MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 24016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_016844	CG	3	6	338679	338684	0 %	0 %	50 %	50 %	378974950
7003	NC_016844	G	7	7	338742	338748	0 %	0 %	100 %	0 %	378974950
7004	NC_016844	CTC	2	6	338756	338761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974950
7005	NC_016844	GA	3	6	338823	338828	50 %	0 %	50 %	0 %	378974950
7006	NC_016844	A	6	6	338897	338902	100 %	0 %	0 %	0 %	378974950
7007	NC_016844	A	7	7	338915	338921	100 %	0 %	0 %	0 %	378974950
7008	NC_016844	GCT	2	6	338982	338987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974951
7009	NC_016844	GGT	2	6	339030	339035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974951
7010	NC_016844	GTG	2	6	339163	339168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974951
7011	NC_016844	GT	4	8	339277	339284	0 %	50 %	50 %	0 %	378974951
7012	NC_016844	CTTT	3	12	339307	339318	0 %	75 %	0 %	25 %	378974951
7013	NC_016844	GCG	2	6	339328	339333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974951
7014	NC_016844	GGA	2	6	339355	339360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974951
7015	NC_016844	GC	3	6	339387	339392	0 %	0 %	50 %	50 %	378974951
7016	NC_016844	GGT	3	9	339411	339419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974951
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7018	NC_016844	AAC	2	6	339630	339635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974951
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7021	NC_016844	GT	3	6	339758	339763	0 %	50 %	50 %	0 %	378974951
7022	NC_016844	CGGG	2	8	339789	339796	0 %	0 %	75 %	25 %	378974951
7023	NC_016844	TGG	2	6	339845	339850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974951
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7025	NC_016844	CGG	2	6	339879	339884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974951
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7031	NC_016844	TGG	2	6	340066	340071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974952
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7033	NC_016844	GAGCG	2	10	340131	340140	20 %	0 %	60 %	20 %	378974952
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7035	NC_016844	GCT	2	6	340230	340235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974952
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7037	NC_016844	GTT	2	6	340283	340288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974952
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7039	NC_016844	TG	3	6	340351	340356	0 %	50 %	50 %	0 %	378974952
7040	NC_016844	T	7	7	340372	340378	0 %	100 %	0 %	0 %	378974952
7041	NC_016844	GCA	2	6	340397	340402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974952
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7043	NC_016844	T	6	6	340448	340453	0 %	100 %	0 %	0 %	378974952
7044	NC_016844	TAG	2	6	340525	340530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974952
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7046	NC_016844	CGTG	2	8	340574	340581	0 %	25 %	50 %	25 %	378974952
7047	NC_016844	GT	3	6	340624	340629	0 %	50 %	50 %	0 %	378974952
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7050	NC_016844	GTT	2	6	340859	340864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974952
7051	NC_016844	GC	3	6	340891	340896	0 %	0 %	50 %	50 %	378974952
7052	NC_016844	TGC	2	6	340921	340926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974952
7053	NC_016844	GGC	2	6	340935	340940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974952
7054	NC_016844	GAA	2	6	341004	341009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_016844	T	6	6	341078	341083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7058	NC_016844	GTGCTC	2	12	341149	341160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974953
7059	NC_016844	GCA	2	6	341199	341204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974953
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7063	NC_016844	TGTTCG	2	12	341319	341330	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378974953
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7065	NC_016844	ACCGTC	2	12	341471	341482	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378974953
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7071	NC_016844	GTA	2	6	342212	342217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974953
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7074	NC_016844	GGA	2	6	342399	342404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974953
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7083	NC_016844	CT	4	8	343031	343038	0 %	50 %	0 %	50 %	378974953
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7091	NC_016844	TGA	2	6	343581	343586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974953
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7116	NC_016844	TTTCG	2	10	344861	344870	0 %	60 %	20 %	20 %	378974953
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7124	NC_016844	GCT	2	6	345297	345302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974953
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7126	NC_016844	CCGG	2	8	345378	345385	0 %	0 %	50 %	50 %	378974953
7127	NC_016844	T	7	7	345412	345418	0 %	100 %	0 %	0 %	378974953
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7131	NC_016844	T	6	6	345691	345696	0 %	100 %	0 %	0 %	378974954
7132	NC_016844	TCC	2	6	345919	345924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974954
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7143	NC_016844	A	7	7	346299	346305	100 %	0 %	0 %	0 %	378974954
7144	NC_016844	TGG	2	6	346345	346350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974954
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7155	NC_016844	TCG	2	6	346752	346757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974954
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7243	NC_016844	GCA	2	6	351347	351352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974956
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