MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_016844	GCG	2	6	473382	473387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975081
10003	NC_016844	GGA	2	6	473421	473426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975081
10004	NC_016844	TCG	2	6	473428	473433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975081
10005	NC_016844	TG	3	6	473440	473445	0 %	50 %	50 %	0 %	378975081
10006	NC_016844	CT	3	6	473463	473468	0 %	50 %	0 %	50 %	378975081
10007	NC_016844	CGG	2	6	473521	473526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975081
10008	NC_016844	GC	4	8	473600	473607	0 %	0 %	50 %	50 %	378975081
10009	NC_016844	GGT	2	6	473609	473614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975081
10010	NC_016844	AGA	2	6	473657	473662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975081
10011	NC_016844	TTTC	2	8	473665	473672	0 %	75 %	0 %	25 %	378975081
10012	NC_016844	GTGGA	2	10	473692	473701	20 %	20 %	60 %	0 %	378975081
10013	NC_016844	GTGC	2	8	473715	473722	0 %	25 %	50 %	25 %	378975081
10014	NC_016844	GTG	2	6	473727	473732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975081
10015	NC_016844	TGC	2	6	473758	473763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975082
10016	NC_016844	GT	3	6	473799	473804	0 %	50 %	50 %	0 %	378975082
10017	NC_016844	GGA	2	6	473900	473905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975082
10018	NC_016844	TGCG	2	8	473916	473923	0 %	25 %	50 %	25 %	378975082
10019	NC_016844	GC	4	8	474099	474106	0 %	0 %	50 %	50 %	378975082
10020	NC_016844	TTG	2	6	474120	474125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975082
10021	NC_016844	GGAC	2	8	474166	474173	25 %	0 %	50 %	25 %	378975082
10022	NC_016844	GCGT	2	8	474222	474229	0 %	25 %	50 %	25 %	378975082
10023	NC_016844	GGT	2	6	474232	474237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975082
10024	NC_016844	GTG	2	6	474302	474307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975082
10025	NC_016844	GC	3	6	474310	474315	0 %	0 %	50 %	50 %	378975082
10026	NC_016844	GCG	2	6	474320	474325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975082
10027	NC_016844	GGATG	2	10	474334	474343	20 %	20 %	60 %	0 %	378975082
10028	NC_016844	CAGT	2	8	474344	474351	25 %	25 %	25 %	25 %	378975082
10029	NC_016844	GCA	2	6	474490	474495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975082
10030	NC_016844	GCTG	2	8	474646	474653	0 %	25 %	50 %	25 %	378975082
10031	NC_016844	TGG	2	6	474688	474693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975082
10032	NC_016844	GGA	2	6	474871	474876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975082
10033	NC_016844	T	8	8	474885	474892	0 %	100 %	0 %	0 %	378975082
10034	NC_016844	ATA	2	6	474956	474961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975082
10035	NC_016844	GCG	2	6	475018	475023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975083
10036	NC_016844	TGC	2	6	475035	475040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975083
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10038	NC_016844	CGG	2	6	475192	475197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975083
10039	NC_016844	GCAC	2	8	475234	475241	25 %	0 %	25 %	50 %	378975083
10040	NC_016844	GAG	2	6	475304	475309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975083
10041	NC_016844	GCA	2	6	475482	475487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975083
10042	NC_016844	CGCT	2	8	475533	475540	0 %	25 %	25 %	50 %	378975083
10043	NC_016844	TCAG	2	8	475580	475587	25 %	25 %	25 %	25 %	378975083
10044	NC_016844	CTC	2	6	475695	475700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975083
10045	NC_016844	T	6	6	475717	475722	0 %	100 %	0 %	0 %	378975083
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10047	NC_016844	GTAC	2	8	475782	475789	25 %	25 %	25 %	25 %	378975083
10048	NC_016844	T	6	6	475863	475868	0 %	100 %	0 %	0 %	378975083
10049	NC_016844	ATTT	2	8	475910	475917	25 %	75 %	0 %	0 %	378975083
10050	NC_016844	CG	3	6	476079	476084	0 %	0 %	50 %	50 %	378975083
10051	NC_016844	TGC	2	6	476088	476093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975083
10052	NC_016844	TC	3	6	476104	476109	0 %	50 %	0 %	50 %	378975083
10053	NC_016844	GTG	2	6	476119	476124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_016844	CG	3	6	476139	476144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10055	NC_016844	GAG	2	6	476165	476170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_016844	GC	3	6	476191	476196	0 %	0 %	50 %	50 %	378975084
10057	NC_016844	TGA	2	6	476223	476228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975084
10058	NC_016844	TAT	2	6	476251	476256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975084
10059	NC_016844	CAG	2	6	476317	476322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975084
10060	NC_016844	GAA	2	6	476347	476352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975084
10061	NC_016844	ATC	2	6	476356	476361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975084
10062	NC_016844	GA	3	6	476447	476452	50 %	0 %	50 %	0 %	378975084
10063	NC_016844	GTT	2	6	476473	476478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975084
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10067	NC_016844	CGG	2	6	476565	476570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975084
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10070	NC_016844	GAG	2	6	476702	476707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975084
10071	NC_016844	GAT	2	6	476721	476726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975084
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10074	NC_016844	GAT	2	6	476800	476805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975084
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10079	NC_016844	TAT	2	6	477093	477098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975084
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10089	NC_016844	CG	3	6	477607	477612	0 %	0 %	50 %	50 %	378975085
10090	NC_016844	CTT	2	6	477616	477621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975085
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10093	NC_016844	TGC	2	6	477770	477775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975085
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10095	NC_016844	GCT	2	6	477917	477922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10099	NC_016844	ACA	2	6	477994	477999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975086
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10101	NC_016844	T	6	6	478068	478073	0 %	100 %	0 %	0 %	378975086
10102	NC_016844	TGA	2	6	478105	478110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975086
10103	NC_016844	TGGAT	2	10	478125	478134	20 %	40 %	40 %	0 %	378975086
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10105	NC_016844	TGC	2	6	478171	478176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975086
10106	NC_016844	ACG	2	6	478178	478183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975086
10107	NC_016844	ATT	2	6	478211	478216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975086
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10109	NC_016844	TG	3	6	478293	478298	0 %	50 %	50 %	0 %	378975086
10110	NC_016844	CAGA	2	8	478319	478326	50 %	0 %	25 %	25 %	378975086
10111	NC_016844	GTTT	2	8	478367	478374	0 %	75 %	25 %	0 %	378975086
10112	NC_016844	GGATC	2	10	478387	478396	20 %	20 %	40 %	20 %	378975086
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10114	NC_016844	AGT	2	6	478544	478549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975086
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10117	NC_016844	AT	3	6	478637	478642	50 %	50 %	0 %	0 %	378975086
10118	NC_016844	GT	3	6	478660	478665	0 %	50 %	50 %	0 %	378975086
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10121	NC_016844	TTC	2	6	478756	478761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975086
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10123	NC_016844	CAT	2	6	479226	479231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975086
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10241	NC_016844	TGT	2	6	485893	485898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975092
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10245	NC_016844	GCC	2	6	486105	486110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975092
10246	NC_016844	GCA	2	6	486111	486116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975092
10247	NC_016844	AGA	2	6	486199	486204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975092
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10249	NC_016844	TTC	2	6	486369	486374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975092
10250	NC_016844	GTC	2	6	486410	486415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975092
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10258	NC_016844	CGTG	2	8	486860	486867	0 %	25 %	50 %	25 %	378975093
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10279	NC_016844	CGTC	2	8	487841	487848	0 %	25 %	25 %	50 %	378975093
10280	NC_016844	CGTG	2	8	487849	487856	0 %	25 %	50 %	25 %	378975093
10281	NC_016844	CGG	2	6	487908	487913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975093
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10283	NC_016844	GTGC	2	8	487958	487965	0 %	25 %	50 %	25 %	378975093
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10289	NC_016844	TGC	2	6	488235	488240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975094
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10492	NC_016844	TGC	2	6	497310	497315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975105
10493	NC_016844	T	6	6	497357	497362	0 %	100 %	0 %	0 %	378975105
10494	NC_016844	CTG	2	6	497421	497426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975105
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