TCA	2	6	622821	622826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975208
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13210	NC_016844	ACAA	2	8	622972	622979	75 %	0 %	0 %	25 %	378975208
13211	NC_016844	CCG	2	6	622990	622995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975208
13212	NC_016844	CTT	2	6	622998	623003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13213	NC_016844	CGGTTG	2	12	623011	623022	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378975209
13214	NC_016844	ATT	2	6	623048	623053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975209
13215	NC_016844	CTCA	2	8	623074	623081	25 %	25 %	0 %	50 %	378975209
13216	NC_016844	GCC	2	6	623117	623122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975209
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13221	NC_016844	CCG	2	6	623391	623396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975209
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13225	NC_016844	CGGT	2	8	623523	623530	0 %	25 %	50 %	25 %	378975209
13226	NC_016844	AGG	2	6	623531	623536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975209
13227	NC_016844	AAAGG	2	10	623539	623548	60 %	0 %	40 %	0 %	378975209
13228	NC_016844	TCA	2	6	623658	623663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975209
13229	NC_016844	CGC	2	6	623788	623793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975209
13230	NC_016844	CGCA	2	8	623809	623816	25 %	0 %	25 %	50 %	378975209
13231	NC_016844	GCT	2	6	623829	623834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975209
13232	NC_016844	TTC	2	6	623846	623851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975209
13233	NC_016844	CACG	2	8	623925	623932	25 %	0 %	25 %	50 %	378975209
13234	NC_016844	AC	3	6	623987	623992	50 %	0 %	0 %	50 %	378975209
13235	NC_016844	CAGA	2	8	624008	624015	50 %	0 %	25 %	25 %	378975209
13236	NC_016844	GC	3	6	624042	624047	0 %	0 %	50 %	50 %	378975209
13237	NC_016844	CTC	2	6	624096	624101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13238	NC_016844	AC	3	6	624175	624180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13239	NC_016844	CGCA	2	8	624218	624225	25 %	0 %	25 %	50 %	378975210
13240	NC_016844	AACCT	2	10	624243	624252	40 %	20 %	0 %	40 %	378975210
13241	NC_016844	AG	3	6	624287	624292	50 %	0 %	50 %	0 %	378975210
13242	NC_016844	GCA	2	6	624363	624368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975210
13243	NC_016844	TCCGCG	2	12	624381	624392	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975210
13244	NC_016844	GAAG	2	8	624451	624458	50 %	0 %	50 %	0 %	378975210
13245	NC_016844	GTA	2	6	624509	624514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975210
13246	NC_016844	CCA	2	6	624590	624595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975210
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13490	NC_016844	GT	3	6	636872	636877	0 %	50 %	50 %	0 %	378975220
13491	NC_016844	AGC	2	6	636946	636951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975220
13492	NC_016844	TGA	2	6	637016	637021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975220
13493	NC_016844	TAC	2	6	637023	637028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975220
13494	NC_016844	GC	3	6	637049	637054	0 %	0 %	50 %	50 %	378975220
13495	NC_016844	CAC	2	6	637091	637096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975220
13496	NC_016844	CGC	2	6	637204	637209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975221
13497	NC_016844	GTA	2	6	637222	637227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975221
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13499	NC_016844	CT	3	6	637247	637252	0 %	50 %	0 %	50 %	378975221
13500	NC_016844	TTCC	2	8	637253	637260	0 %	50 %	0 %	50 %	378975221

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