MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_016844	CGTG	2	8	544379	544386	0 %	25 %	50 %	25 %	378975140
11503	NC_016844	G	6	6	544427	544432	0 %	0 %	100 %	0 %	378975141
11504	NC_016844	T	6	6	544453	544458	0 %	100 %	0 %	0 %	378975141
11505	NC_016844	TTG	2	6	544464	544469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975141
11506	NC_016844	TAT	2	6	544478	544483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975141
11507	NC_016844	GGCGG	2	10	544596	544605	0 %	0 %	80 %	20 %	378975141
11508	NC_016844	TACGA	2	10	544626	544635	40 %	20 %	20 %	20 %	378975141
11509	NC_016844	GCA	2	6	544637	544642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975141
11510	NC_016844	GCA	2	6	544692	544697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975141
11511	NC_016844	AGG	2	6	544709	544714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975141
11512	NC_016844	TCT	2	6	544743	544748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975141
11513	NC_016844	TGA	2	6	544753	544758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975141
11514	NC_016844	GGCA	2	8	544786	544793	25 %	0 %	50 %	25 %	378975141
11515	NC_016844	TG	3	6	544799	544804	0 %	50 %	50 %	0 %	378975141
11516	NC_016844	GGA	2	6	544892	544897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975141
11517	NC_016844	TTC	2	6	544911	544916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975141
11518	NC_016844	GCT	2	6	545009	545014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975142
11519	NC_016844	A	7	7	545025	545031	100 %	0 %	0 %	0 %	378975142
11520	NC_016844	ATT	2	6	545081	545086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975142
11521	NC_016844	AGGT	2	8	545268	545275	25 %	25 %	50 %	0 %	378975142
11522	NC_016844	ATTG	2	8	545295	545302	25 %	50 %	25 %	0 %	378975142
11523	NC_016844	TGC	2	6	545315	545320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975142
11524	NC_016844	CTA	2	6	545405	545410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975142
11525	NC_016844	TTA	2	6	545455	545460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975142
11526	NC_016844	TGA	2	6	545520	545525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975142
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11529	NC_016844	G	6	6	545646	545651	0 %	0 %	100 %	0 %	378975142
11530	NC_016844	TGG	2	6	545712	545717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975142
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11533	NC_016844	GAT	2	6	545842	545847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975142
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11535	NC_016844	TGA	2	6	546015	546020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975142
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11538	NC_016844	GAA	2	6	546162	546167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975142
11539	NC_016844	TGGTG	2	10	546226	546235	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_016844	ACTTT	2	10	546258	546267	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11541	NC_016844	GTTT	2	8	546273	546280	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_016844	G	6	6	546376	546381	0 %	0 %	100 %	0 %	378975143
11543	NC_016844	TG	3	6	546459	546464	0 %	50 %	50 %	0 %	378975143
11544	NC_016844	CG	4	8	546486	546493	0 %	0 %	50 %	50 %	378975143
11545	NC_016844	GACA	2	8	546579	546586	50 %	0 %	25 %	25 %	378975143
11546	NC_016844	GAT	2	6	546609	546614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975143
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11548	NC_016844	TCAG	2	8	546780	546787	25 %	25 %	25 %	25 %	378975143
11549	NC_016844	GC	3	6	546902	546907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11550	NC_016844	TGC	2	6	546940	546945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_016844	TG	3	6	546952	546957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_016844	GCA	2	6	546993	546998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_016844	A	6	6	547049	547054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_016844	CCA	2	6	547131	547136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975144
11555	NC_016844	CTTC	2	8	547155	547162	0 %	50 %	0 %	50 %	378975144
11556	NC_016844	CG	3	6	547248	547253	0 %	0 %	50 %	50 %	378975144
11557	NC_016844	CCG	2	6	547265	547270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975144
11558	NC_016844	CTG	2	6	547297	547302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975144
11559	NC_016844	CA	3	6	547329	547334	50 %	0 %	0 %	50 %	378975144
11560	NC_016844	TAA	2	6	547404	547409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975144
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11562	NC_016844	CA	3	6	547716	547721	50 %	0 %	0 %	50 %	378975144
11563	NC_016844	GCT	2	6	547809	547814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975144
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11569	NC_016844	TCT	2	6	548162	548167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975144
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11580	NC_016844	GC	3	6	548879	548884	0 %	0 %	50 %	50 %	378975144
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11589	NC_016844	GC	3	6	549231	549236	0 %	0 %	50 %	50 %	378975145
11590	NC_016844	TCTG	2	8	549246	549253	0 %	50 %	25 %	25 %	378975145
11591	NC_016844	GTG	2	6	549320	549325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975145
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11593	NC_016844	ACC	2	6	549362	549367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975145
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11598	NC_016844	CCT	2	6	549671	549676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975146
11599	NC_016844	CGTG	2	8	549689	549696	0 %	25 %	50 %	25 %	378975146
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11606	NC_016844	GCT	2	6	550137	550142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975146
11607	NC_016844	TGA	2	6	550163	550168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975146
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11609	NC_016844	GGA	2	6	550247	550252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975146
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11613	NC_016844	AAG	2	6	550407	550412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975146
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11621	NC_016844	GCG	2	6	550755	550760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975146
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11623	NC_016844	A	7	7	550841	550847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11991	NC_016844	TCTTTT	2	12	568364	568375	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378975157
11992	NC_016844	T	6	6	568372	568377	0 %	100 %	0 %	0 %	378975157
11993	NC_016844	AT	3	6	568379	568384	50 %	50 %	0 %	0 %	378975157
11994	NC_016844	TCC	2	6	568394	568399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975157
11995	NC_016844	GCGT	2	8	568428	568435	0 %	25 %	50 %	25 %	378975157
11996	NC_016844	TGC	2	6	568436	568441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975157
11997	NC_016844	TCT	2	6	568442	568447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975157
11998	NC_016844	TCT	2	6	568526	568531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975157
11999	NC_016844	ACTGC	2	10	568635	568644	20 %	20 %	20 %	40 %	378975157
12000	NC_016844	TCT	2	6	568740	568745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975157

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