MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_016844	CACG	2	8	497710	497717	25 %	0 %	25 %	50 %	378975105
10503	NC_016844	A	6	6	497808	497813	100 %	0 %	0 %	0 %	378975105
10504	NC_016844	CGC	2	6	497844	497849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975105
10505	NC_016844	GTT	2	6	497971	497976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975105
10506	NC_016844	GTC	2	6	497979	497984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975105
10507	NC_016844	CTTC	2	8	498056	498063	0 %	50 %	0 %	50 %	378975105
10508	NC_016844	CTG	2	6	498167	498172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975105
10509	NC_016844	AC	3	6	498218	498223	50 %	0 %	0 %	50 %	378975105
10510	NC_016844	CGT	2	6	498244	498249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975105
10511	NC_016844	GTG	2	6	498288	498293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975105
10512	NC_016844	GC	3	6	498319	498324	0 %	0 %	50 %	50 %	378975105
10513	NC_016844	CGGGG	2	10	498403	498412	0 %	0 %	80 %	20 %	378975105
10514	NC_016844	CG	3	6	498421	498426	0 %	0 %	50 %	50 %	378975105
10515	NC_016844	CT	3	6	498459	498464	0 %	50 %	0 %	50 %	378975105
10516	NC_016844	CTC	2	6	498504	498509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975105
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10519	NC_016844	GCA	2	6	498602	498607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975105
10520	NC_016844	CCAG	2	8	498620	498627	25 %	0 %	25 %	50 %	378975105
10521	NC_016844	CTC	3	9	498651	498659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975105
10522	NC_016844	GC	3	6	498694	498699	0 %	0 %	50 %	50 %	378975105
10523	NC_016844	ACC	2	6	498700	498705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975105
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10525	NC_016844	AAG	2	6	498741	498746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975105
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10528	NC_016844	TCC	2	6	498827	498832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10529	NC_016844	CG	3	6	498851	498856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10530	NC_016844	TCC	2	6	498857	498862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10531	NC_016844	GC	4	8	498879	498886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10532	NC_016844	CCT	2	6	498906	498911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10542	NC_016844	CCT	2	6	499026	499031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10555	NC_016844	TCC	2	6	499187	499192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10556	NC_016844	CCT	2	6	499194	499199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10557	NC_016844	TCC	2	6	499211	499216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10558	NC_016844	CCT	2	6	499218	499223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10560	NC_016844	CCT	2	6	499242	499247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10585	NC_016844	TCC	2	6	499547	499552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10589	NC_016844	TCC	2	6	499595	499600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10590	NC_016844	CCT	2	6	499602	499607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10591	NC_016844	AGG	2	6	499762	499767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_016844	GAGGGC	2	12	499780	499791	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10593	NC_016844	TGG	2	6	499891	499896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_016844	CTGT	2	8	499932	499939	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10595	NC_016844	TGC	2	6	499963	499968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10596	NC_016844	TGCTG	2	10	499988	499997	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10597	NC_016844	CTG	2	6	500020	500025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10598	NC_016844	CTG	2	6	500029	500034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10599	NC_016844	AAGGA	2	10	500036	500045	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_016844	AGGA	2	8	500090	500097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_016844	GGC	2	6	500218	500223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975106
10602	NC_016844	CTG	2	6	500242	500247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975106
10603	NC_016844	GCG	2	6	500251	500256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975106
10604	NC_016844	T	7	7	500285	500291	0 %	100 %	0 %	0 %	378975106
10605	NC_016844	TGG	2	6	500327	500332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975106
10606	NC_016844	A	6	6	500333	500338	100 %	0 %	0 %	0 %	378975106
10607	NC_016844	GGAAG	2	10	500448	500457	40 %	0 %	60 %	0 %	378975106
10608	NC_016844	GC	3	6	500481	500486	0 %	0 %	50 %	50 %	378975106
10609	NC_016844	CAG	3	9	500490	500498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975106
10610	NC_016844	GGT	2	6	500514	500519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975106
10611	NC_016844	GAG	2	6	500578	500583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975106
10612	NC_016844	CTT	2	6	500602	500607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975106
10613	NC_016844	TGC	2	6	500742	500747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975106
10614	NC_016844	CTT	2	6	500761	500766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975106
10615	NC_016844	CT	3	6	500840	500845	0 %	50 %	0 %	50 %	378975106
10616	NC_016844	GAAA	2	8	500868	500875	75 %	0 %	25 %	0 %	378975106
10617	NC_016844	GCG	2	6	500884	500889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975106
10618	NC_016844	GAG	2	6	500916	500921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975106
10619	NC_016844	TGC	2	6	500927	500932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975106
10620	NC_016844	TTG	2	6	500996	501001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975106
10621	NC_016844	TGCGC	2	10	501012	501021	0 %	20 %	40 %	40 %	378975106
10622	NC_016844	CCT	2	6	501074	501079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975106
10623	NC_016844	A	7	7	501086	501092	100 %	0 %	0 %	0 %	378975106
10624	NC_016844	GTT	2	6	501385	501390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975106
10625	NC_016844	T	6	6	501389	501394	0 %	100 %	0 %	0 %	378975106
10626	NC_016844	GC	3	6	501429	501434	0 %	0 %	50 %	50 %	378975106
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10993	NC_016844	GAA	3	9	519696	519704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975120
10994	NC_016844	CCA	2	6	519766	519771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975120
10995	NC_016844	CG	3	6	519833	519838	0 %	0 %	50 %	50 %	378975120
10996	NC_016844	TCA	2	6	519847	519852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975120
10997	NC_016844	CTG	2	6	519908	519913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975120
10998	NC_016844	GCT	2	6	519919	519924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975120
10999	NC_016844	GC	3	6	519932	519937	0 %	0 %	50 %	50 %	378975120
11000	NC_016844	CG	3	6	519942	519947	0 %	0 %	50 %	50 %	378975120

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